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Haplogroupe O

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Distribution de l'haplogroupe O de l'ADN-Y.

L'haplogroupe O, également connu sous le nom de O-M175, est un haplogroupe d'ADN du chromosome Y humain. On le trouve principalement parmi les populations d'Asie du Sud-Est et d'Asie de l'Est. On le trouve également dans divers pourcentages des populations de l'Extrême-Orient russe, de l'Asie du Sud, de l'Asie centrale, du Caucase, de la Crimée, de l'Ukraine, de l'Iran, de l'Océanie, de Madagascar et des Comores. L'haplogroupe O est un descendant primaire de l'haplogroupe NO-M214.

L'haplogroupe O-M175 est très courant chez les hommes de Chine, de Corée et d'Asie du Sud-Est. Il a deux branches principales : O1 (O-F265) et O2 (O-M122). O1 se trouve à des fréquences élevées chez les mâles originaires d'Asie du Sud-Est, de Taïwan, du Japon, de la péninsule coréenne, de Madagascar et de certaines populations du sud de la Chine et des locuteurs austroasiatiques de l'Inde. Elle est élevée dans les populations mélanésiennes des îles Salomon et des Moluques, et présente des fréquences significatives à élevées dans certaines populations de Papous et de Papouasie-Nouvelle-Guinée. L'O2 se trouve à des niveaux élevés parmi les Chinois Han, les populations tibéto-birmanes (dont beaucoup de celles du Yunnan, du Tibet, de Birmanie, du nord-est de l'Inde et du Népal), les Mandchous, les Mongols, les Coréens, les Vietnamiens, les Malais, les Indonésiens, les Philippins, les Thaïlandais, les Polynésiens., Timorais de l'Est, Bruneian, peuple Miao, Hmong, la tribu Naiman des Kazakhs au Kazakhstan[1], Kazakhs dans le sud-est de la République de l'Altaï[2], et Kazakhs dans la région d'Ili au Xinjiang[3].

Origines

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L'haplogroupe O-M175 est un haplogroupe descendant de l'haplogroupe NO-M214, et est apparu pour la première fois selon différentes théories soit en Asie du Sud-Est (voir Rootsi 2006, TMC ?, Shi 2005, et Bradshaw ?) ou en Asie de l'Est (voir ISOGG 2012) il y a environ 40 000 ans (ou entre 31 294 et 51 202 ans selon Karmin et al. 2015)[4],[5].

L'haplogroupe O-M175 est l'une des deux branches du NO-M214. L'autre est l'haplogroupe N, qui est commun dans toute l'Eurasie du Nord.

Son sous-clade, l'haplogroupe O1a-M119 est dominant dans les populations de langues austronésiennes des îles d'Asie du Sud-Est, mais rare dans les populations de langue austronésienne des îles du Pacifique. Des études ont montré que l'haplogroupe O1a est l'une des lignées paternelles des populations de langue han, taï-kadaï et austronésienne. Il s’est répandu dans le sud-ouest de la Chine et à Taiwan entre 4 500 et 6 000 ans[6]. Les populations de Chine méridionale de l'haplogroupe O1a présentent un âge relativement jeune, suggérant d'anciennes migrations du nord de la Chine vers le sud de la Chine via la route du nord[6].

Distribution

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Cet haplogroupe apparaît dans 80 à 90 % de la plupart des populations d'Asie de l'Est et d'Asie du Sud-Est, et il est presque exclusif à cette région : M175 est presque inexistant en Sibérie occidentale, en Asie occidentale, en Europe, dans la majeure partie de l'Afrique et dans les Amériques, où la présence peut être le résultat de migrations récentes. Cependant, certaines sous-clades de l'haplogroupe O-M175 atteignent des fréquences significatives parmi certaines populations d'Asie centrale, d'Asie du Sud et d'Océanie. Par exemple, une étude l'a trouvé à un taux de 65,81 % chez les Naimans, une tribu du Kazakhstan[1], même si le taux chez les Kazakhs en général n'est estimé qu'à environ 9 % (Wells et al. 2001). Il est estimé que 25% de la population masculine entière du monde porte O-M175[5],[7]. Karafet et al. (2015) attribuent l'ADN-Y de 46,2% (12/26) d'un échantillon de Papous de l'île de Pantar à l'haplogroupe NO-M214[8] ; compte tenu de leur emplacement dans l'archipel malais, tous ou la plupart de ces individus devraient appartenir à l'haplogroupe O-M175.

En Chine, l'haplogroupe prédominant des Hans, des Hui, des Mongols et des Yi est l'haplogroupe O-M175, avec des fréquences différentes dans ces quatre populations (Han : 80 %, Yi : 58,3 %, Hui : 47,4  % et Mongols : 36,5  %)[6].

