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Coronavirus

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Orthocoronavirinae

SARS-CoV-2 3D virion

Les coronavirus (CoV) sont des virus qui constituent la sous-famille Orthocoronavirinae de la famille Coronaviridae. Le nom « coronavirus », du latin signifiant « virus à couronne », est dû à l'apparence des virions sous un microscope électronique, avec une frange de grandes projections bulbeuses qui évoquent une couronne solaire[2].

Les coronavirus sont munis d'une enveloppe virale incluant une capside caractérisée par des protéines en forme de massue (appelées spicules). Ils ont un génome à ARN monocaténaire (c'est-à-dire à un seul brin), de sens positif (groupe IV de la classification Baltimore), de 26 à 32 kilobases (ce qui en fait les plus grand génomes parmi les virus à ARN)[3]. Ils se classent parmi les Nidovirales, ordre de virus produisant un jeu imbriqué d'ARNm sous-génomiques lors de l'infection. Des spicules, une enveloppe, membrane et capside contribuent à la structure d'ensemble de tous les coronavirus. Ils peuvent muter et se recombiner[4].

Les chauves-souris et les oiseaux, en tant que vertébrés volants à sang chaud, seraient les hôtes idéaux pour les coronavirus assurant l'évolution et la dissémination du coronavirus[5]. Les coronavirus sont normalement spécifiques à un taxon animal comme hôte, mammifères ou oiseaux selon leur espèce ; mais ils peuvent parfois changer d'hôte à la suite d'une mutation. Leur transmission interhumaine se produit principalement par contacts étroits via des aérosols respiratoires générées par les éternuements, la toux ou la phonation. Plus de 500 types de coronavirus ont été isolées chez la chauve-souris et il existerait plus de 5 000 types de coronavirus[6].

Sept principaux coronavirus sont généralement cités comme pouvant contaminer l'humain [7]. Un huitième a été identifié : le B814[8] (le premier coronavirus humain identifié), mais cette souche semble ne plus circuler.

Quatre coronavirus en circulation sont considérés comme sources d'infection bénignes : 229E, NL63, OC43 et HKU1. Ils seraient la cause de 15 à 30 % des rhumes courants.

Plus récemment ont été identifiés trois types de coronavirus responsables de graves pneumopathies :

  1. le SARS-CoV, agent pathogène du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) en 2002-2004
  2. le MERS-CoV, celui du syndrome respiratoire du Moyen-Orient à partir de 2012
  3. le SARS-CoV-2, celui de la maladie à coronavirus 2019 (Covid-19) apparue en Chine en 2019 et responsable d'une sévère pandémie en 2020

Découverte, histoire

Illustration de la morphologie des coronavirus. Les péplomères, pointes virales en forme de massue ici colorées en rouge, créent l'apparence d'une couronne entourant le virion, lorsqu'ils sont vus au microscope électronique.

Les coronavirus existent probablement depuis au moins des centaines de millions d'années, mais du point de vue de l'épidémiologie et de l'histoire médicale et en tant que zoonose c'est au XXIe siècle qu'ils ont pris de l'importance : « cinq des sept coronavirus humains ont été isolés au cours de ce siècle. Et malheureusement, les trois derniers sont entrés dans notre vie avec les craintes liées à une épidémie, une pandémie ou à la mort »[9].

C'est en 1930 aux États-Unis que la première maladie due à un coronavirus est observée, chez des volailles. L'année suivante, un médecin décrit dans un article la maladie qui cause une détresse respiratoire chez la poule et une diminution de la ponte et de la qualité des œufs. En 1937 l'agent infectieux, le virus de la bronchite infectieuse aviaire (IBV pour Infectious Bronchitis Virus) est isolé.

En 1946, un autre coronavirus est identifié, le Coronavirus de la gastro-entérite transmissible porcine (TGEV). Indépendamment, en 1949 à New York et 1951 à Londres, deux équipes découvrent le virus de l'hépatite murine chez une souris paralysée [10].

En 1965, le premier coronavirus infectant l'être humain (la souche B814) est découvert. Et rapidement, d'autres suivent : 229E en 1966 et OC43 en 1967[11] qui tous sont la cause de rhumes plus ou moins graves selon les personnes. L'année suivante, ils sont observés au microscope électronique par June Almeida et David Tyrrell qui mettent en évidence leur structure en couronne [12]. La relation est faite entre tous ces virus, et le terme de « coronavirus » est pour la première fois utilisé dans la revue Nature en 1968[2],[10].

Épidémie du XXIe siècle

Pandémie de Coronavirus

Le dernier coronavirus humain (ou récemment humanisé, très probablement à partir d'une ou plusieurs souches portées par des chauves-souris) semble avoir émergé à Wuhan en Chine en 2019 : le SARS-CoV-2. La maladie qu'il cause (Covid-19) a provoqué en quelques mois la première grande pandémie à coronavirus, caractérisée par un R0 élevé (2,3 en moyenne d'après les estimations disponibles en avril 2020, mais qui semble pouvoir atteindre 5,7) ; avec un taux de létalité de 6,3 (très variable selon les âges et les contextes, pouvant parfois dépasser 15%)[9].

Pandémie de Coronavirus
Pandémie Date Cas confirmés Décès Guérisons Sous-type impliqué
Épidémie de SRAS de 2002-2004 2002-2004 8 096 774 - Sars-Cov (SRAS)
Coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient 2012-2014 361 107 - MERS-CoV
Pandémie de Covid-19 (En cours) 2019-2020 + 60 100 000 ()[13] + 1 400 000 ()[13] + 38 400 000 ()[13] SARS-CoV-2 (Covid-19)

Données de la pandémie de Sars-CoV-2 (2019-2020)

 voir • disc. • mod. 

