Ligase

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En biochimie, une ligase est une enzyme qui catalyse la jonction de deux molécules (en anglais ligation) par de nouvelles liaisons covalentes avec hydrolyse concomitante de l'ATP ou d'autres molécules similaires.

Nomenclature

le nom courant des enzymes de type ligase incluent souvent le terme « ligase » comme par exemple l'ADN ligase du phage T4. utilisée pour suturer des fragments d'ADN. D'autres noms courants utilisent le mot « synthétase », car ces enzyme catalysent la synthèse de nouvelle molécules.

Attention cependant à ne pas confondre les enzymes synthétases avec les enzymes synthases (qui sont toutes deux des enzymes du groupe des ligases), les synthases contrairement aux synthétases n'utilisent pas l'énergie libérée par la déphopsphorylation des nucléotides triphosphatés (comme l'ATP, la GTP, la CTP, la TTP et l'UTP)pour catalyser sa réaction. En fait la synthase forme et défait les doubles liaisons d'une proteine...

Classification

Les ligases sont classées EC 6 dans la nomenclature EC des enzymes. Cette classe peut ensuite être divisée en six sous-classes :

• EC 6.1 : regroupe les ligases qui forment des liaisons carbone-oxygène
• EC 6.2 : regroupe les ligases qui forment des liaisons carbone-soufre
• EC 6.3 : regroupe les ligases qui forment des liaisons carbone-azote
• EC 6.4 : regroupe les ligases qui forment des liaisons carbone-carbone
• EC 6.5 : regroupe les ligases qui forment des liaisons ester phosphorique
• EC 6.6 : regroupe les ligases qui forment des liaisons azote-métal