Une association avec la propagation des langues austronésiennes à la fin de l'Antiquité est suggérée par des niveaux significatifs d'O-M175 parmi les populations insulaires du Pacifique Sud et de l'océan Indien, y compris le littoral est-africain. Par exemple, l'haplogroupe O-M50 a même été trouvé dans les populations de langue bantoue des Comores le long de 6% de O-MSY2.2 (xM50)[9], tandis que O-M50 et O-M95 (xM88) se produisent couramment parmi les Malgaches de Madagascar avec une fréquence combinée de 34%[10],[11]. O-M175 est trouvé chez 28,1% des habitants des îles Salomon de Mélanésie[12]. 12 % des Ouïghours (Wells et al. 2001), 6,8 % de Kalmouks[13] (17,1 % de Khoshuud, 6,1 % de Dörwöd, 3,3 % de Torguud, 0 % de Buzawa), 6,2 % d'Altaïens (Kharkov et al. 2007), 4,1% d'Ouzbeks en moyenne mais Ouzbeks de Boukhara 12,1%, Karakalpaks (Ouzbékistan) 11,4%, Sinte (Ouzbékistans) 6,7% (Wells et al. 2001) et 4,0% de Bouriates[14]. Dans la région du Caucase on le retrouve chez les Nogais 6%[15] mais 5,3% chez les Karan Nogais, on le retrouve également chez les locuteurs Dargins de Dargwa à 2,9%[16]. Dans la population iranienne, on la retrouve en Iranien (Ispahan) à 6,3% (Wells 2001), 8,9% de Tadjiks en Afghanistan[17] 4,2% dans les Pathans au Pakistan (Firasat 2007) mais 1% en Afghanistan (Borkar 2011), 3,1% à Burusho (Firasat 2007).

L'haplogroupe O-M175 varie dans diverses fréquences modérées à élevées dans les minorités ethniques d'Afrique du Sud. La fréquence de cet haplogroupe est de 6,14% dans la population de couleur du Cap[18]. 18% chez les musulmans de couleur du Cap, 38% chez les musulmans indiens du Cap et 10% dans les autres autres musulmans du Cap[18]. On le retrouve à 11,5% dans le créole réunionnais[19]. L'haplogroupe O-M175 est trouvé en Amérique latine et dans les Caraïbes à la suite d'une migration massive des hommes chinois à partir du 19e siècle. Il est trouvé chez les Jamaïcains à 3,8[20], Cubains 1,5%[21]

L'haplogroupe O-M175 est trouvé chez 88,7% des Américains d'origine asiatique. 1,6% chez les Hispaniques américains, 0,5% chez les Blancs américains et 0,3% chez les Afro-américains[22]. Une autre étude donne 0,5% d'afro-américains[23].

Haplogroupes du chromosome Y (Y-ADN)

Plus récent ancêtre patrilinéaire commun
A
BT
 B CT
DE CF
 D E C F
 G H IJK
IJ K
I J LT K2
I1 L T  MS  P  NO
M S Q R N O
R1 R2
R1a R1b