Données de la pandémie de Covid-19 par pays et territoire
Lieux Confirmés Décès Rétablis % morts par
cas confirmés
Morts par
million hab.
Réf
200+ 63 236 804 1 467 987 40 528 816 [14]
Drapeau des États-Unis États-Unis[a] 13 617 362 271 296 6 594 109 1,99 % 835 [15]
Drapeau de l'Inde Inde 9 431 691 137 139 8 847 600 1,45 % 103 [16]
Drapeau du Brésil Brésil 6 336 278 173 165 5 601 804 2,73 % 824 [17],[18]
Drapeau de la Russie Russie 2 295 654 39 895 1 778 704 1,74 % 272 [19]
Drapeau de la France France[b],[c] 2 222 488 52 731 162 281 2,37 % 795 [20],[21]
Drapeau de l'Espagne Espagne 1 648 187 45 069 2,73 % 964 [22]
Drapeau du Royaume-Uni Royaume-Uni[d] 1 629 657 58 448 3,59 % 893 [23]
Drapeau de l'Italie Italie 1 601 554 55 576 757 507 3,47 % 921 [24]
Drapeau de l'Argentine Argentine 1 424 520 38 730 1 257 214 2,72 % 862 [25]
Drapeau de la Colombie Colombie 1 316 806 36 766 1 210 489 2,79 % 749 [26]
Drapeau du Mexique Mexique 1 113 543 105 940 823 586 9,51 % 812 [27]
Drapeau de l'Allemagne Allemagne 1 069 763 16 862 738 974 1,58 % 203 [28],[29]
Drapeau de la Pologne Pologne 990 811 17 150 577 514 1,73 % 447 [30]
Drapeau du Pérou Pérou 963 605 35 966 894 741 3,73 % 1 224 [31],[32]
Drapeau de l'Iran Iran 962 070 48 246 668 151 5,01 % 603 [33]
Drapeau d'Afrique du Sud Afrique du Sud 790 004 21 535 731 242 2,73 % 361 [34],[35]
Drapeau de l'Ukraine Ukraine 745 123 12 548 355 172 1,68 % 295 [36],[37]
Drapeau de la Turquie Turquie 638 847 13 746 404 727 2,15 % 168 [38]
Drapeau de la Belgique Belgique[e] 576 599 16 547 2,87 % 1 448 [39],[40]
Drapeau du Chili Chili 551 743 15 410 526 604 2,79 % 854 [41]
Drapeau de l'Irak Irak 552 549 12 258 482 674 2,22 % 320 [42]
Drapeau de l'Indonésie Indonésie 543 975 17 081 454 879 3,14 % 63 [43]
Drapeau de la Tchéquie Tchéquie 523 298 8 295 451 607 1,59 % 776 [44]
Drapeau des Pays-Bas Pays-Bas[f] 523 478 9 376 1,79 % 553 [45],[46]
Drapeau de la Roumanie Roumanie 475 362 11 331 353 188 2,38 % 579 [47],[48]
Drapeau du Bangladesh Bangladesh 464 932 6 644 380 711 1,43 % 40 [49],[50]
Drapeau des Philippines Philippines 431 630 8 392 398 658 1,94 % 83 [51],[52]
Drapeau du Pakistan Pakistan 400 482 8 091 343 286 2,02 % 37 [53]
Drapeau du Canada Canada 378 139 12 130 299 972 3,21 % 320 [54]
Drapeau de l'Arabie saoudite Arabie saoudite 357 360 5 896 346 802 1,65 % 179 [55]
Drapeau du Maroc Maroc 356 336 5 846 305 291 1,64 % 162 [56]
Drapeau d’Israël Israël 336 160 2 864 323 224 0,85 % 315 [57]
Drapeau de la Suisse Suisse 327 072 4 445 245 600 1,36 % 525 [58],[59]
Drapeau du Portugal Portugal 298 061 4 505 212 942 1,51 % 425 [60],[61]
Drapeau de l'Autriche Autriche 282 456 3 184 221 692 1,13 % 361 [62]
Drapeau de la Suède Suède 243 129 6 681 2,75 % 644 [63]
Drapeau du Népal Népal 233 452 1 508 214 521 0,65 % 51 [64]
Drapeau de la Jordanie Jordanie 219 430 2 751 155 026 1,25 % 264 [65]
Drapeau de la Hongrie Hongrie 217 122 4 823 63 860 2,22 % 494 [66]
Drapeau de l'Équateur Équateur 192 685 13 461 169 804 6,99 % 810 [67],[68]
Drapeau de la Serbie Serbie 175 438 1 604 0,91 % 228 [69]
Drapeau des Émirats arabes unis Émirats arabes unis 168 860 572 154 899 0,34 % 61 [70]
Drapeau du Panama Panama 165 806 3 079 144 462 1,86 % 751 [71]
Drapeau du Japon Japon 146 760 2 119 123 445 1,44 % 17 [72]
Drapeau de la Bolivie Bolivie 144 708 8 957 121 702 6,19 % 810 [73]
Drapeau de la République dominicaine République dominicaine 143 988 2 331 115 219 1,62 % 224 [74]
Drapeau du Koweït Koweït 142 635 880 137 071 0,62 % 191 [75]
Drapeau de la Bulgarie Bulgarie 145 300 4 035 50 565 2,78 % 576 [76],[77]
Drapeau du Qatar Qatar 138 833 237 136 090 0,17 % 90 [78]
Drapeau du Costa Rica Costa Rica 139 638 1 726 87 526 1,24 % 352 [79]
Drapeau de la Biélorussie Biélorussie 136 647 1 158 114 341 0,85 % 123 [80]
Drapeau de l'Arménie Arménie 135 124 2 164 108 442 1,6 % 738 [81]
Drapeau de la Géorgie Géorgie 135 584 1 267 113 986 0,93 % 341 [82]
Drapeau du Kazakhstan Kazakhstan 132 348 1 990 116 863 1,5 % 109 [83],[84]
Drapeau de la Croatie Croatie 128 442 1 786 105 199 1,39 % 435 [85]
Drapeau du Liban Liban 127 944 1 018 83 034 0,8 % 167 [86]
Drapeau d'Oman Oman 123 699 1 423 115 216 1,15 % 295 [87]
Drapeau du Guatemala Guatemala 122 062 4 171 110 944 3,42 % 242 [88]
Drapeau de l'Azerbaïdjan Azerbaïdjan 121 176 1 392 74 902 1,15 % 137 [89]
Drapeau de l'Égypte Égypte 115 911 6 650 102 718 5,74 % 70 [90]
Drapeau de l'Éthiopie Éthiopie 110 074 1 706 73 808 1,55 % 16 [91],[92]
Drapeau du Honduras Honduras 108 253 2 918 48 073 2,7 % 315 [93],[94]
Drapeau de la Moldavie Moldavie 107 364 2 304 95 354 2,15 % 903 [95]
Drapeau de la Slovaquie Slovaquie 105 929 839 65 041 0,79 % 155 [96]
Drapeau de la Grèce Grèce 105 271 2 406 2,29 % 224 [97]
Drapeau du Venezuela Venezuela 102 040 894 96 652 0,88 % 31 [98]
Drapeau de la Tunisie Tunisie 96 769 3 260 70 851 3,37 % 282 [99]
Drapeau de la Birmanie Birmanie 90 713 1 941 70 156 2,14 % 36 [100]
Drapeau de la Bosnie-Herzégovine Bosnie-Herzégovine 87 901 2 681 52 769 3,05 % 764 [101]
Drapeau de Bahreïn Bahreïn 86 956 341 85 141 0,39 % 228 [102]
Drapeau de la République populaire de Chine Chine 86 542 4 634 81 631 5,35 % 3 [103]
Drapeau du Kenya Kenya 83 618 1 469 55 344 1,76 % 30 [104]
Drapeau de la Libye Libye 82 809 1 183 53 818 1,43 % 177 [105],[106]
Drapeau de l'Algérie Algérie 83 199 2 431 53 809 2,92 % 59 [107],[108]
Drapeau du Paraguay Paraguay 82 424 1 756 58 453 2,13 % 258 [109]
Drapeau du Danemark Danemark[g] 80 481 837 63 515 1,04 % 146 [110],[111]
Drapeau de la Slovénie Slovénie 75 806 1 435 1,89 % 694 [112],[113]
Drapeau de l'Ouzbékistan Ouzbékistan 72 920 608 70 198 0,83 % 18 [114]
Drapeau de l'Irlande Irlande 72 544 2 053 25 186 2,83 % 431 [115],[116]
Drapeau du Kirghizistan Kirghizistan 72 807 1 271 64 149 1,75 % 205 [117]
Drapeau du Nigeria Nigeria 67 557 1 173 63 282 1,74 % 6 [118]
Drapeau de la Malaisie Malaisie 65 697 360 54 759 0,55 % 11 [119]
Drapeau de la Macédoine du Nord Macédoine du Nord 61 878 1 763 38 946 2,85 % 850 [120]
Drapeau de la Lituanie Lituanie 62 515 519 15 077 0,83 % 186 [121],[122]
Drapeau de Singapour Singapour 58 213 29 58 124 0,05 % 5 [123]
Drapeau du Ghana Ghana 51 476 323 50 358 0,63 % 12 [124]
Drapeau de l'Afghanistan Afghanistan 46 116 1 774 36 716 3,85 % 51 [125]
Drapeau du Kosovo Kosovo 39 596 1 016 25 001 2,57 % 540 [126]
Drapeau du Salvador Salvador 38 405 1 114 35 078 2,9 % 174 [127]
Drapeau de l'Albanie Albanie 38 182 810 18 849 2,12 % 268 [128],[129]
Drapeau de la Norvège Norvège 35 684 328 20 956 0,92 % 61 [130]
Drapeau du Monténégro Monténégro 35 265 499 24 131 1,42 % 802 [131]
Drapeau du Luxembourg Luxembourg 34 678 321 26 086 0,93 % 513 [132]
Drapeau de la Corée du Sud Corée du Sud 34 652 526 27 885 1,52 % 10 [133],[134]
Drapeau de l'Australie Australie 27 904 908 25 405 3,25 % 37 [135]
Drapeau de la Finlande Finlande 24 629 393 16 800 1,6 % 71 [136]
Drapeau du Cameroun Cameroun 24 022 437 22 177 1,82 % 18 [137],[138]
Drapeau du Sri Lanka Sri Lanka 23 987 118 17 560 0,49 % 6 [139],[140]
Drapeau de la Côte d'Ivoire Côte d'Ivoire 21 261 131 20 912 0,62 % 5 [141]
Drapeau de l'Ouganda Ouganda 20 459 205 8 989 1 % 5 [142],[143]
Drapeau de la Zambie Zambie 17 589 357 16 925 2,03 % 21 [144],[145]
Drapeau du Soudan Soudan 17 810 1 249 10 302 7,01 % 31 [146],[147]
Drapeau de Madagascar Madagascar 17 341 251 16 657 1,45 % 10 [148]
Drapeau de la Lettonie Lettonie 16 975 196 1 719 1,15 % 103 [149]
Drapeau du Sénégal Sénégal 16 027 332 15 582 2,07 % 21 [150]
Drapeau du Mozambique Mozambique 15 701 131 13 729 0,83 % 4 [151]
Drapeau de l'Angola Angola 15 139 348 7 851 2,3 % 12 [152]
Drapeau de la Namibie Namibie 14 285 150 13 412 1,05 % 59 [153]
Drapeau de la Guinée Guinée 13 039 76 11 982 0,58 % 6 [154],[155]
Drapeau des Maldives Maldives 12 947 46 11 781 0,36 % 105 [156]
Drapeau de la république démocratique du Congo République démocratique du Congo 12 608 333 11 495 2,64 % 4 [157]
Drapeau du Tadjikistan Tadjikistan 12 118 86 11 518 0,71 % 10 [158]
Drapeau de l'Estonie Estonie 12 308 118 7 078 0,96 % 89 [159],[160]
Drapeau du Cap-Vert Cap-Vert 10 700 105 10 161 0,98 % 192 [161]
Drapeau de la Jamaïque Jamaïque 10 669 251 5 953 2,35 % 87 [162],[163]
Drapeau de Chypre Chypre 10 231 48 2 057 0,47 % 42 [164],[165]
Drapeau du Zimbabwe Zimbabwe 9 822 275 8 472 2,8 % 17 [166]
Drapeau de Malte Malte 9 873 137 7 665 1,39 % 294 [167],[168]
Drapeau d'Haïti Haïti 9 272 232 7 951 2,5 % 21 [169]
Drapeau du Gabon Gabon 9 191 59 9 037 0,64 % 29 [170]
Drapeau du Botswana Botswana 8 531 31 7 692 0,36 % 14 [171]
Drapeau de la Mauritanie Mauritanie 8 601 177 7 732 2,06 % 40 [172],[173]
Drapeau de Cuba Cuba 8 284 135 7 631 1,63 % 12 [174]
Drapeau de la Syrie Syrie 7 715 409 3 444 5,3 % 22 [175]
Drapeau des Bahamas Bahamas 7 496 163 5 830 2,17 % 412 [176],[177]
Drapeau d'Andorre Andorre 6 745 76 5 873 1,13 % 998 [178]
Drapeau de Trinité-et-Tobago Trinité-et-Tobago 6 669 120 5 771 1,8 % 88 [179],[180]
Drapeau de l'Eswatini Eswatini 6 406 121 5 987 1,89 % 108 [181]
Drapeau de Hong Kong Hong Kong 6 124 108 5 328 1,76 % 14 [182]
Drapeau du Malawi Malawi 6 028 185 5 455 3,07 % 10 [183]
Drapeau du Rwanda Rwanda 5 891 47 5 480 0,8 % 4 [184],[185]
Drapeau du Nicaragua Nicaragua 5 784 159 4 225 2,75 % 26 [186]
Drapeau de la république du Congo République du Congo 5 774 94 4 988 1,63 % 18 [187],[188]
Drapeau de Djibouti Djibouti 5 676 61 5 577 1,07 % 64 [189]
Drapeau du Belize Belize 5 587 141 3 056 2,52 % 376 [190]
Drapeau de l'Uruguay Uruguay 5 857 77 4 357 1,31 % 22 [191],[192]
Drapeau de l'Islande Islande 5 371 26 5 152 0,48 % 73 [193]
Drapeau du Guyana Guyana 5 406 151 4 392 2,79 % 194 [194]
Drapeau du Suriname Suriname 5 312 117 5 194 2,2 % 208 [195]
Drapeau de la Guinée équatoriale Guinée équatoriale 5 153 85 5 009 1,65 % 67 [196]
Drapeau de la République centrafricaine République centrafricaine 4 911 63 1 924 1,28 % 14 [197],[198]
Drapeau de la Somalie Somalie 4 445 113 3 412 2,54 % 10 [199]
Drapeau du Mali Mali 4 326 146 3 044 3,37 % 8 [200]
Drapeau de la Thaïlande Thaïlande 4 008 60 3 811 1,5 % 1 [201]
Drapeau de la Gambie Gambie 3 726 123 3 582 3,3 % 59 [202]
Drapeau du Soudan du Sud Soudan du Sud 3 047 60 1 290 1,97 % 5 [203],[204]
Drapeau du Bénin Bénin 2 844 43 2 515 1,51 % 4 [205],[206]
Drapeau du Togo Togo 2 651 61 1 885 2,3 % 8 [207]
Drapeau du Burkina Faso Burkina Faso 2 635 68 2 426 2,58 % 4 [208],[209]
Drapeau de la Guinée-Bissau Guinée-Bissau 2 419 43 2 255 1,78 % 23 [210],[211]
Drapeau de Sierra Leone Sierra Leone 2 412 74 1 836 3,07 % 10 [212],[213]
Drapeau du Yémen Yémen 2 148 614 1 491 28,58 % 22 [214]
Drapeau du Lesotho Lesotho 2 109 44 1 278 2,09 % 20 [215],[216]
Drapeau de la Nouvelle-Zélande Nouvelle-Zélande 1 694 25 1 600 1,48 % 5 [217]
Drapeau du Tchad Tchad 1 649 101 1 493 6,12 % 7 [218]
Drapeau de Saint-Marin Saint-Marin 1 612 46 1 299 2,85 % 1 377 [219]
Drapeau du Niger Niger 1 484 70 1 205 4,72 % 3 [220]
Drapeau du Libéria Libéria 1 452 82 1 311 5,65 % 17 [221]
Drapeau de la République socialiste du Viêt Nam Viêt Nam 1 341 35 1 179 2,61 % 0 [222]
Drapeau du Liechtenstein Liechtenstein 1 270 16 1 088 1,26 % 422 [223]
Drapeau de Sao Tomé-et-Principe Sao Tomé-et-Principe 989 17 930 1,72 % 83 [224]
Diamond Princess 712 14 653 1,97 % 3 773 [225],[226]
Drapeau de la Mongolie Mongolie 760 0 347 0 % 0 [227]
Drapeau de Taïwan Taïwan 679 7 565 1,03 % 0 [228]
Drapeau de la Papouasie-Nouvelle-Guinée Papouasie-Nouvelle-Guinée 645 7 588 1,09 % 1 [229]
Drapeau des Comores Comores 611 7 586 1,15 % 8 [230]
Drapeau du Burundi Burundi 589 1 511 0,17 % 0 [231]
Drapeau de Monaco Monaco 573 3 497 0,52 % 78 [232]
Drapeau de l'Érythrée Érythrée 491 0 438 0 % 0 [233]
Drapeau de Maurice Maurice 453 10 416 2,21 % 8 [234]
Drapeau du Bhoutan Bhoutan 396 0 377 0 % 0 [235]
Drapeau du Cambodge Cambodge 326 0 304 0 % 0 [236],[237]
Drapeau de Sainte-Lucie Sainte-Lucie 259 2 131 0,77 % 11 [238]
Drapeau de la Barbade Barbade 236 7 218 2,97 % 24 [239]
Drapeau des Seychelles Seychelles 166 0 159 0 % 0 [240],[241]
Drapeau du Brunei Brunei 150 3 145 2 % 7 [242],[243]
Drapeau d'Antigua-et-Barbuda Antigua-et-Barbuda 141 4 130 2,84 % 39 [244],[245]
Drapeau de Saint-Vincent-et-les-Grenadines Saint-Vincent-et-les-Grenadines 85 0 79 0 % 0 [246],[247]
Drapeau de la Dominique Dominique 77 0 63 0 % 0 [248],[249]
Drapeau de Macao Macao 46 0 46 0 % 0 [250]
Drapeau de Grenade Grenade 41 0 30 0 % 0 [251],[252]
Drapeau du Laos Laos 39 0 24 0 % 0 [253],[254]
Drapeau des Fidji Fidji 42 2 33 4,76 % 2 [255],[256]
Drapeau du Timor oriental Timor oriental 30 0 30 0 % 0 [257]
Drapeau de la République arabe sahraouie démocratique Sahara Occidental 28 2 26 0 % 0 [258]
Drapeau du Vatican Vatican 27 0 15 0 % 0 [259],[260]
Drapeau de Saint-Christophe-et-Niévès Saint-Christophe-et-Niévès 22 0 19 0 % 0 [261],[262]
Drapeau des Salomon Îles Salomon 13 0 4 0 % 0 [263]
MS Zaandam 13 4 30,77 % 2 187 [264],[265]
Drapeau des Îles Marshall Îles Marshall 2 0 0 0 % 0 [266]
Drapeau du Vanuatu Vanuatu 1 0 0 0 % 0 [267]
Drapeau des Samoa Samoa 1 0 0 0 % 0 [268]
Drapeau de la Tanzanie Tanzanie [269],[270]

