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La Côte-d'Or compte 16 sites classés Natura 2000[1].
Site Natura 2000
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Numéro
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Communes
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Superficie (hectares)
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Photo
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Milieux forestiers et pelouses des combes de la Cote dijonnaise
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FR2600956
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1228
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Milieux forestiers, prairies et pelouses de la vallée du Suzon
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FR2600957
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2790
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Milieux forestiers, pelouses et marais des massifs de Moloy, La Boniere et Lamargelle
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FR2600958
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330
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Milieux forestiers du Chatillonnais avec marais tufeux et sites a sabot de Venus
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FR2600959
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3377
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Massifs forestiers de Francheville, d'Is-sur-tille et des Laverottes
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FR2600960
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428
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Marais tufeux du Châtillonnais
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FR2600963
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97
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Pelouses et forêts calcicoles de la côte et arrière côte de Beaune
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FR2600973
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1765
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Étangs à littorelles et queues marécageuses, prairies marécageuses et paratourbeuses du Nord Morvan
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FR2600992
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978
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Forêts, pelouses, éboulis de la vallée du Rhoin et du ravin d'Antheuil
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FR2601000
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1228
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Forêt de ravin à la source tufeuse de l'Ignon
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FR2601002
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77
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Éboulis calcaires de la vallée de l'Armançon
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FR2601004
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214
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Gîtes et habitats à chauves-souris en Bourgogne
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FR2601012
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Avosnes, Boux-sous-Salmaise, Brain, Bussy-la-Pesle, Champrenault, Charencey, Chevannay, Dampierre-en-Montagne, Drée, Gissey-sous-Flavigny, Hauteroche, Jailly-les-Moulins, Marcellois, Massingy-lès-Vitteaux, Posanges, Roche-Vanneau, Saffres, Saint-Anthot, Saint-Hélier, Saint-Jean-de-Losne, Saint-Mesmin, Thenissey, Verrey-sous-Drée, Verrey-sous-Salmaise, Villeberny, Villeferry, Villy-en-Auxois et sur une partie du territoire des communes suivantes : Alise-Sainte-Reine, Arnay-le-Duc, Arnay-sous-Vitteaux, Athée, Aubigny-lès-Sombernon, Auxonne, Baigneux-les-Juifs, Blaisy-Bas, Blaisy-Haut, Blancey, Bligny-le-Sec, Boussey, Brazey-en-Plaine, Bussy-le-Grand, Chambeire, Chambolle-Musigny, Chassey, Civry-en-Montagne, Corpoyer-la-Chapelle, Darcey, Duesme, Flagey-Echézeaux, Flavigny-sur-Ozerain, Foissy, Frôlois, Gilly-lès-Cîteaux, Gissey-le-Vieil, Grosbois-en-Montagne, Grésigny-Sainte-Reine, Jancigny, Labergement-Foigney, Lamarche-sur-Saône, Longchamp, Losne, Marcilly-Ogny, Marcilly-et-Dracy, Marigny-le-Cahouët, Maxilly-sur-Saône, Mimeure, Motte-Ternant, Ménétreux-le-Pitois, Nuits-Saint-Georges, Orret, Poiseul-la-Ville-et-Laperrière, Poncey-lès-Athée, Pouillenay, Premières, Quemigny-sur-Seine, Saint-Prix-lès-Arnay, Saint-Sauveur, Saint-Symphorien-sur-Saône, Saint-Usage, Sainte-Colombe, Salmaise, Saulieu, Savigny-lès-Beaune, Savigny-sous-Mâlain, Sombernon, Source-Seine, Soussey-sur-Brionne, Sussey, Talmay, Thoisy-la-Berchère, Tillenay, Trouhaut, Turcey, Uncey-le-Franc, Venarey-les-Laumes, Vesvres, Vic-sous-Thil, Vieilmoulin, Villargoix, Villers-les-Pots, Villiers-le-Duc, Villotte-Saint-Seine, Vitteaux, Vonges, Vougeot, Echenon, Eguilly[2]
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63405
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Forêt de Cîteaux et environs
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FR2601013
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13284
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