Hydrolase

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Cristal de lysozyme

Les hydrolases constituent une classe d'enzymes qui catalysent les réactions d'hydrolyse de molécules suivant la réaction générale :

R-R' + H2O ⇌ R-OH + R'-H

On y trouve par exemple

Ces enzymes ne nécessitent pas en général de coenzymes. Elles sont activables par des cations.

On rencontre des hydrolases dans les lysosomes des cellules. Les hydrolases lysosomales, particulièrement acides, présentent un pH d'environ 5 lorsqu'elles sont activées. Elles sont enfermées de façon étanche au sein du lysosome dont la libération brutale du contenu pourrait lyser la cellule.

Elles sont classées dans le groupe EC 3 dans la nomenclature EC, et sont réparties en 13 sous-groupes, en fonction du type de liaison qui sera coupée.

Sommaire

Classification EC[modifier | modifier le code]

Groupe EC3.1 (estérases)[modifier | modifier le code]

Elles agissent sur les liaisons ester de type R-CO-O-R'.

EC 3.1.1 : Hydrolases spécifiques des esters carboxyliques[modifier | modifier le code]

EC 3.1.2 : Hydrolases spécifiques des thioesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.3 : Hydrolases spécifiques des liaisons monoester-phosphoriques[modifier | modifier le code]

EC 3.1.4 : Hydrolases spécifiques des liaisons diester-phosphoriques[modifier | modifier le code]

EC 3.1.5 : Hydrolases spécifiques des liaisons monoester-triphosphoriques[modifier | modifier le code]

EC 3.1.6 : Hydrolases spécifiques des liaisons ester-sulfuriques[modifier | modifier le code]

EC 3.1.7 : Hydrolases spécifiques des liaisons monoester-diphosphoriques[modifier | modifier le code]

EC 3.1.8 : Hydrolases spécifiques des liaisons triester-phosphoriques[modifier | modifier le code]

EC 3.1.11 : Exodésoxyribonucléases productrices de 5'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.13 : Exoribonucléases productrices de 5'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.14 : Exoribonucléases productrices de 3'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.15 : Exonucléases actives à la fois sur l'ARN et sur l'ADN et produisant des 5'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.16 : Exonucléases actives à la fois dur l'ARN et sur l'ADN et produisant des 3'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.21 : Endodésoxyribonucléases productrices de 5'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.22 : Endodésoxyribonucléases productrices de 3'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.23 & EC 3.1.24[modifier | modifier le code]

Endodésoxyribonucléases spécifiques incluses aujourd'hui dans EC 3.1.21.3, EC 3.1.21.4 et EC 3.1.21.5.

EC 3.1.25 : Endodésoxyribonucléases spécifiques des bases abîmées[modifier | modifier le code]

EC 3.1.26 : Endoribonucléases productrices de 5'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.27 : Endoribonucléases productrices de 3'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.30 : Endoribonucléases actives à la fois sur l'ARN et sur l'ADN et productrices de 5'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

EC 3.1.31 : Endoribonucléases actives à la fois sur l'ARN et sur l'ADN et productrices de 3'-phosphomonoesters[modifier | modifier le code]

Groupe EC3.2 (glycosylases)[modifier | modifier le code]

EC 3.2.1 : Glycosidases (enzymes agissant autant sur les liaisons O-glycosidiques que sur les liaisons S-glycosidiques)[modifier | modifier le code]

EC 3.2.2 : Hydrolases spécifiques des liaisons N-glycosidiques[modifier | modifier le code]

EC 3.2.3 : Hydrolases spécifiques des liaisons S-glycosidiques[modifier | modifier le code]

Groupe vide : la seule enzyme (EC 3.2.3.1) a été déplacée vers EC 3.2.1.147.

Groupe EC3.3 (éther-hydrolases)[modifier | modifier le code]

EC 3.3.1 : Hydrolases spécifiques des liaisons thioéther et des trialkylsulfoniums[modifier | modifier le code]

EC 3.3.2 : Autres éther-hydrolases[modifier | modifier le code]

Groupe EC3.4 (peptidases)[modifier | modifier le code]

Les sous-groupes EC3.4.1 à EC3.4.4 ont été supprimés et les enzymes autrefois répertoriées dans ces groupes réparties dans les groupes nouvellement créés (EC3.4.11 à EC3.4.24). La liste qui suit donne la correspondance entre l'ancienne numérotation et la nouvelle.