Caractérisation

La taxonomie de ces nouveaux virus fait d'abord débat, pour finalement aboutir en 1975 à la création d'une nouvelle famille (Coronaviridae) et d'une nouvelle sous-famille (Orthocoronavirinae) par l'International Committee on Taxonomy of Viruses[10].

Dénomination

Le terme coronavirus (du latin corona et virus, littéralement « virus à couronne »[271]) provient de l'apparence des virions au microscope électronique, caractérisée par une frange de grandes protubérances entourant l'enveloppe avec l'apparence d'une couronne, par analogie avec la couronne solaire[2].

Hôtes du virus

Les hôtes idéaux des coronavirus, en tant que vertébrés volants à sang chaud, sont les chauves-souris (pour les Alphacoronavirus et les Betacoronavirus) et les oiseaux (pour les Gammacoronavirus (en) et les Deltacoronavirus (en)). Ces espèces-réservoir assurent l'évolution et la dissémination des coronavirus[5]. Chez d'autres espèces, les symptômes varient (maladies des voies respiratoires supérieures chez la poule, diarrhée chez la vache ou le porc, des voies digestives chez le chat et le chien, etc.). Parfois, aucun symptôme n'est associé à leur présence (ex. coronavirus du béluga).

L'être humain abrite naturellement quatre types de coronavirus bénins, qui provoquent des infections des voies respiratoires, comme le rhume, et plus rarement affectent les systèmes gastro-intestinaux, cardiaques et nerveux[272].

Les groupes de coronavirus ont normalement un hôte animal spécifique (mammifères ou oiseaux[273]) mais ils peuvent parfois changer d'hôte à la suite d'une mutation. Ce sont de telles mutations qui ont probablement conduit à l'apparition de souches causant de graves infections chez l'homme (SRAS, MERS et Covid-19).

Tropisme

On a longtemps pensé que les coronavirus avaient un tropisme uniquement respiratoire ou gastrointestinal (traduit par des pneumonies et entérocolites dans les cas graves), mais un nombre croissant d'études montrent un tropisme bien plus large, cardiovasculaire notamment, et neurologique également (dès les années 1980, on a montré que plusieurs coronavirus, dont en dernier cas le SARS-CoV-2 sont clairement aussi neuroinvasifs et neurotropes[274],[275],[276], au point que cette diversité de tropismes et de symptômes font des coronavirus (murins notamment, regroupées sous le sigle de MHV) un modèle animal pour l'étude de maladies humaines aussi variées que la sclérose en plaques, l’hépatite virale ou la pneumonie (S. R. Weiss et al. 2011). Le MHV pénètre le Système nerveux central (SNC) via les neurones du nerf olfactif, et peut causer une encéphalite aiguë ou une maladie démyélinisante chronique s'il y persiste (il peut aussi se propager jusqu’à la moelle épinière)[275],[277].

Biologie

Morphologie

Morphologie d'un coronavirus.

Ce virus enveloppé est constitué d'une enveloppe virale entourant une capside hélicoïdale qui contient le brin d'ARN. La taille du génome de ces virus varie d'environ 26 à 32 kilobases, valeurs parmi les plus élevées chez les virus à ARN.

Les coronavirus ont en commun des protéines désignées par une lettre indiquant leur localisation : S (protubérances), E (enveloppe), M (membrane) et N (nucléocapside). Certains, notamment ceux du sous-groupe A du genre Betacoronavirus, ont une protéine HE (hémagglutinine estérase (en)) caractéristique. Le coronavirus du SRAS présente en outre sur la protéine S un site de liaison spécifique à l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2[278] qui lui sert de point d'entrée dans la cellule hôte.

La taille physique du virion est classiquement donnée comme étant de 120 à 160 nm[279] ou comme étant de l'ordre de 125 nm[280]. Toutefois le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19 a été annoncé plus récemment comme mesurant approximativement de 60 à 140 nm, et comme étant de forme elliptique avec de nombreuses variations[281].

Génome

Tous les CoV ont un génome d'ARN non-segmentés (simple brin) organisé de la même manière : les deux tiers environ du génome contiennent deux grands « cadres de lecture ouverts » et se chevauchant (dits ORF1a et ORF1b). Ces deux cadres sont traduits en « polyprotéines réplicase » pp1a et pp1ab. « Ces polyprotéines sont ensuite traitées pour générer 16 protéines non structurales, désignées nsp1 ~ 16. La partie restante du génome contient des ORF pour les protéines structurales, y compris la pointe (S), l'enveloppe (E), la membrane (M) et la nucléoprotéine (N). Un certain nombre de protéines accessoires spécifiques à la lignée sont également codées par différentes lignées de CoV »[3],[282],[283],[284].

Réplication

Réplication du virus à couronne.

Elle se fait en six étapes successives (voir illustration) :

  1. Grâce à leur protéine S, les coronavirus se lient aux molécules cellulaires de surface telles que les métalloprotéinases. Les virus dotés en plus de la protéine HE (hémagglutinine-estérase) dans leur enveloppe peuvent aussi se lier à l'acide N-acétylneuraminique qui sert de corécepteur (lui-même initiateur de l'entrée d'un pathogène dans une cellule hôte). On ne sait pas clairement si les virus entrent dans la cellule hôte par fusion des membranes virales et cellulaires, ou par une internalisation à récepteur. Quel qu’en soit le mécanisme, le brin d'ARN est inséré dans la cellule, et la capside (la coque) est abandonnée ;
  2. Les coronavirus sont munis d'un seul génome ARN à brin positif, à présent sur place dans le cytoplasme. Le génome de l'ARN du coronavirus a une coiffe méthylée 5' et une queue polyadénylée 3', ce qui permet à l'ARN de se fixer aux ribosomes pour la traduction. Les ribosomes de la cellule décodent l'ARN viral, produisant les protéines qui y sont codées ;
  3. D'abord l'ARN positif du virus est transcrit en protéine pour former une ARN polymérase propre (une ARN polymérase ARN-dépendante). La réplicase est la première protéine fabriquée ; une fois le gène codant la réplicase traduit par le ribosome de la cellule hôte, la traduction est arrêtée par un codon stop. Cette réplicase virale ne reconnaît et produit que l'ARN viral, et permet au génome viral d'être transcrit en nouvelles copies d'ARN, à l'aide de la machinerie de la cellule hôte. Se servant du brin positif comme modèle, cet enzyme assemble le brin négatif ;
  4. Par la suite, ce brin négatif sert lui-même de modèle pour transcrire de petits ARN sous-génomiques, qui sont utilisés pour fabriquer toutes les autres protéines. C'est ce qu'on appelle une transcription imbriquée. Ce processus est une forme d'économie génétique, permettant au virus de coder le plus grand nombre de gènes dans un petit nombre de nucléotides ;
    Le génome du brin négatif est traduit par le ribosome de la cellule hôte, et une longue polyprotéine est formée, où toutes les protéines virales sont attachées. Les coronavirus ont une protéine non structurale - une protéase - qui est capable de cliver la polyprotéine.
    Par ailleurs, ce brin négatif joue un rôle dans la réplication de nouveaux génomes ARN à brin positif.
    Le cytoplasme de la cellule hôte se remplit de protéines et d'ARN viraux ;
  5. (a) La protéine N aide à lier l'ARN génomique pour réaliser l’encapsidation du génome virale dans une enveloppe protectrice nommée capside[285] ; la protéine M s'intègre à la membrane du réticulum endoplasmique, côté capside ; et des protéines HE et S traversent la membrane du réticulum endoplasmique, via la protéine de translocation, et se positionnent du côté opposé.
    (b) Avec la liaison entre la capside et les protéines M, la membrane du réticulum s'invagine, et bourgeonne. La capside (la coque) assemblée dotée d'ARN hélicoïdal se retrouve alors à l'intérieur du réticulum endoplasmique, ayant capturé à son profit la membrane de ce dernier, qui porte à présent à son extérieur les protéines HE et S ;
  6. Cette progéniture virale est ensuite (a) encapsulée et transportée par des vésicules golgiennes vers la membrane cellulaire, (b) pour être enfin externalisée (par exocytose) hors de la cellule.

Infection à coronavirus

Types d'infection

Sept types de coronavirus infectent couramment l'homme[286], dont trois causent des infections graves.

Infections bénignes

Les quatre premiers types connus sont sans gravité : les coronavirus humains 229E, NL63, OC43 et HKU1, inconnus chez la chauve-souris. Ils causent des rhumes avec fièvre et des maux de gorge dus à des végétations adénoïdes gonflées, principalement en hiver et au début du printemps[287].

Les coronavirus seraient la cause de 15 à 30 % des rhumes courants[288].

Infections graves

Trois types de coronavirus qui ne se trouvent pas naturellement chez l'homme mais chez des mammifères ont été découverts plus récemment et ont été à l'origine d'infections graves des poumons (pneumopathie virale) :

Selon le virus en cause, les formes graves de la maladie ont leurs particularités. Par exemple, la diarrhée était très fréquente dans le SRAS mais rare dans la maladie à coronavirus 2019.

Comparaison des infections graves

Trois principales sources sont utilisées : l'Institut Pasteur, l'OMS et les CDC américains[290].

Syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS)[291],[292] Syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS)[293],[294],[295] Maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)
Agent pathogène MERS-CoV SARS-CoV SARS-CoV-2
Année d'apparition 2012 2003 2019
Nombre de cas 1 219 8 098 dont 5 327 en Chine. En cours, voir ici
Pourcentage de cas par transmission nosocomiale 70 %[296] 58 %[296]
Nombre de décès 449 774 (dont 349 en Chine) En cours, voir ici
Réservoir Dromadaire Chauve-souris Chauve-souris (probablement)
Transmission à l'homme par l'animal Contact direct avec un animal infecté, consommation de lait cru de dromadaire. Consommation de viande de civette palmiste masquée, animal sauvage vendu sur les marchés et consommé dans le Sud de la Chine. Un pangolin[289] pourrait être l'hôte intermédiaire.
Transmission interhumaine Oui Oui Oui
Transmission par objet Oui Risque très faible.
Transmission materno-fœtale Aucun cas retrouvé chez les femmes enceintes infectées par ce virus[297]. Aucune preuve[298].
Transmission par le lait maternel Un seul cas documenté[299] RT-PCR négative sur 16 femmes testées[300]
Incubation Entre 5 et 15 jours. Entre 2 et 7 jours. Durée médiane d'incubation à 5,1 jours (5,5 jours en moyenne), 97,5 % des personnes seront malades 11,5 jours après le contact infectieux[301].
Porteur sain Probablement pas. Oui, (un seul cas publié)
Contagiosité Taux de reproduction inférieur à 1[302]. Taux de reproduction supérieur à 2[302]. Médiane du taux de reproduction de base (R0) à 2,79[303].
Durée de la contagiosité Semble limitée à la période des signes cliniques. Possibilité disputée de contagion en phase asymptomatique[304].
Début de la période de contagiosité 3 à 4 jours après le début des signes cliniques. Dès l'apparition des signes cliniques. Porteur asymptomatique prouvé[305].
Fièvre À 98% À 99% À 87.9%, mais peut apparaître plusieurs jours après la toux ou les difficultés à respirer.
Diarrhée À 26% À 20%[297]. À 3.7%.
Transmission par les selles Très probable mais a joué un rôle mineur[297]. Cette possibilité est envisagée[306].
Létalité 34,4 %[296] 9,5 %[296], au-delà de 50 % chez les plus de 65 ans. 3,4 %[307]
Traitement Symptomatique Symptomatique Symptomatique
Vaccin Aucun Aucun Aucun
Statut Résurgence possible. Considéré comme éradiqué. Épidémie en cours.

Passage de la barrière des espèces

Au vu des séquences génomiques disponibles, deux grands taxons animaux seraient le réservoir principal des CoVs :

Au vu des connaissances disponibles, les coronavirus semblaient avoir besoin d'hôtes intermédiaires (toujours des mammifères) pour s'« humaniser », c'est-à-dire muter pour pouvoir infecter l'Homme.
Des hôtes intermédiaires connus ont été :

Transmission interhumaine

Pour la pandémie de 2019-2020, se reporter aux articles dont les noms suivent.

Particules éjectées par un éternuement.

La transmission interhumaine des coronavirus se fait principalement par les gouttelettes ou des aérosols respiratoires expectorées par une personne infectée (via la toux, les éternuements, des postillons, ou parfois par le simple fait de parler fort ou en criant) quand les particules virales sont inhalées par une personne se trouve à proximité. La transmission et la contagiosité varient aussi selon le coronavirus, et peut-être selon sa souche au sein d'une épidémie.

La prophylaxie passe par une prévention primaire visant à limiter la transmission du virus : éviter les contacts (surfaces potentiellement contaminées, poignées de main, embrassades), se laver les mains fréquemment, éviter de se toucher les yeux, le nez ou la bouche, par où le virus peut s'introduire dans l'organisme. En cas de symptômes de type toux ou rhume, se maintenir à au moins 1 mètre de toute personne et éviter d'émettre des particules contaminées[309].

D'autres recommandations comprennent[310] :

  • ne pas entrer en contact avec des animaux manifestement malades, ne pas consommer de viandes provenant d'animaux malades ;
  • ne pas consommer de produits animaux (viande...) mal cuits, ni de légumes crus s'ils n'ont pas été lavés avec de l'eau non contaminée.

Traitement

Dans le cas du SRAS, des médicaments ont été utilisés pour tenter d'enrayer l'épidémie : la ribavirine, un analogue de nucléotides, des anti-inflammatoires stéroïdiens et, après identification formelle de l'agent pathogène et des criblages de sensibilité, l'interféron-alpha et des inhibiteurs de protéases. Leur efficacité est encore sujette à caution. Aucun n'a fait l'objet d'une étude clinique adéquate : beaucoup d'études disponibles ne permettent pas de conclusions scientifiques claires car elles ont été réalisées sur de petits nombres de sujets ou alors sans protocole ou dose fixe. Certaines indiquent même que ces traitements pourraient avoir nui à l'éradication du virus[311].

Vaccins

L'éradication rapide de l'épidémie de SRAS précédente n'a pas laissé place à beaucoup d'essais cliniques. Des vaccins à base de virus inactivé, et d'autres fondés sur les protéines S et N, sont à l'étude depuis plusieurs années[312].

Taxonomie

Nommage des coronavirus

Les coronavirus sont nommés par un groupe d'étude[313] travaillant au sein de l'ICTV (International committee on Taxonomy of viruses)[314].

Classification

Les coronavirus (CoV) sont des virus à ARN monocaténaire de sens positif (groupe IV de la classification Baltimore) correspondant à la sous-famille Orthocoronavirinae de la taxonomie de l'ICTV[1], dans la famille Coronaviridae, et de l'ordre Nidovirales[315],[316].

Selon les caractéristiques de leurs séquences protéiques, les CoV sont classés en 4 genres (alpha-CoV, beta-CoV, gamma-CoV et delta-CoV), qui tous contiennent des virus pathogènes pour les mammifères[4] :

  1. Alphacoronavirus, qui inclut le virus de la diarrhée épidémique porcine (PEDv), le virus de la gastro-entérite transmissible porcine (TGEV), le coronavirus du syndrome de la diarrhée aiguë porcine (SADS-CoV), le coronavirus canin, le coronavirus entérique félin, le virus de la péritonite infectieuse féline (FIPV) ;
  2. Betacoronavirus, dont le virus respiratoire-respiratoire du SRAS (SARS-CoV), le SARS-CoV-2, le coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV), virus de l'hépatite murine (MHV), coronavirus bovins, virus de la sialodacryoadénite du rat, virus de la sialodacryoadénite porcine, hémagglutinose porcine, virus de l'hémagglutinose porcine coronavirus équin. Dans ce genre Betacoronavirus, le SARS-CoV et le SARS-CoV-2 appartiennent tous les deux au sous-genre Sarbecovirus au sein duquel trois clades distincts ont été identifiés :
    - Clade1: souches "chauve-souris" de Bulgarie et Kenya[317] ;
    - Clade2: SARS-CoV-2 et souches "chauve-souris" de Chine orientale[317] ;
    - Clade3: SARS-CoV et souches "chauves-souris" de Chine du sud-ouest[317] :
  3. Gammacoronavirus: surtout trouvé chez des oiseaux migrateurs, causant notamment des bronchites ; un Gammacoronavirus a été isolé d'un béluga en captivité,
  4. Deltacoronavirus: connus depuis peu, qui semblent surtout infecter les oiseaux, mais aussi trouvé chez les porcs.

Remarques :

  • On a parfois nommé un coronavirus selon l'espèce animale où il a d'abord été trouvé (par exemple : coronavirus respiratoire canin, ou CRCoV pour Canine respiratory coronavirus, virus appartenant au genre betacoronavirus et à son sous-groupe 2a)[318],[319].
  • Le dernier coronavirus trouvé, en 2019, est le SARS-CoV-2, responsable de la pandémie de Covid-19.

Liste des espèces

La sous-famille Orthocoronavirinae de la famille Coronaviridae est organisée en 4 genres, 22 sous-genres et une quarantaine d'espèces[320] :


Notes

  1. Sont inclus les cas recensés à Porto Rico et aux îles Vierges des États-Unis.
  2. Sont inclus les cas recensés en Guadeloupe, en Guyane, à La Réunion, en Martinique, à Mayotte, en Nouvelle-Calédonie, en Polynésie française, à Saint-Barthélemy, à Saint-Martin et à Saint-Pierre-et-Miquelon.
  3. L'université Johns-Hopkins additionnant les cas confirmés et probables, les données de Santé publique France sont utilisées pour la France (source).
  4. Sont inclus les cas recensés à Anguilla, aux Bermudes, à Gibraltar, aux îles Anglo-Normandes, aux îles Caïmans, aux îles Turques-et-Caïques, aux îles Vierges britanniques, dans l'île de Man et à Montserrat.
  5. Le total des décès enregistrés au se répartissent comme suit: 57 % sont survenus en milieu hospitalier, 40 % en maisons de soins et de repos (sans test de confirmation), 1 % au domicile du patient et pour 2 %, l'information n'est pas disponible selon Sciensano.
  6. Sont inclus les cas recensés à Aruba, à Curaçao et à Saint-Martin.
  7. Sont inclus les cas recensés au Groenland et dans les îles Féroé.

