ARN polymérase ARN-dépendante

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L'ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp, RDR), parfois appelée ARN réplicase, est une nucléotidyltransférase qui catalyse la réaction :

nucléoside triphosphate + ARNn    PPi + ARNn+1.

Cette enzyme catalyse la réplication de l'ARN, contrairement à une ARN polymérase typique qui catalyse la biosynthèse d'un brin d'ARN à partir d'une matrice d'ADN. Elle catalyse donc la synthèse d'un brin d'ARN complémentaire à partir d'un brin d'ARN servant de matrice. Elle est indispensable à la réplication des virus à ARN à polarité négative sans étape à ADN[2],[3], c'est-à-dire aux groupes III à V de la classification Baltimore :

L'amorçage de la réaction a lieu à proximité de l'extrémité 3' du brin d'ARN modèle. Il peut s'agir d'un amorçage de novo (sans amorce) ou à l'aide d'une protéine virale liée au génome utilisée comme amorce. L'amorçage de novo consiste en l'addition d'un nucléoside triphosphate au 3'–OH du premier nucléoside triphosphate d'amorçage ; cette réaction est répétée par la suite au cours de la phase d'élongation avec d'autres nucléotides triphosphates afin de produire un brin d'ARN qui soit complémentaire du brin d'ARN modèle[4].

Notes et références[modifier | modifier le code]

  1. (en) Masato Akutsu, Yu Ye, Satpal Virdee, Jason W. Chin et David Komander, « Molecular basis for ubiquitin and ISG15 cross-reactivity in viral ovarian tumor domains », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 108, no 6,‎ , p. 2228-2233 (PMID 21266548, PMCID 3038727, DOI 10.1073/pnas.1015287108, lire en ligne)
  2. (en) E.V. Koonin, A.E. Gorbalenya et K.M. Chumakova, « Tentative identification of RNA-dependent RNA polymerases of dsRNA viruses and their relationship to positive strand RNA viral polymerases », FEBS Letters, vol. 252, no 1-2,‎ , p. 42-46 (PMID 2759231, DOI 10.1016/0014-5793(89)80886-5, lire en ligne)
  3. (en) P. M. Zanotto, M. J. Gibbs, E. A. Gould et E. C. Holmes, « A reevaluation of the higher taxonomy of viruses based on RNA polymerases », Journal of Virology, vol. 70, no 9,‎ , p. 6083-6096 (PMID 8709232, PMCID 190630, lire en ligne)
  4. (en) C.Cheng Kao, Paul Singh et David J. Ecker, « De Novo Initiation of Viral RNA-Dependent RNA Synthesis », Virology, vol. 287, no 2,‎ , p. 251-260 (PMID 11531403, DOI 10.1006/viro.2001.1039, lire en ligne)