Notes et références

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  1. ↑ a et b Ashirbekov, Botbaev, Belkozhaev et Abayldaev, « Distribution of Y-Chromosome Haplogroups of the Kazakh from the South Kazakhstan, Zhambyl, and Almaty Regions », Reports of the National Academy of Sciences of the Republic of Kazakhstan, vol. 6, no 316,‎ , p. 85–95 (lire en ligne)
  2. ↑ « Y-chromosome variation in Altaian Kazakhs reveals a common paternal gene pool for Kazakhs and the influence of Mongolian expansions », PLOS ONE, vol. 6, no 3,‎ , e17548 (PMID 21412412, PMCID 3055870, DOI 10.1371/journal.pone.0017548, Bibcode 2011PLoSO...617548D)
  3. ↑ « 中国西部人群的遗传混合--《复旦大学》2011年博士论文 », sur cdmd.cnki.com.cn (consulté le )
  4. ↑ Karmin, Saag, Vicente et Sayres, « A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture », Genome Research, vol. 25, no 4,‎ , p. 459–466 (PMID 25770088, PMCID 4381518, DOI 10.1101/gr.186684.114)
  5. ↑ a et b Yan, Wang, Zheng et Wang, « Y Chromosomes of 40% Chinese Descend from Three Neolithic Super-Grandfathers », PLOS ONE, vol. 9, no 8,‎ , e105691 (PMID 25170956, PMCID 4149484, DOI 10.1371/journal.pone.0105691, Bibcode 2014PLoSO...9j5691Y, arXiv 1310.3897)
  6. ↑ a b et c (en) Jienan Li, Feng Song, Min Lang and Mingkun Xie, Comprehensive insights into the genetic background of Chinese populations using Y chromosome markers, royalsocietypublishing.org, 20 septembre 2023, doi.org/10.1098/rsos.230814
  7. ↑ Shou, Qiao, Wei et Dong, « Y-chromosome distributions among populations in Northwest China identify significant contribution from Central Asian pastoralists and lesser influence of western Eurasians », Journal of Human Genetics, vol. 55, no 5,‎ , p. 314–322 (PMID 20414255, DOI 10.1038/jhg.2010.30, S2CID 23002493)
  8. ↑ Karafet, Mendez, Sudoyo et Lansing, « Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia », European Journal of Human Genetics, vol. 23, no 3,‎ , p. 369–373 (PMID 24896152, PMCID 4326703, DOI 10.1038/ejhg.2014.106)
  9. ↑ « Genetic diversity on the Comoros Islands shows early seafaring as major determinant of human biocultural evolution in the Western Indian Ocean », European Journal of Human Genetics, vol. 19, no 1,‎ , p. 89–94 (PMID 20700146, PMCID 3039498, DOI 10.1038/ejhg.2010.128)
  10. ↑ « The dual origin of the Malagasy in Island Southeast Asia and East Africa: evidence from maternal and paternal lineages », American Journal of Human Genetics, vol. 76, no 5,‎ , p. 894–901 (PMID 15793703, PMCID 1199379, DOI 10.1086/430051)
  11. ↑ « On the origins and admixture of Malagasy: new evidence from high-resolution analyses of paternal and maternal lineages », Molecular Biology and Evolution, vol. 26, no 9,‎ , p. 2109–24 (PMID 19535740, DOI 10.1093/molbev/msp120)
  12. ↑ « Y-chromosome diversity is inversely associated with language affiliation in paired Austronesian- and Papuan-speaking communities from Solomon Islands », American Journal of Human Biology, vol. 18, no 1,‎ , p. 35–50 (PMID 16378340, DOI 10.1002/ajhb.20459)
  13. ↑ « Y-chromosome diversity in the Kalmyks at the ethnical and tribal levels », Journal of Human Genetics, vol. 58, no 12,‎ , p. 804–11 (PMID 24132124, DOI 10.1038/jhg.2013.108)
  14. ↑ « [Gene pool of Buryats: clinal variability and territorial subdivision based on data of Y-chromosome markers] », Genetika, vol. 50, no 2,‎ , p. 203–13 (PMID 25711029, DOI 10.1134/s1022795413110082, S2CID 15595963)
  15. ↑ « Culture creates genetic structure in the Caucasus: autosomal, mitochondrial, and Y-chromosomal variation in Daghestan », BMC Genetics, vol. 9,‎ , p. 47 (PMID 18637195, PMCID 2488347, DOI 10.1186/1471-2156-9-47)
  16. ↑ Balanovsky, Dibirova, Dybo et Mudrak, « Parallel Evolution of Genes and Languages in the Caucasus Region », Molecular Biology and Evolution, vol. 28, no 10,‎ , p. 2905–2920 (PMID 21571925, PMCID 3355373, DOI 10.1093/molbev/msr126)
  17. ↑ Haber, Platt, Ashrafian Bonab et Youhanna, « Afghanistan's Ethnic Groups Share a Y-Chromosomal Heritage Structured by Historical Events », PLOS ONE, vol. 7, no 3,‎ , e34288 (PMID 22470552, PMCID 3314501, DOI 10.1371/journal.pone.0034288, Bibcode 2012PLoSO...734288H)
  18. ↑ a et b « Strong maternal Khoisan contribution to the South African coloured population: a case of gender-biased admixture », American Journal of Human Genetics, vol. 86, no 4,‎ , p. 611–20 (PMID 20346436, PMCID 2850426, DOI 10.1016/j.ajhg.2010.02.014)
  19. ↑ Berniell-Lee, Plaza, Bosch et Calafell, « Admixture and sexual bias in the population settlement of La Réunion Island (Indian Ocean) », American Journal of Physical Anthropology, vol. 136, no 1,‎ , p. 100–107 (PMID 18186507, DOI 10.1002/ajpa.20783)
  20. ↑ « Y-chromosomal diversity in Haiti and Jamaica: contrasting levels of sex-biased gene flow », American Journal of Physical Anthropology, vol. 148, no 4,‎ , p. 618–31 (PMID 22576450, DOI 10.1002/ajpa.22090)
  21. ↑ « Genetic origin, admixture, and asymmetry in maternal and paternal human lineages in Cuba », BMC Evolutionary Biology, vol. 8,‎ , p. 213 (PMID 18644108, PMCID 2492877, DOI 10.1186/1471-2148-8-213)
  22. ↑ Hammer, Chamberlain, Kearney et Stover, « Population structure of Y chromosome SNP haplogroups in the United States and forensic implications for constructing Y chromosome STR databases », Forensic Science International, vol. 164, no 1,‎ , p. 45–55 (PMID 16337103, DOI 10.1016/j.forsciint.2005.11.013)
  23. ↑ Stefflova, Dulik, Pai et Walker, « Evaluation of Group Genetic Ancestry of Populations from Philadelphia and Dakar in the Context of Sex-Biased Admixture in the Americas », PLOS ONE, vol. 4, no 11,‎ , e7842 (PMID 19946364, PMCID 2776971, DOI 10.1371/journal.pone.0007842, Bibcode 2009PLoSO...4.7842S)
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