Références

  1. a et b (en) « Virus Taxonomy: 2018b Release », ICTV, (consulté le 24 janvier 2020).
  2. a b et c (en) « Virology: Coronaviruses », Nature, vol. 220, no 5168,‎ , p. 650–650 (ISSN 0028-0836 et 1476-4687, PMCID PMC7086490, DOI 10.1038/220650b0, lire en ligne, consulté le 14 mai 2020)
  3. a et b (en) Zi-Wei Ye et Shuofeng Yuan, « Zoonotic origins of human coronaviruses », sur International Journal of Biological Sciences, (ISSN 1449-2288, PMID 32226286, PMCID PMC7098031, DOI 10.7150/ijbs.45472, consulté le 22 mai 2020), p. 1686–1697
  4. a et b SARS-CoV, B.S (2020) Mutation and Recombination.
  5. a et b (en) Patrick C. Y. Woo, Susanna K. P. Lau, Carol S. F. Lam, Candy C. Y. Lau, Alan K. L. Tsang, John H. N. Lau, Ru Bai, Jade L. L. Teng, Chris C. C. Tsang, Ming Wang, Bo-Jian Zheng, Kwok-Hung Chan et Kwok-Yung Yuen, « Discovery of Seven Novel Mammalian and Avian Coronaviruses in the Genus Deltacoronavirus Supports Bat Coronaviruses as the Gene Source of Alphacoronavirus and Betacoronavirus and Avian Coronaviruses as the Gene Source of Gammacoronavirus and Deltacoronavirus », Journal of Virology, vol. 86, no 7,‎ , p. 3995-4008 (PMID 22278237, DOI 10.1128/JVI.06540-11, Bibcode 3302495, lire en ligne, consulté le 6 mars 2020)
  6. « Coronaviruses 101: Focus on Molecular Virology » (consulté le 2 avril 2020).
  7. (en-US) « Coronavirus | Human Coronavirus Types | CDC », sur www.cdc.gov, (consulté le 15 avril 2020)
  8. A. Z. Kapikian, « The coronaviruses », Developments in Biological Standardization, vol. 28,‎ , p. 42–64 (ISSN 0301-5149, PMID 1092577, lire en ligne, consulté le 15 avril 2020)
  9. a et b Cemal BULUT et Yasuyuki KATO, « Epidemiology of COVID-19 », TURKISH JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES, vol. 50, no SI-1,‎ , p. 563–570 (ISSN 1303-6165, DOI 10.3906/sag-2004-172, lire en ligne, consulté le 25 avril 2020)
  10. a b et c Marc Gozlan, « Il était une fois les coronavirus », sur https://www.lemonde.fr/blog/realitesbiomedicales, Le Monde, (consulté le 4 avril 2020)
  11. K McIntosh, W B Becker et R M Chanock, « Growth in suckling-mouse brain of "IBV-like" viruses from patients with upper respiratory tract disease. », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 58, no 6,‎ , p. 2268–2273 (ISSN 0027-8424, PMID 4298953, lire en ligne, consulté le 15 avril 2020)
  12. Steven Brocklehurst, « The woman who discovered the first coronavirus », sur https://www.bbc.com, British Broadcasting Corporation, (consulté le 17 avril 2020)
  13. a b et c (en) « COVID-19 Dashboard by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns Hopkins University (JHU) », sur gisanddata.maps.arcgis.com (consulté le 14 juin 2020)
  14. « COVID-19 Dashboard by the Center for Systems Science and Engineering (CSSE) at Johns Hopkins University (JHU) », sur ArcGIS, Johns Hopkins University (consulté le 1er décembre 2020)
  15. « COVID-19/Coronavirus Real Time Updates With Credible Sources in US and Canada », sur 1point3acres (consulté le 30 novembre 2020)
  16. (en) « Home – Ministry of Health and Family Welfare – GOI », sur mohfw.gov.in (consulté le 30 novembre 2020)
  17. (pt) « Painel Coronavírus », Ministry of Health (Brazil) (consulté le 30 novembre 2020)
  18. (pt-BR) « Brasil tem 173,1 mil mortes por Covid; média móvel de casos supera 35 mil, maior marca desde 6 de setembro », G1, (consulté le 30 novembre 2020)
  19. (ru) « ru:Оперативные данные », sur Стопкоронавирус.рф (consulté le 30 novembre 2020)
  20. « info coronavirus covid-19 », Gouvernement.fr (consulté le 30 novembre 2020)
  21. « COVID-19 : bilan et chiffres clés en France », www.santepubliquefrance.fr (consulté le 30 novembre 2020)
  22. (es) « La pandemia del coronavirus, en datos, mapas y gráficos », sur RTVE (consulté le 30 novembre 2020)
  23. « Coronavirus (COVID-19) in the UK », sur coronavirus.data.gov.uk (consulté le 30 novembre 2020)
  24. (it) « COVID-19 ITALIA », sur opendatadpc.maps.arcgis.com, Protezione Civile (consulté le 30 novembre 2020)
  25. (es) « Información epidemiológica », Ministerio de Salud (consulté le 30 novembre 2020)
  26. « CORONAVIRUS (COVID-19) », sur covid19.minsalud.gov.co, (consulté le 30 novembre 2020)
  27. (es) « Covid-19 Mexico », Instituciones del Gobierno de México (consulté le 1er décembre 2020)
  28. (de) « Corona-Karte Deutschland: COVID-19 live in allen Landkreisen und Bundesländern », sur Tagesspiegel (consulté le 30 novembre 2020)
  29. (de) « Wie sich das Coronavirus in Ihrer Region ausbreitet », Zeit Online (consulté le 30 novembre 2020)
  30. (pl) « Ministerstwo Zdrowia », sur Twitter, Ministry of Health (Poland), (consulté le 30 novembre 2020)
  31. (es) Ministry of Health (Peru), « Sala Situactional COVID-19 Perú », {{Article}} : paramètre « périodique » manquant,‎ (lire en ligne)
  32. (es) « Minsa: Casos confirmados por coronavirus Covid-19 ascienden a 962 530 en el Perú (Comunicado N°333) », gob.pe,‎ (lire en ligne)
  33. (en) « Some 371 more Iranians die from COVID-19 over past 24 hours », sur IRNA (consulté le 30 novembre 2020)
  34. « COVID-19 Statistics in South Africa », sur sacoronavirus.co.za, (consulté le 30 novembre 2020)
  35. « Dr Zweli Mkhize », sur Twitter, Dr Zweli Mkhize, (consulté le 30 novembre 2020)
  36. « Operational information on the spread of coronavirus infection 2019-nCoV », Ministry of Healthcare (Ukraine) (consulté le 1er décembre 2020)
  37. (uk) « За весь час пандемії в Україні », Maksym Stepanov,‎ (consulté le 1er décembre 2020)
  38. « T.C Sağlık Bakanlığı Türkiye Genel Koronavirüs Tablosu », sur covid19.saglik.gov.tr (consulté le 30 novembre 2020)
  39. (nl) « Coronavirus COVID-19 », sur info-coronavirus.be (consulté le 30 novembre 2020)
  40. (nl) « COVID-19 – Epidemiologische situatie », sur Sciensano (consulté le 30 novembre 2020)
  41. (es) « Casos confirmados COVID-19 », Gobierno de Chile (consulté le 30 novembre 2020)
  42. (ar) « الموقف الوبائي اليومي لجائحة كورونا في العراق ليوم الخميس الموافق ٥ تشرين الثاني ٢٠٢٠ », sur Facebook, Ministry of Health of Iraq,‎ (consulté le 30 novembre 2020)
  43. « Peta Sebaran » (consulté le 1er décembre 2020)
  44. (cs) « COVID-19 | Onemocnění aktuálně od MZČR », Ministry of Health (Czech Republic) (consulté le 1er décembre 2020)
  45. (nl) « Actuele informatie over het nieuwe coronavirus (COVID-19) », RIVM, (consulté le 30 novembre 2020)
  46. « Statistieken over het Coronavirus en COVID-19 », sur allecijfers.nl (consulté le 30 novembre 2020)
  47. (ro) « Comunicate de presă », sur Ministry of Internal Affairs (consulté le 30 novembre 2020)
  48. (ro) « Comunicate de presă », sur Ministry of Health (consulté le 30 novembre 2020)
  49. (bn) « bn:করোনা ভাইরাস ইনফো ২০১৯ », sur corona.gov.bd (consulté le 30 novembre 2020)
  50. « কোভিড-১৯ ট্র্যাকার | বাংলাদেশ কম্পিউটার কাউন্সিল (বিসিসি) », sur covid19tracker.gov.bd (consulté le 30 novembre 2020)
  51. « COVID-19 CASE BULLETIN », Department of Health (Philippines) (consulté le 30 novembre 2020)
  52. « COVID-19 Tracker », Department of Health (Philippines) (consulté le 30 novembre 2020)
  53. « COVID-19 Situation », sur covid.gov.pk, Government of Pakistan (consulté le 1er décembre 2020)
  54. « Tracking every case of COVID-19 in Canada », CTV News, (consulté le 30 novembre 2020)
  55. (ar) « COVID 19 Dashboard: Saudi Arabia », Ministry of Health (Saudi Arabia), (consulté le 30 novembre 2020)
  56. « Covid-19: Morocco Records 2,533 New Cases, 2,977 Recoveries over Past 24 Hours », Maghreb Arabe Press, (consulté le 30 novembre 2020)
  57. (he) « he:נגיף הקורונה בישראל – תמונת מצב כללית » (consulté le 30 novembre 2020)
  58. « Current situation in Switzerland », Federal Office of Public Health (consulté le 30 novembre 2020)
  59. « Cas d'infection au Sars-CoV-2 en Suisse », Tribune de Genève (consulté le 30 novembre 2020)
  60. (pt) « Ponto de Situação Atual em Portugal », Direção-Geral da Saúde (consulté le 30 novembre 2020)
  61. (pt) « Já se encontra disponível o relatório de situação de hoje, 30 de novembro », Direção-Geral da Saúde (consulté le 30 novembre 2020)
  62. (de) « Bundesministerium für Inneres: Aktuelle Zahlen zum Corona-Virus », Innenministerium (consulté le 30 novembre 2020)
  63. (sv) « Antal fall av covid-19 i Sverige – data uppdateras 11:30 och siffrorna är tillgängliga 14:00 », sur Public Health Agency of Sweden – Official statistics at arcgis (consulté le 30 novembre 2020) : « "Data updated daily at 11:30 [CEST]" »
  64. (en) « COVID-19 Dashboard », Ministry of Health and Population (Nepal) (consulté le 30 novembre 2020)
  65. « ar:فيروس كورونا المستجد (كوفيد-١٩) », corona.moh.gov.jo (consulté le 30 novembre 2020)
  66. « Tájékoztató oldal a koronavírusról Aktualis », koronavirus.gov.hu (consulté le 30 novembre 2020)
  67. (es) « Las cifras del COVID-19 en Ecuador » (consulté le 1er décembre 2020)
  68. (es) « Salud_Ec », sur Twitter, Ministerio de Salud Pública, (consulté le 1er décembre 2020)
  69. « Latest Information about COVID-19 in the Republic of Serbia », sur covid19.rs, Ministry of Health (Serbia) (consulté le 30 novembre 2020)
  70. « UAE CORONAVIRUS (COVID-19) UPDATES », sur UAE's national emergency crisis and disaster management authority (consulté le 30 novembre 2020)
  71. (es) « Ministerio de Salud de Panamá », sur Twitter, Ministry of Health (Panama), (consulté le 1er décembre 2020)
  72. (ja) « ja:新型コロナウイルス感染症の現在の状況と厚生労働省の対応について », sur Ministry of Health, Labour and Welfare (Japan),‎ (consulté le 30 novembre 2020)
  73. (es) « Datos Oficiales », sur Bolivia Segura, (consulté le 1er décembre 2020)
  74. « Homepage », Dominican Today (consulté le 30 novembre 2020)
  75. « COVID 19 Updates », sur corona.e.gov.kw (consulté le 30 novembre 2020)
  76. (bg) « bg:739 нови случая на коронавирусна инфекция са потвърдени у нас през последното денонощие », Ministry of Health (Bulgaria),‎ (consulté le 29 novembre 2020)
  77. « COVID-19 in Bulgaria », sur coronavirus.bg, (consulté le 30 novembre 2020)
  78. « Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) », Ministry of Public Health Qatar (consulté le 30 novembre 2020)
  79. (es) « Situacion Nacional Covid-19 », Ministerio de Salud (Costa Rica), (consulté le 1er décembre 2020)
  80. (ru) « Минздрав сообщил, сколько новых случаев COVID-19 за последние сутки », tut.by,‎ (lire en ligne)
  81. (hy) « hy:Հաստատված դեպքերն ըստ օրերի – NCDC Armenia »,‎ (consulté le 30 novembre 2020)
  82. « StopCOV.ge » (consulté le 30 novembre 2020)
  83. (ru) « ru:Ситуация с коронавирусом официально », sur coronavirus2020.kz, Kazinform,‎ (consulté le 1er décembre 2020)
  84. (kk) « kk:Қазақстан Республикасы Денсаулық сақтау министрлігі », Kazakhstan Ministry of Healthcare (consulté le 1er décembre 2020)
  85. « Službena stranica Vlade », Croatian Institute of Public Health (consulté le 30 novembre 2020)
  86. (ar) « ar:الجمهورية اللبنانية – وزارة اﻹعلام – الموقع الرسمي لمتابعة أخبار فيروس الكورونا في لبنان », Lebanese Ministry of Information (consulté le 30 novembre 2020)
  87. « Covid-19 cases in Oman », Ministry of Health (Oman), (consulté le 30 novembre 2020)
  88. (es) « Coronavirus », Ministerio de Salud Pública (Guatemala) (consulté le 30 novembre 2020)
  89. (az) « Azərbaycanda cari vəziyyət », sur koronavirusinfo.az, (consulté le 30 novembre 2020)
  90. (ar) « ar:وزيرة الصحة تتابع مستجدات فيروس كورونا وتوجه بتذليل أي تحديات لسير العمل بالمستشفيات », sur Facebook,‎ (consulté le 1er décembre 2020)
  91. (am) « Covid-19 », sur covid19.et, (consulté le 30 novembre 2020)
  92. (am) « Lia Tadesse », sur Twitter, Lia Tadesse, (consulté le 30 novembre 2020)
  93. (es) « Secretaría de Salud », sur Twitter, Secretary of Health (Honduras), (consulté le 1er décembre 2020)
  94. (es) « DATOS ESTADÍSTICOS COVID-19 », Secretaria de Salud de Honduras, (consulté le 1er décembre 2020)
  95. (ro) « COVID-19 în Republica Moldova: situaţia la zi », sur gismoldova.maps.arcgis.com (consulté le 30 novembre 2020)
  96. « Coronavirus (COVID-19) in the Slovak Republic in numbers », sur korona.gov.sk, National Health Information Center, (consulté le 30 novembre 2020)
  97. (el) « el:covid19 Ελλάδα »,‎
  98. (es) « Estadísticas Venezuela », MPPS COVID Patria, (consulté le 29 novembre 2020)
  99. (en) « Ministère de la santé وزارة الصحة », sur www.facebook.com (consulté le 30 novembre 2020)
  100. « Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Surveillance Dashboard (Myanmar) », sur doph.maps.arcgis.com (consulté le 30 novembre 2020)
  101. « COVID-19 in Bosnia and Herzegovina », Ministry of Civil Affairs of Bosnia and Herzegovina (consulté le 30 novembre 2020)
  102. « Covid-19 Updates », Ministry of Health (Bahrain), (consulté le 30 novembre 2020)
  103. (zh-CN) « zh:截至11月30日24时新型冠状病毒肺炎疫情最新情况 », National Health Commission,‎ (consulté le 1er décembre 2020)
  104. MOH_Kenya, « COVID-19 UPDATE », sur Twitter, (consulté le 30 novembre 2020)
  105. (ar) « ar:البوابة الجغرافية لمراقبة انتشار فيروس كورونا في ليبيا », sur ncdc.org.ly (consulté le 30 novembre 2020)
  106. (ar) « ar:#التحديث اليومي للوضع الوبائي المحلي لفيروس كورونا المستجد ليوم الأحد 29 نوفمبر 2020 م وفقا للبيان رقم », sur www.facebook.com (consulté le 30 novembre 2020)
  107. « COVID-19 : Carte épidémiologique », Ministry of Health, Population, and Hospital Reform (Algeria) (consulté le 30 novembre 2020)
  108. « Algeria COVID-19 Tracker », sur dz-covid19.com, (consulté le 30 novembre 2020)
  109. (es) « CONTADOR OFICIAL COVID-19 EN PARAGUAY », Ministry of Public Health and Social Welfare (Paraguay), (consulté le 1er décembre 2020)
  110. (da) « Tal og overvågning af COVID-19 », Sundhedsstyrelsen (Danish Health Authority), (consulté le 30 novembre 2020)
  111. (da) « Statens Serum Institut – COVID-19 – Danmark », Statens Serum Institut (State Serum Institute) (consulté le 30 novembre 2020)
  112. « Statistični pregled koronavirusa v Sloveniji », sur www.rtvslo.si (consulté le 30 novembre 2020)
  113. « Coronavirus disease COVID-19 », Ministry of Health (Slovenia) (consulté le 30 novembre 2020)
  114. (ru) « ru:Коронавирусная инфекция (COVID-19) », sur coronavirus.uz,‎ (consulté le 30 novembre 2020)
  115. « Latest updates on COVID-19 (Coronavirus) », Department of Health (Ireland),
  116. « Ireland's COVID-19 Data Hub - ICU, Acute Hospital & Testing Data », sur gov.ie, Department of Health (Ireland), (consulté le 29 novembre 2020)
  117. (ru) « ru:Информации », Ministry of Health (Kyrgyz Republic),‎ (consulté le 30 novembre 2020)
  118. « NCDC Covid-19 Page », Nigeria Centre for Disease Control (consulté le 1er décembre 2020)
  119. (ms) « Situasi Semasa Pandemik COVID-19 Di Malaysia », Ministry of Health (Malaysia), (consulté le 30 novembre 2020)
  120. (mk) « Real-time Coronavirus condition in North Macedonia », sur gdi.net (consulté le 30 novembre 2020)
  121. « Relevant information about Coronavirus (COVID-19) », Government of the Republic of Lithuania, (consulté le 1er décembre 2020)
  122. (lt) « Koronavirusas », Lietuvos Respublikos sveikatos apsaugos ministerija, (consulté le 1er décembre 2020)
  123. « Situation Report [Summary of Confirmed Cases by Status in the Past 14 Days] », Ministry of Health (Singapore), (consulté le 29 novembre 2020)
  124. « COVID-19 Updates », sur ghanahealthservice.org, (consulté le 29 novembre 2020)
  125. « Afghanistan Covid-19 Cases », Ministry of Public Health (Afghanistan),
  126. (sq) « Covid-19 », sur Koha Ditore, (consulté le 30 novembre 2020)
  127. (es) « SITUACIÓN NACIONAL », sur covid19.gob.sv, Ministry of Health (El Salvador), (consulté le 30 novembre 2020)
  128. (sq) « Lajme Archives », sur Ministria e Shëndetësisë dhe Mbrojtjes Sociale (consulté le 1er décembre 2020)
  129. (sq) « Coronavirus Albania Statistika », Agjencia Kombëtare e Shoqerisë së Informacionit (consulté le 1er décembre 2020)
  130. Av Sondre Nilsen, Oda Leraan Skjetne, Yasmin Sfrintzeris, Hanna Haug Røset, Carina Hunshamar, Sofie Fraser et Ole Løkkevik, « Live: Corona-viruset sprer seg i Norge og verden », sur VG Nett (consulté le 29 novembre 2020)
  131. (cnr) « Virus korona COVID 19 », {{Article}} : paramètre « périodique » manquant, paramètre « date » manquant (lire en ligne)
  132. « Coronavirus: COVID-19 », Government of Luxembourg, (consulté le 30 novembre 2020)
  133. « Coronavirus Disease-19, Republic of Korea », sur ncov.mohw.go.kr, Ministry of Health and Welfare (South Korea) (consulté le 1er décembre 2020)
  134. « Press Release », sur cdc.go.kr, Korea Disease Control and Prevention Agency (consulté le 1er décembre 2020)
  135. « Coronavirus (COVID-19) current situation and case numbers », sur Australian Government Department of Health, (consulté le 30 novembre 2020)
  136. « Varmistetut koronatapaukset Suomessa (COVID-19) », sur experience.arcgis.com (consulté le 29 novembre 2020)
  137. « STATISTIQUES COVID-19 », sur covid19.minsante.cm, (consulté le 20 octobre 2020)
  138. « Point Statistiques Covid 19 », sur Journal du Cameroun, (consulté le 27 novembre 2020)
  139. « Coronavirus (COVID-19) Sri Lanka - Analytics Dashboard », sur hpb.health.gov.lk (consulté le 30 novembre 2020)
  140. « Epidemiology Unit », Ministry of Health (Sri Lanka) (consulté le 30 novembre 2020)
  141. (en) « Ministère de la Santé et de l'Hygiène Publique », sur www.facebook.com (consulté le 28 novembre 2020)
  142. « MoH Uganda: COVID-19 Information Portal », sur covid19.gou.go.ug, Ministry of Health (consulté le 30 novembre 2020)
  143. « Ministry of Health Uganda », (consulté le 30 novembre 2020)
  144. ZMPublicHealth, « COVID19 update », sur Twitter,
  145. (en) « Ministry of Health Zambia », sur www.facebook.com, (consulté le 21 novembre 2020)
  146. (ar) The official page of the Federal Ministry of Health, Sudan (@FMOH_SUDAN), « التقرير الوبائي التراكمي ليومي الأربعاء 25 والخميس 26 نوفمبر 2020م », sur Twitter,‎
  147. (en) « ar:التقرير الوبائي التراكمي ليوم السبت 28 نوفمبر 2020م », sur www.facebook.com,‎ (consulté le 30 novembre 2020)
  148. (en) « Situation Covid-19 », Ministry of Public Health (Madagascar), (consulté le 26 novembre 2020)
  149. (lv) « Covid-19 izplatība Latvijā », sur covid19.gov.lv, (consulté le 30 novembre 2020)
  150. « Coronavirus : Riposte à l'épidémie : Tableau Récapitulatif des dons" », Ministry of Health and Social Action (Senegal), (consulté le 28 novembre 2020)
  151. (pt) « Início », sur covid19.ins.gov.mz, (consulté le 1er décembre 2020)
  152. (pt) « Covid-19 Angola », angop.ao,‎ (lire en ligne)
  153. « Facebook », sur www.facebook.com (consulté le 28 novembre 2020)
  154. Agence Nationale de Sécurité Sanitaire (@anss_guinee), « COVID-19 Decompte des cas », sur Twitter,
  155. « Situation du coronavirus en Guinée », Agence Nationale de Sécurité Sanitaire, (consulté le 28 novembre 2020)
  156. « Health Protection Agency Maldives – COVID-19 Statistics Dashboard », (consulté le 28 novembre 2020)
  157. « Situation Épidémiologique en RDC », sur stopcoronavirusrdc.info, (consulté le 28 novembre 2020)
  158. (ru) « COVID-19. Дар Тоҷикистон 95,0% гирифторони коронавируси нав шифо ёфтанд » (consulté le 28 novembre 2020)
  159. « Information about Coronavirus disease COVID-19 », Estonian Health Board (consulté le 30 novembre 2020)
  160. « Koroonaviiruse andmestik », Estonian Health Board (consulté le 30 novembre 2020)
  161. « COVID 19 — Corona Vírus », sur covid19.cv (consulté le 28 novembre 2020)
  162. « COVID-19 », sur Ministry of Health & Wellness, Jamaica (consulté le 28 novembre 2020)
  163. « COVID-19 Clinical Management Summary », sur Ministry of Health & Wellness, Jamaica (consulté le 28 novembre 2020)
  164. « Covid-19 Cyprus », sur covid19.ucy.ac.cy (consulté le 28 novembre 2020)
  165. (en-GB) « Coronavirus: 111 cases on Monday, record 85 patients in hospital (updated) », Cyprus Mail,‎ (lire en ligne)
  166. MoHCCZim, « COVID-19 update: As at 28 November 2020, Zimbabwe had 9 822 confirmed cases, including 8 472 recoveries and 275 deaths. », sur Twitter,
  167. « COVID-19 Malta – Data Dashboard », sur deputyprimeminister.gov.mt (consulté le 30 novembre 2020)
  168. « Official COVID-19 figures », Ministry of Health (Malta), (consulté le 30 novembre 2020)
  169. « Visualisez en temps réel l'évolution du Coronavirus en Haïti », sur coronahaiti.org, (consulté le 28 novembre 2020)
  170. « Situations Épidémiologique au Gabon », sur infocovid.ga, Comité de Pilotage du Plan de Veille, (consulté le 28 novembre 2020)
  171. « COVID-19 Botswana Dashboard », sur covid19portal.gov.bw, Government of Botswana, (consulté le 28 novembre 2020)
  172. « COVID-19 Rapport de situation », sur Ministère de la santé (consulté le 30 novembre 2020)
  173. (ar) « COVID-19 Rapport de situation », sur essahraa.net (consulté le 30 novembre 2020)
  174. (es) « Infecciones por coronavirus – COVID-19 », sur temas.sld.cu, (consulté le 1er décembre 2020)
  175. « Health Ministry: 80 new Coronavirus cases registered, 55 patients recover, 5 pass away », (consulté le 28 novembre 2020)
  176. « Novel Coronavirus (2019-nCoV) », Ministry of Health (Bahamas) (consulté le 28 novembre 2020)
  177. (en) « The Bahamas Ministry of Health », sur www.facebook.com (consulté le 28 novembre 2020)
  178. (ca) « Actualitat coronavirus », sur www.govern.ad, Govern d'Andorra (consulté le 30 novembre 2020)
  179. « COVID-19 (Novel Coronavirus) » (consulté le 29 novembre 2020)
  180. « ArcGIS Dashboards », sur uwi.maps.arcgis.com (consulté le 28 novembre 2020)
  181. Eswatini Government, « Minister of Health Lizzie Nkosi's #COVID19 update », sur @EswatiniGovern1, (consulté le 28 novembre 2020)
  182. « Coronavirus Disease (COVID-19) in HK », Hong Kong, Department of Health, (consulté le 28 novembre 2020)
  183. « Covid 19 National Information Dashboard », Ministry of Health and Population (Malawi), (consulté le 1er décembre 2020)
  184. « Coronavirus Disease COVID-19 », Rwanda Biomedical Centre (consulté le 28 novembre 2020)
  185. Rwanda Ministry of Health (@RwandaHealth), « Amakuru Mashya Update », sur Twitter,
  186. (es) « Nicaragua acumula 5,784 casos y 160 muertes por Covid-19 », sur La Prensa (consulté le 24 novembre 2020)
  187. (en) « WHO daily Report », sur www.who.int (consulté le 28 novembre 2020)
  188. « MINISTERE DE LA SANTE, DE LA POPULATION, DE LA PROMOTION DE LA FEMME ET DE L'INTEGRATION DE LA FEMME AU DEVELOPPEMENT », sur www.sante.gouv.cg (consulté le 31 octobre 2020)
  189. « Ministere de la Santé de Djibouti », sur www.facebook.com, (consulté le 28 novembre 2020)
  190. « Office of Director of Health Services », sur Facebook (consulté le 28 novembre 2020)
  191. (es) « Visualizador de casos coronavirus COVID-19 en Uruguay », sur Sistema Nacional de Emergencias (consulté le 1er décembre 2020)
  192. (es) « Comunicados », sur Sistema Nacional de Emergencias (consulté le 1er décembre 2020)
  193. (is) « COVID-19 á Íslandi – Tölfræði », sur www.covid.is (consulté le 28 novembre 2020)
  194. « Thirty new COVID cases reported today », sur Stabroek News (consulté le 1er décembre 2020)
  195. (nl) « COVID-19 », sur COVID SURINAME (consulté le 1er décembre 2020)
  196. (es) « Covid 19 de Guinea Ecuatorial », sur Guinea Ecuatorial Salud (consulté le 31 octobre 2020)
  197. (en) « WHO daily Report », sur www.who.int (consulté le 21 novembre 2020)
  198. Ministère de la Santé et de la Population (@MSPCentrafrique), « Communiqué de Presse », sur Twitter,
  199. « COVID-19 DASHBOARD, Somalia », Ministry of Health (Somalia), (consulté le 25 novembre 2020)
  200. « COMMUNIQUES DU MINISTERE DE LA SANTE ET DES AFFAIRES SOCIALES SUR LE SUIVI DES ACTIONS DE PREVENTION ET DE RIPOSTE FACE A LA MALADIE A CORONAVIRUS. », sur www.sante.gov.ml, (consulté le 24 novembre 2020)
  201. « COVID-19 Outbreak », sur Bangkok Post (consulté le 1er décembre 2020)
  202. « The Gambia COVID-19 Outbreak Situational Report », Ministry of Health (The Gambia), (consulté le 24 novembre 2020)
  203. (en) @SouthSudanGov, « South Sudan now has a cumulative total of 194 cases with 2 recoveries », sur twitter.com, (consulté le 8 juin 2020)
  204. (en) « Coronavirus disease (COVID-2019) situation reports », sur who.int (consulté le 24 novembre 2020)
  205. « Coronavirus (Covid-19) », sur Gouvernement de la République du Bénin (consulté le 9 novembre 2020)
  206. « Benin: WHO Coronavirus Disease (COVID-19) Dashboard », sur covid19.who.int (consulté le 12 novembre 2020)
  207. « Coronavirus au Togo » (consulté le 14 novembre 2020)
  208. (en) « Ministère de la Santé – Burkina Faso », sur www.facebook.com (consulté le 4 juin 2020)
  209. « TABLEAU DE BORD COVID-19 », Ministry of Health (Burkina Faso) (consulté le 14 novembre 2020)
  210. (pt-BR) « INÍCIO », sur INFOCOVID-19 (consulté le 20 octobre 2020)
  211. « Guinea-Bissau: WHO Coronavirus Disease (COVID-19) Dashboard », sur covid19.who.int (consulté le 9 novembre 2020)
  212. « The Ministry of Information and Communication – Sierra Leone », sur www.facebook.com (consulté le 30 novembre 2020)
  213. « COVID-19 UPDATES », sur covid19.mic.gov.sl, (consulté le 30 novembre 2020)
  214. YSNEC_COVID19, « ar:آخر إحصائيات انتشار فيروس #كورونا في #اليمن #معا_لمواجهة_كورونا », sur Twitter,‎
  215. « Lesotho COVID-19 UPDATES » (consulté le 2 octobre 2020)
  216. nacosec, « Lesotho COVID-19 Statistics », sur Twitter,
  217. « COVID-19 – current cases », Ministry of Health (New Zealand) (consulté le 28 novembre 2020)
  218. (en) « Ministère de la Santé Publique du Tchad », sur www.facebook.com, (consulté le 24 novembre 2020)
  219. « Aggiornamento Dati Epidemia COVID-19 a San Marino al 30 novembre 2020 », sur www.iss.sm (consulté le 30 novembre 2020)
  220. « Situation du coronavirus », sur coronavirus.ne, (consulté le 28 novembre 2020)
  221. « National Public Health Institute of Liberia-NPHIL », sur www.facebook.com (consulté le 9 novembre 2020)
  222. (vi) « Trang Tin Về Dịch Bệnh Viêm Đường Hô Hấp Cấp Covid-19 », Ministry of Health (Vietnam), (consulté le 28 novembre 2020)
  223. (de) « Ministerium für Gesellschaft », (consulté le 30 novembre 2020)
  224. « Situação Actual em São Tomé e Príncipe » (consulté le 28 novembre 2020)
  225. (ja) « ja:国内感染者1万6395人 死者773人(クルーズ船除く)新型コロナ », sur nhk.or.jp,‎
  226. (en) « How lax rules, missed warnings led to Japan's second coronavirus cruise-ship hot spot », sur Reuters, (consulté le 9 mai 2020)
  227. (mn) « Covid-19 in Mongolia », Ministry of Health (Mongolia), (consulté le 28 novembre 2020)
  228. « COVID-19 (SARS-CoV-2 Infection) », Taiwan Centers for Disease Control, (consulté le 30 novembre 2020)
  229. « Official Covid-19 website », sur covid19.info.gov.pg, (consulté le 28 novembre 2020)
  230. « Les Comores comptent déjà 596 cas de Coronavirus », sur Comores-Infos (consulté le 23 novembre 2020)
  231. Burundi Government (@BurundiGov), « Mise à jour de la situation épidémiologique de la #COVIDー19 au 25 Oct 2020 », sur Twitter,‎ (consulté le 25 octobre 2020)
  232. « Covid-19 : 8 nouveaux cas positifs et 10 guérisons ce jeudi 19 novembre », Government of the Principality of Monaco, (consulté le 19 novembre 2020)
  233. « Announcement from the Ministry of Health », sur www.shabait.com, (consulté le 2 novembre 2020)
  234. (en-US) « Covid19 | Coronavirus Mauritius », sur covid19 (consulté le 9 novembre 2020)
  235. « COVID-19 IN BHUTAN », Government of Bhutan (consulté le 30 novembre 2020)
  236. « COVID-19 Tracking System », Ministry of Health (Cambodia), (consulté le 1er décembre 2020)
  237. « Cambodia records its first COVID-19 community outbreak with family of six tested positive », Khmer Times, (consulté le 29 novembre 2020)
  238. « {{{1}}} »
  239. (en) « COVID-19 Update: One New Case  », sur Governemental Information Service (consulté le 30 octobre 2020).
  240. « COVID-19 in Seychelles », sur Department of Health (consulté le 24 novembre 2020)
  241. « COVID-19 LOCAL SITUATION », Department of Health, (consulté le 24 novembre 2020)
  242. « Media Statement on the Current Situation of COVID-19 in Brunei Darussalam » [PDF], Ministry of Health (Brunei), (consulté le 22 octobre 2020)
  243. « COVID-19 Hub », The Scoop (consulté le 22 octobre 2020)
  244. « Government of Antigua and Barbuda » (consulté le 1er novembre 2020)
  245. « COVID19.gov.ag » (consulté le 28 novembre 2020)
  246. « COVID-19 Report As At November 30th, 2020 », The Government of Saint Vincent and the Grenadines, (consulté le 30 novembre 2020)
  247. « One New COVID-19 Case From USA », sur National Emergency Management Organisation (NEMO), (consulté le 28 novembre 2020)
  248. « November 21st, commonwealth of Dominica coronavirus update », sur Ministry of Health, Wellness and New Health Investment Response to COVID-19, Government of the Commonwealth of Dominica, (consulté le 25 novembre 2020)
  249. « LIVE: Ministry of Health COVID-19 update 18th November 2020 », sur Dominica News Online, Duravision Inc, (consulté le 19 novembre 2020)
  250. « Special webpage against Epidemics », sur www.ssm.gov.mo, (consulté le 15 octobre 2020)
  251. « GIS – Government Information Service of Grenada », sur www.facebook.com (consulté le 27 octobre 2020)
  252. « Health official scolds families as Covid-19 case #25 confirmed », NOW Grenada, (consulté le 15 octobre 2020)
  253. (en) « Lao People's Democratic Republic: WHO Coronavirus Disease (COVID-19) Dashboard », sur covid19.who.int (consulté le 27 novembre 2020)
  254. (lo) « ຄະນະສະເພາະກິດເພື່ອປ້ອງກັນ, ຄວບຄຸມ ແລະ ແກ້ໄຂການລະບາດ: ຂອງພະຍາດອັກເສບປອດ ຈາກເຊື້ອຈຸລະໂລກສາຍພັນໃຫມ່ (COVID-19) », sur covid19.gov.la, Laos Coronavirus Task Force,‎ (consulté le 17 novembre 2020)
  255. « COVID-19 UPDATES », sur Ministry of Health and Medical Services (Fiji) (consulté le 1er décembre 2020)
  256. « Four new border quarantine COVID-19 cases », sur Fiji Broadcasting Corporation (consulté le 30 novembre 2020)
  257. (tet) « COVID-19: Timor-Leste rejects kazu foun, dahuluk dezde loron 15 Maiu », {{Article}} : paramètre « périodique » manquant, paramètre « date » manquant (lire en ligne)
  258. « Le ministère de la Santé publique confirme qu'il continue de respecter les mesures préventives », sur Sahara Press Service (consulté le 25 septembre 2020).
  259. « Dichiarazione del Direttore della Sala Stampa della Santa Sede, Matteo Bruni, 06.06.2020 », sur Officialthe Holy See website (consulté le 7 juin 2020)
  260. « Vaticano, nuovo caso di positività al Covid-19 », sur vaticannews.va (consulté le 17 octobre 2020)
  261. (en-US) « GOVERNMENT OF ST. KITTS AND NEVIS – COVID – 19 UPDATES » (consulté le 27 novembre 2020)
  262. « National Statistics », Government of St. Kitts and Nevis, (consulté le 17 octobre 2020)
  263. « services médicaux du ministère de la santé ».
  264. (en) « Deal is done: Cruise ship with sick passengers and sister ship will be allowed to dock in Florida », sur NBC News (consulté le 2 avril 2020)
  265. (en) « Indonesian crew member of virus-hit Zaandam cruise ship dies in Florida », sur South China Morning Post, (consulté le 11 avril 2020)
  266. « Coronavirus: les îles Marshall isolées enregistrent les premiers cas ».
  267. (en) « Vanuatu doubles quarantine period, halts domestic travel to Efate », RNZ,‎ (lire en ligne)
  268. (en) « Samoa records first positive Covid test result », RNZ,‎ (lire en ligne)
  269. « Covid-19: Tanzania updates will resume after improvements at national laboratory », THECITIZEN (consulté le 8 mai 2020)
  270. « Zanzibar confirms 29 new cases, plus 11 recoveries », ippmedia.com (consulté le 8 mai 2020)
  271. « S'informer sur le Coronavirus », sur popsciences.universite-lyon (consulté le 1er avril 2020).
  272. Zhu N., Zhang D., Wang W. et al., « A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019. », The New England Journal of Medicine, vol. 382, no 8,‎ , p. 727-733 (PMID 31978945, PMCID PMC7092803, DOI 10.1056/NEJMoa2001017).
  273. Jacobson E.R (2007) Infectious Diseases and Pathology of Reptiles; CRC Press, Taylor & Francis Group: Boca Raton, FL, États-Unis ; p. 33487–2742 (lien Google Livre)
  274. (en) K. Yagami, K. Hirai et N. Hirano, « Pathogenesis of haemagglutinating encephalomyelitis virus (HEV) in mice experimentally infected by different routes », Journal of Comparative Pathology, vol. 96, no 6,‎ , p. 645–657 (PMID 3546411, PMCID PMC7130377, DOI 10.1016/0021-9975(86)90061-7, lire en ligne, consulté le 17 mai 2020)
  275. a et b (en) Susan J. Bender et Susan R. Weiss, « Pathogenesis of Murine Coronavirus in the Central Nervous System », Journal of Neuroimmune Pharmacology, vol. 5, no 3,‎ , p. 336–354 (ISSN 1557-1890 et 1557-1904, PMID 20369302, PMCID PMC2914825, DOI 10.1007/s11481-010-9202-2, lire en ligne, consulté le 17 mai 2020)
  276. (en) Timothy J Cowley et Susan R Weiss, « Murine coronavirus neuropathogenesis: determinants of virulence », Journal of NeuroVirology, vol. 16, no 6,‎ , p. 427–434 (ISSN 1355-0284 et 1538-2443, DOI 10.1007/BF03210848, lire en ligne, consulté le 17 mai 2020)
  277. Lane, Thomas E et Martin P Hosking. 2010. « The pathogenesis of murine coronavirus infection of the central nervous system. » Critical reviews in immunology 30 (2): 119‐30.
  278. (en) Fang Li, Wenhui Li, Michael Farzan et Stephen C. Harrison, « Structure of SARS Coronavirus Spike Receptor-Binding Domain Complexed with Receptor », Science, vol. 309, no 5742,‎ , p. 1864-1868 (PMID 16166518, DOI 10.1126/science.1116480, JSTOR 3843779, Bibcode 2005Sci...309.1864L, lire en ligne, consulté le 25 janvier 2020)
  279. (en) Thomas C. Holland, Neurovirology in Handbook of Clinical Neurology, 2014 lire en ligne
  280. (en) Fehr, Anthony R, Stanley Perlman. “Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis.” Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) vol. 1282 (2015): 1-23. doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1 lire en ligne
  281. Cascella M, Rajnik M, Cuomo A, et al. Features, Evaluation and Treatment Coronavirus (COVID-19), in: StatPearls [Internet], StatPearls Publishing, Treasure Island (Floride), janvier 2020, mis à jour le 8 mars 2020 lire en ligne
  282. (en) Shuo Su et Gary Wong, « Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses », sur Trends in Microbiology, (DOI 10.1016/j.tim.2016.03.003, consulté le 23 mai 2020), p. 490–502
  283. (en) Lok-Yin Roy Wong et Pak-Yin Lui, « A molecular arms race between host innate antiviral response and emerging human coronaviruses », sur Virologica Sinica, (ISSN 1674-0769, PMID 26786772, PMCID PMC7090626, DOI 10.1007/s12250-015-3683-3, consulté le 23 mai 2020), p. 12–23
  284. (en) Shuo Su et Gary Wong, « Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses », sur Trends in Microbiology, (PMID 27012512, PMCID PMC7125511, DOI 10.1016/j.tim.2016.03.003, consulté le 23 mai 2020), p. 490–502
  285. (en) Ping-Kun Hsieh, Shin C. Chang, Chu-Chun Huang et Ting-Ting Lee, « Assembly of severe acute respiratory syndrome coronavirus RNA packaging signal into virus-like particles is nucleocapsid dependent », Journal of Virology, vol. 79, no 22,‎ , p. 13848–13855 (ISSN 0022-538X, PMID 16254320, PMCID 1280188, DOI 10.1128/JVI.79.22.13848-13855.2005, lire en ligne, consulté le 13 mars 2020).
  286. (en) CDC, « Human Coronavirus Types », sur Center for Disease Control Prevention (consulté le 22 janvier 2020).
  287. (en) « Prevalence and genetic diversity analysis of human coronaviruses among cross-border children », Virology Journal, vol. 14, no 1,‎ , p. 230 (PMID 29166910, PMCID 5700739, DOI 10.1186/s12985-017-0896-0).
  288. « Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis », Methods in Molecular Biology, vol. 1282,‎ , p. 1–23 (ISBN 978-1-4939-2437-0, PMID 25720466, PMCID 4369385, DOI 10.1007/978-1-4939-2438-7_1).
  289. a et b L'hypothèse du pangolin javanais comme hôte intermédiaire du coronavirus
  290. Coronavirus Disease (COVID-19 cdc.gov, consulté le 02 mars 2020.
  291. « MERS-CoV », Institut Pasteur, (consulté le 29 janvier 2020).
  292. (en-US) CDC, « Middle East Respiratory Syndrome (MERS) », sur Centers for Disease Control and Prevention, (consulté le 29 janvier 2020).
  293. « SRAS », Institut Pasteur, (consulté le 29 janvier 2020).
  294. O.M.S, « Syndrome aiguë respiratoire », sur O.M.S (consulté le 29 janvier 2020).
  295. (en-US) « SARS | Home | Severe Acute Respiratory Syndrome | SARS-CoV Disease | CDC », sur www.cdc.gov, (consulté le 29 janvier 2020).
  296. a b c et d Vincent J. Munster, Marion Koopmans, Neeltje van Doremalen et Debby van Riel, « A Novel Coronavirus Emerging in China — Key Questions for Impact Assessment », The New England Journal of Medicine, vol. 382, no 8,‎ , p. 692–694 (ISSN 0028-4793, DOI 10.1056/NEJMp2000929, lire en ligne, consulté le 3 mars 2020).
  297. a b et c Organisation mondiale de la santé, "Consensus document on the epidemiology of severe acute respiratory syndrome (SARS)", 2003, page 15.
  298. (en) Huijun Chen, Juanjuan Guo, Chen Wang et Fan Luo, « Clinical characteristics and intrauterine vertical transmission potential of COVID-19 infection in nine pregnant women: a retrospective review of medical records », The Lancet, vol. 395, no 10226,‎ , p. 809–815 (ISSN 0140-6736 et 1474-547X, PMID 32151335, DOI 10.1016/S0140-6736(20)30360-3, lire en ligne, consulté le 27 mars 2020).
  299. Corwin A. Robertson, Sara A. Lowther, Thomas Birch et Christina Tan, « SARS and Pregnancy: A Case Report », Emerging Infectious Diseases, vol. 10, no 2,‎ , p. 345–348 (ISSN 1080-6040 et 1080-6059, PMID 15030710, PMCID PMC3322896, DOI 10.3201/eid1002.030736, lire en ligne, consulté le 15 avril 2020)
  300. (en) Kimberly A. Lackey, Ryan M. Pace, Janet E. Williams et Lars Bode, « SARS-CoV-2 and human milk: what is the evidence? », medRxiv,‎ , p. 2020.04.07.20056812 (DOI 10.1101/2020.04.07.20056812, lire en ligne, consulté le 15 avril 2020)
  301. Étude du Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, de Baltimore associée à School of Public Health and Health Sciences du Massachusetts, et à la Ludwig-Maximilians-Universität de Munich.
  302. a et b (en) David L. Swerdlow et Lyn Finelli, « Preparation for Possible Sustained Transmission of 2019 Novel Coronavirus: Lessons From Previous Epidemics », JAMA,‎ (ISSN 0098-7484, DOI 10.1001/jama.2020.1960, lire en ligne, consulté le 12 février 2020).
  303. « Le taux de reproduction de COVID-19 est plus élevé que celui du SRAS ».
  304. https://www.lemonde.fr/les-decodeurs/article/2020/02/06/coronavirus-une-affiche-du-ministere-ecarte-trop-vite-le-risque-de-contagion-lors-de-l-incubation_6028658_4355770.html
  305. (en) Smriti Mallapaty, « What the cruise-ship outbreaks reveal about COVID-19 », Nature,‎ , d41586–020–00885-w (ISSN 0028-0836 et 1476-4687, DOI 10.1038/d41586-020-00885-w, lire en ligne, consulté le 27 mars 2020).
  306. « Coronavirus : la maladie pourrait aussi se transmettre par voie fécale », sur www.pourquoidocteur.fr (consulté le 17 mars 2020).
  307. « Coronavirus : L’OMS indique que le taux de mortalité est de 3,4 % », Intellivoire,‎ (lire en ligne, consulté le 5 mars 2020).
  308. a b c d e et f (en) Jie Cui, Fang Li et Zheng-Li Shi, « Origin and evolution of pathogenic coronaviruses », Nature Reviews Microbiology, vol. 17, no 3,‎ , p. 181–192 (ISSN 1740-1534, DOI 10.1038/s41579-018-0118-9, lire en ligne, consulté le 17 mars 2020).
  309. Coronavirus disease (COVID-19) advice for the public, OMS, 2020.
  310. « Coronavirus – informations et conseils », sur Centre de vaccinations internationales Air France (consulté le 13 mars 2020).
  311. Stockman LJ, Bellamy R, Garner P. SARS: systematic review of treatment effects. PLoS Med. 2006;3:e343. doi:10.1371/journal.pmed.0030343
  312. Zhu, M. 2004. SARS immunity and vaccination. Cell. Mol. Immunol. 1:193-198
  313. coronavirus Study Group ou CSG
  314. Gorbalenya A.E & a. (2020) Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: The species and its viruses – a statement of the Coronavirus Study Group. bioRxiv, https://www.biorxiv. org/content/10.1101/2020.02.07.937862v1.full.pdf.
  315. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, Oxford, Elsevier, , 806–828 p. (ISBN 978-0-12-384684-6), « Family Coronaviridae ».
  316. International Committee on Taxonomy of Viruses, « ICTV Master Species List 2009 – v10 » [xls], .
  317. a b et c Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H, [...] Tan W, 2020. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet doi: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8.
  318. (en) Kerstin Erles, Kai-Biu Shiu et Joe Brownlie, « Isolation and sequence analysis of canine respiratory coronavirus », Virus Research, vol. 124, no 1,‎ , p. 78–87 (ISSN 0168-1702, DOI 10.1016/j.virusres.2006.10.004, lire en ligne, consulté le 17 mars 2020).
  319. (en) Kerstin Erles, Crista Toomey, Harriet W Brooks et Joe Brownlie, « Detection of a group 2 coronavirus in dogs with canine infectious respiratory disease », Virology, vol. 310, no 2,‎ , p. 216–223 (ISSN 0042-6822, DOI 10.1016/S0042-6822(03)00160-0, lire en ligne, consulté le 17 mars 2020).
  320. (en) « Virus taxonomy: 2018b release », sur ICTV online, (consulté le 24 janvier 2020).

Voir aussi

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Bibliographie

  • (en) Christine V.F. Carrington, Jerome E. Foster, Hua Chen Zhu, Jin Xia Zhang, Gavin J.D. Smith, Nadin Thompson, Albert J. Auguste, Vernie Ramkissoon, Abiodun A. Adesiyun et Yi Guan, « Detection and Phylogenetic Analysis of Group 1 Coronaviruses in South American Bats », Emerging Infectious Diseases journal, Centers for Disease Control and Prevention, vol. 14, no 12,‎ , p. 1890-1893 (DOI 10.3201/eid1412.080642, lire en ligne)
  • Habibzadeh P, Stoneman EK "The Novel Coronavirus: A Bird's Eye View". The International Journal of Occupational and Environmental Medicine. 11 (2): 65–71. doi:10.15171/ijoem.2020.1921. (résumé).
  • Saif, L. J., Wang, Q., Vlasova, A. N., Jung, K., & Xiao, S. (2019). Coronaviruses. Diseases of swine, 488-523.
  • Nathalie Kin et Astrid Vabret, « Les infections à coronavirus humains », sur Revue Francophone des Laboratoires, (PMID 32288826, PMCID PMC7140280, DOI 10.1016/S1773-035X(16)30369-0, consulté le 22 mai 2020), p. 25–33

Infographie

Articles connexes

Liens externes