EC 3.4.11 : Aminopeptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.12[modifier | modifier le code]

Sous-groupe aujourd'hui disparu. La liste suivante donne la correspondance entre les anciens numéros et les nouveaux.

EC 3.4.13 : Dipeptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.14 : Dipeptidyl-peptidases et tripeptidyl-peptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.15 : Peptidyl-dipeptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.16 : Carboxypeptidases de type sérine[modifier | modifier le code]

EC 3.4.17 : Métallocarboxypeptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.18 : Carboxypeptidases de type cystéine[modifier | modifier le code]

EC 3.4.19 : Oméga-peptidases (enzymes coupant au niveau du dernier acide aminé d'une chaîne peptidique)[modifier | modifier le code]

EC 3.4.21 : Sérine-endopeptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.22 : Cystéine-endopeptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.23 : Aspartate-endopeptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.24 : Métalloendopeptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.25 : Thréonine-endopeptidases[modifier | modifier le code]

EC 3.4.99 : Endopeptidases dont le mécanisme d'action est inconnu[modifier | modifier le code]

Dans ce sous-groupe sont placées les enzymes dont on ne connaît pas encore le mécanisme d'action. Dès que celui-ci est connu, l'enzyme est reclassée. La liste ci-après donne la nouvelle nomenclature donnée aux enzymes en attente. Actuellement, cette liste ne contient aucune enzyme en attente.

Groupe EC3.5 (enzymes agissant sur les liaisons carbone-azote)[modifier | modifier le code]

EC 3.5.1 : Enzymes spécifiques des amides linéaires (liaison C-N linéaire)[modifier | modifier le code]

EC 3.5.2 : Enzymes spécifiques des amides cycliques (liaison C-N cyclique)[modifier | modifier le code]

EC 3.5.3 : Déiminases (enzymes spécifiques des amidines linéaires) (liaison C=N linéaire)[modifier | modifier le code]

EC 3.5.4 : Enzymes spécifiques des amidines cycliques (liaison C=N cyclique)[modifier | modifier le code]

EC 3.5.5 : Nitrilases (enzymes spécifiques des nitriles) (liaison C≡N)[modifier | modifier le code]

EC 3.5.99 : Autres enzymes[modifier | modifier le code]

Groupe EC3.6 (enzymes spécifiques des anhydrides d'acides)[modifier | modifier le code]

EC 3.6.1 : Polyphosphatases (enzymes spécifiques des anhydrides contenant du phosphore)[modifier | modifier le code]

EC 3.6.2 : Sulfatases (enzymes spécifiques des anhydrides contenant un groupe sulfonyle)[modifier | modifier le code]

EC 3.6.3 : Anhydrases agissant lors de mouvements transmembranaires[modifier | modifier le code]

EC 3.6.4 : Anhydrases impliquées dans les mouvements cellulaires et subcellulaires[modifier | modifier le code]

EC 3.6.5 : Enzymes agissant sur le GTP, et impliquées dans les mouvements cellulaires et subcellulaires[modifier | modifier le code]

Groupe EC3.7 (enzymes agissant sur les liaisons carbone-carbone)[modifier | modifier le code]

EC3.7.1 : Enzymes actives sur les corps cétoniques[modifier | modifier le code]

Groupe EC3.8 (enzymes agissant sur les liaisons carbone-halogène)[modifier | modifier le code]

EC3.8.1 : Déhalogénases (enzymes spécifiques des liaisons carbone-halogène)[modifier | modifier le code]

Groupe EC3.9 (enzymes agissant sur les liaisons N-P)[modifier | modifier le code]

Ce groupe ne contient actuellement qu'une seule enzyme, la phosphoamidase, qui hydrolyse la N-phosphocréatine en créatine.

Groupe EC3.10 : Sulfohydrolases (enzymes agissant sur les liaisons N-S)[modifier | modifier le code]

Groupe EC3.11 (enzymes agissant sur les liaisons C-P)[modifier | modifier le code]

Groupe EC3.12 (enzymes agissant sur les liaisons S-S)[modifier | modifier le code]

Ce groupe ne contient qu'une seule enzyme, la trithionate-hydrolase, qui hydrolyse le trithionate en thiosulfate et sulfate.

Groupe EC3.13 (enzymes agissant sur les liaisons C-S)[modifier | modifier le code]

Exemples d'hydrolases (par ordre alphabétique) avec leur type d'action[modifier | modifier le code]

NB : Certaines phospholipases A contenues dans certains venins de serpents peuvent provoquer une hémolyse importante.

Notes et références[modifier | modifier le code]

  • Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology.