Classification phylogénétique de Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader

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La Classification phylogénétique du vivant est un ouvrage de Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader, illustré par Dominique Visset, publié en 2001[1] aux éditions Belin avec le concours du Centre national du livre. La troisième édition revue et augmentée a été publiée en juin 2009[2].

Cette synthèse fait le point sur les récents progrès en matière de systématique des êtres vivants, et en propose donc une classification phylogénétique. Auparavant, l'ouvrage développe le concept de phylogénie et les méthodes utilisées pour la réalisation des arbres phylogénétiques.

En complément, un second tome publié en 2013[3] est consacré à un grand groupe de végétaux, les plantes à fleurs (ou angiospermes), et à cinq grands groupes d'animaux, à savoir les cnidaires, les hexapodes (insectes, collemboles, etc.), les squamates (lézards et serpents), les oiseaux et les poissons téléostéens.

L'arbre de la Classification phylogénétique du vivant[modifier | modifier le code]

L'arbre présenté ici correspond à la mise ensemble des arbres se trouvant dans le livre, lesquels ne comportent pas les groupes éteints. (On peut consulter l'arbre qui avait été proposé dans la première édition de l'ouvrage en suivant ce lien.) Les différentes branches ont été laissées dans l'ordre où elle apparaissent dans les différents arbres publiés dans ce livre (sauf quelques exceptions, par souci graphique), et les noms des taxons orthographiés de même.

Certains des noms utilisés font débat, ils ne sont utilisés que par nos auteurs et n'ont pas été reçus par la communauté scientifique. Voir le paragraphe Débat dans la suite de l'article.

On se référera aussi utilement à l’article intitulé Arbre phylogénétique. On trouvera un autre arbre phylogénétique du vivant, beaucoup plus développé que celui de nos deux auteurs (et présentant des choix parfois différents, souvent plus récents), portant les noms latins des taxons, et en mise à jour permanente, dans une série d'articles qui s'ouvre à l’article Le vivant (classification phylogénétique).

─o le vivant
 │
 ├─o Eubactéries
 │ ├─o Protéobactéries
 │ │ ├─o Protéobactéries ε
 │ │ └─o
 │ │   ├─o Protéobactéries δ
 │ │   └─o
 │ │     ├─o Protéobactéries α
 │ │     └─o
 │ │       ├─o Protéobactéries β
 │ │       └─o Protéobactéries γ
 │ ├─o
 │ │ ├─o Firmicutes
 │ │ │ ├─o Groupe Bacillus / Clostridium
 │ │ │ └─o Actinobactéries
 │ │ └─o
 │ │   ├─o Cyanobactéries
 │ │   └─o Groupe Thermus / Deinococcus
 │ ├─o
 │ │ ├─o Bactéries vertes sulfureuses
 │ │ └─o
 │ │   ├─o Flavobactéries (Cytophagales)
 │ │   └─o Bactéroïdes
 │ ├─o
 │ │ ├─o Spirochètes
 │ │ └─o Chlamydiales
 │ ├─o Planctomycétales
 │ ├─o Bactéries vertes non sulfureuses
 │ ├─o Aquificales
 │ └─o Thermotogales
 │
 ├─o Archées
 │ ├─o Crénarchées
 │ │ ├─o Thermoprotéales
 │ │ └─o
 │ │   ├─o Desulfurococcales
 │ │   └─o Sulfolobales
 │ └─o Euryarchées
 │   ├─o Thermococcales
 │   └─o 
 │     ├─o Méthanopyrales
 │     └─o
 │       ├─o Méthanobactériales
 │       └─o
 │         ├─o Méthanococcales
 │         └─o
 │           ├─o Thermoplasmales
 │           ├─o Archéoglobales
 │           ├─o Halobactériales
 │           └─o
 │             ├─o Méthanomicrobiales
 │             └─o Méthanosarcinales
 │
 └─o Eucaryotes
   │
   ├─o Bicontes
   │ │
   │ ├─o Lignée verte
   │ │ ├─o Glaucophytes
   │ │ └─o Métabiontes
   │ │   ├─o Rhodobiontes
   │ │   └─o Chlorobiontes
   │ │     ├─o Ulvophytes
   │ │     ├─o Prasinophytes
   │ │     └─o Streptophytes
   │ │       ├─? Chlorokybophytes
   │ │       ├─o Klebsormidiophytes
   │ │       └─o Phragmoplastophytes
   │ │         ├─o Zygnématophytes
   │ │         └─o Plasmodesmophytes
   │ │           ├─? Chaetosphaeridiophytes
   │ │           ├─o Charophytes
   │ │           └─o Parenchymophytes
   │ │             ├─o Coléochaetophytes
   │ │             └─o Embryophytes
   │ │               ├─o Marchantiophytes
   │ │               └─o Stomatophytes
   │ │                 ├─o Anthocérophytes
   │ │                 └─o Hémitrachéophytes
   │ │                   ├─o Bryophytes
   │ │                   └─o Polysporangiophytes
   │ │                     ├─o Lycophytes
   │ │                     └─o Euphyllophytes
   │ │                       ├─o Moniliformopses
   │ │                       │ ├─o Sphénophytes
   │ │                       │ └─o Filicophytes
   │ │                       └─o Spermatophytes
   │ │                         ├─o Ginkgophytes
   │ │                         ├─o Pinophytes
   │ │                         ├─o Cycadophytes
   │ │                         ├─o Gnétophytes
   │ │                         └─o Angiospermes
   │ │                           ├─o Amborellales
   │ │                           └─o
   │ │                             ├─o Nymphaeales
   │ │                             └─o
   │ │                               ├─o Austrobaileyales
   │ │                               └─o Euangiospermes
   │ │                                 ├─o Chloranthales
   │ │                                 ├─o Cératophyllales
   │ │                                 ├─o Magnoliidées
   │ │                                 │ ├─o
   │ │                                 │ │ ├─o Magnoliales
   │ │                                 │ │ └─o Laurales
   │ │                                 │ └─o
   │ │                                 │   ├─o Canellales
   │ │                                 │   └─o Piperales
   │ │                                 ├─o Monocotylédones
   │ │                                 │ ├─o Acorales
   │ │                                 │ └─o
   │ │                                 │   ├─o Alismatales
   │ │                                 │   └─o Eumonocotylédones
   │ │                                 │     ├─o Miyoshiales
   │ │                                 │     ├─o Dioscoreales
   │ │                                 │     ├─o Pandanales
   │ │                                 │     ├─o Liliales
   │ │                                 │     ├─o Asparagales
   │ │                                 │     └─o Commélinidées
   │ │                                 │       ├─o Dasypogonales
   │ │                                 │       ├─o Arecales
   │ │                                 │       └─o
   │ │                                 │         ├─o Poales
   │ │                                 │         └─o
   │ │                                 │           ├─o Commelinales
   │ │                                 │           └─o Zingiberales
   │ │                                 └─o Eudicotylédones
   │ │                                   ├─o Ranunculales
   │ │                                   └─o
   │ │                                     ├─o Sabiales
   │ │                                     ├─o Proteales
   │ │                                     ├─o Buxales
   │ │                                     ├─o Trochodendrales
   │ │                                     └─o Fonds des tricolpées
   │ │                                       ├─o Berberidopsidales
   │ │                                       ├─o Santalales
   │ │                                       ├─o
   │ │                                       │ ├─o Dilleniales
   │ │                                       │ └─o Caryophyllales
   │ │                                       ├─o
   │ │                                       │ ├─o Saxifragales
   │ │                                       │ ├─o Vitales
   │ │                                       │ └─o Rosidées
   │ │                                       │   ├─o Crossosomatales
   │ │                                       │   ├─o Geraniales
   │ │                                       │   ├─o Myrtales
   │ │                                       │   ├─o Eurosidées I
   │ │                                       │   │ ├─o Zygophyllales
   │ │                                       │   │ ├─o
   │ │                                       │   │ │ ├─o Celastrales
   │ │                                       │   │ │ ├─o Malpighiales
   │ │                                       │   │ │ └─o Oxalidales
   │ │                                       │   │ └─o
   │ │                                       │   │   ├─o Fabales
   │ │                                       │   │   ├─o Rosales
   │ │                                       │   │   ├─o Cucurbitales
   │ │                                       │   │   └─o Fagales
   │ │                                       │   └─o Eurosidées II
   │ │                                       │     ├─o Brassicales
   │ │                                       │     ├─o Huerteales
   │ │                                       │     ├─o Malvales
   │ │                                       │     └─o Sapindales
   │ │                                       └─o Astéridées
   │ │                                         ├─o Cornales
   │ │                                         ├─o Ericales
   │ │                                         └─o Euastéridées
   │ │                                           ├─o Euastéridées I
   │ │                                           │ ├─o Garryales
   │ │                                           │ └─o
   │ │                                           │   ├─o Gentianales
   │ │                                           │   └─o
   │ │                                           │     ├─o Lamiales
   │ │                                           │     └─o Solanales
   │ │                                           └─o Euastéridées II
   │ │                                             ├─o Aquifoliales
   │ │                                             └─o 
   │ │                                               ├─o Apiales
   │ │                                               ├─o Asterales
   │ │                                               └─o Dipsacales
   │ │
   │ ├─o Chromoalvéolés
   │ │ ├─o Alvéolobiontes
   │ │ │ ├─o Ciliés
   │ │ │ ├─o Dinophytes
   │ │ │ └─o Apicomplexés
   │ │ ├─o Straménopiles
   │ │ ├─o Cryptophytes
   │ │ └─o Haptophytes
   │ │
   │ ├─o Rhizariens
   │ │ ├─o Actinopodes
   │ │ ├─o Foraminifères
   │ │ └─o Chlorarachniophytes
   │ │ 
   │ └─o Excavobiontes
   │   ├─o Euglénobiontes
   │   ├─o Parabasaliens
   │   ├─o Métamonadines
   │   └─o Percolozoaires
   │
   └─o Unicontes
     │
     ├─o Amoebozoaires
     │ ├─o Rhizopodes
     │ └─o Mycétozoaires
     │
     └─o Opisthocontes
       ├─o Champignons
       │ ├─o Microsporidies
       │ └─o Eumycètes
       │   ├─o Chytridiomycètes
       │   └─o
       │     ├─o Zygomycètes
       │     └─o
       │       ├─o Ascomycètes
       │       └─o Basidiomycètes
       └─o Choano-organismes
         ├─o Choanoflagellés
         └─o Métazoaires
           ├─? Placozoaires
           ├─o Démosponges
           ├─o Éponges hexactinellides
           ├─o Éponges calcaires
           └─o Eumétazoaires
             ├─o Cnidaires
             ├─o Cténophores
             ├─? Myxozoaires
             └─o Bilatériens
               ├─o Protostomiens
               │ ├─o Lophotrochozoaires
               │ │ ├─o Eutrochozoaires
               │ │ │ ├─o Syndermates
               │ │ │ │ ├─o Rotifères
               │ │ │ │ └─o Acanthocéphales
               │ │ │ ├─? Cycliophores
               │ │ │ └─o Spiraliens
               │ │ │   ├─o Entoproctes
               │ │ │   ├─o Parenchymiens
               │ │ │   │ ├─o Plathelminthes
               │ │ │   │ └─o Némertes
               │ │ │   ├─o Mollusques
               │ │ │   │ ├─o Solénogastres
               │ │ │   │ ├─o Caudofovéates
               │ │ │   │ └─o Eumollusques
               │ │ │   │   ├─o Polyplacophores
               │ │ │   │   └─o Conchifères
               │ │ │   │     ├─o Monoplacophores
               │ │ │   │     └─o Ganglioneures
               │ │ │   │       ├─o Viscéroconques
               │ │ │   │       │ ├─o Gastéropodes
               │ │ │   │       │ └─o Céphalopodes
               │ │ │   │       └─o Diasomes
               │ │ │   │         ├─o Bivalves
               │ │ │   │         └─o Scaphopodes
               │ │ │   ├─o Siponcles
               │ │ │   └─o Annélides
               │ │ └─o Lophophorates
               │ │   ├─o Ectoproctes
               │ │   └─o Phoronozoaires
               │ │     ├─o Brachiopodes
               │ │     └─o Phoronidiens
               │ ├─? Chaetognathes
               │ └─o Cuticulates
               │   ├─o Gastrotriches
               │   └─o Ecdysozoaires
               │     ├─o Introvertés
               │     │ ├─o Nématozoaires
               │     │ │ ├─o Nématodes
               │     │ │ └─o Nématomorphes
               │     │ └─o Céphalorhynches
               │     │   ├─o Kinorhynches
               │     │   ├─o Loricifères
               │     │   └─o Priapuliens
               │     └─o Panarthropodes
               │       ├─o Onychophores
               │       ├─o Tardigrades
               │       └─o Euarthropodes
               │         ├─o Chélicériformes
               │         │ ├─o Pycnogonides
               │         │ └─o Chélicérates
               │         │   ├─o Mérostomes
               │         │   └─o Arachnides
               │         │     ├─o
               │         │     │ ├─o Scorpionides
               │         │     │ ├─o Opilionides
               │         │     │ └─o 
               │         │     │   ├─o Pseudoscorpionides
               │         │     │   └─o Solpugides
               │         │     └─o
               │         │       ├─o Palpigrades
               │         │       ├─o
               │         │       │ ├─o Acariens
               │         │       │ └─o Ricinulides
               │         │       └─o
               │         │         ├─o Aranéides
               │         │         └─o
               │         │           ├─o Amblypyges
               │         │           └─o
               │         │             ├─o Uropyges
               │         │             └─o Schizomides
               │         └─o Mandibulates ou Antennates
               │           ├─o Myriapodes
               │           └─o Pancrustacés
               │             ├─o Rémipèdes
               │             ├─o Céphalocarides
               │             ├─o Maxillopodes
               │             ├─o Branchiopodes
               │             ├─o Malacostracés
               │             └─o Hexapodes
               │               ├─o 
               │               │ ├─o Protoures
               │               │ └─o Collemboles
               │               ├─o Campodeoïdes
               │               ├─o Japygoïdes
               │               └─o Insectes
               │                 ├─o Archéognathes
               │                 └─o
               │                   ├─o Thysanoures
               │                   └─o
               │                     ├─o Éphéméroptères
               │                     └─o
               │                       ├─o Odonates
               │                       └─o 
               │                         ├─o
               │                         │ ├─o Plécoptéroïdes
               │                         │ ├─o Grylloblattoptères
               │                         │ ├─o Dermaptères
               │                         │ └─o
               │                         │   ├─o Embioptères
               │                         │   ├─o 
               │                         │   │ ├─o Phasmides
               │                         │   │ └─o Orthoptères
               │                         │   └─o 
               │                         │     ├─o Mantoptères
               │                         │     └─o 
               │                         │       ├─o Blattoptères
               │                         │       └─o Isoptères
               │                         └─o 
               │                           ├─o Zoraptères
               │                           ├─o
               │                           │ ├─o Hémiptères
               │                           │ └─o 
               │                           │   ├─o Thysanoptères
               │                           │   └─o 
               │                           │     ├─o Psocoptères
               │                           │     └─o Phthiraptères
               │                           └─o 
               │                             ├─o 
               │                             │ ├─o Coléoptères
               │                             │ └─o 
               │                             │   ├─o Névroptères
               │                             │   └─o 
               │                             │     ├─o Rhaphidioptères
               │                             │     └─o Mégaloptères
               │                             └─o 
               │                               ├─o Hyménoptères
               │                               └─o 
               │                                 ├─o 
               │                                 │ ├─o Trichoptères
               │                                 │ └─o Lépidoptères
               │                                 └─o 
               │                                   ├─o 
               │                                   │ ├─o Mécoptères
               │                                   │ └─o Siphonaptères
               │                                   └─o 
               │                                     ├─o Strepsiptères
               │                                     └─o Diptères
               ├─? Mésozoaires
               └─o Deutérostomiens
                 ├─o Échinodermes
                 │ ├─o Crinoïdes
                 │ └─o
                 │   ├─o
                 │   │ ├─o Holothuriens
                 │   │ └─o Échinoïdes
                 │   └─o
                 │     ├─o Ophiures
                 │     └─o Astéries
                 └─o Pharyngotrèmes
                   ├─o Hémichordés
                   └─o Chordés
                     ├─o Urochordés
                     └─o Myomérozoaires
                       ├─o Céphalochordés
                       └─o Crâniates
                         ├─o Myxinoïdes
                         └─o Vertébrés
                           ├─o Pétromyzontides
                           └─o Gnathostomes
                             ├─o Chondrichthyens
                             └─o Ostéichthyens
                               ├─o Sarcoptérygiens
                               │ ├─o Actinistiens
                               │ └─o Rhipidistiens
                               │   ├─o Dipneustes
                               │   └─o Tétrapodes
                               │     ├─o Lissamphibiens
                               │     │ ├─o Gymnophiones
                               │     │ └─o Batraciens
                               │     │   ├─o Urodèles
                               │     │   └─o Anoures
                               │     └─o Amniotes
                               │       ├─o Mammifères
                               │       │ ├─o Monotrèmes
                               │       │ └─o Thériens
                               │       │   ├─o Marsupiaux
                               │       │   └─o Euthériens
                               │       │     ├─o Xénarthres
                               │       │     └─o Épithériens
                               │       │       ├─o Afrothériens
                               │       │       │ ├─o Afroinsectiphiles
                               │       │       │ │ ├─o Tubulidentés
                               │       │       │ │ └─o Afroinsectivores
                               │       │       │ │   ├─o Afrosoricides
                               │       │       │ │   └─o Macroscélides
                               │       │       │ └─o Paenongulés
                               │       │       │   ├─o Hyracoïdes
                               │       │       │   └─o Téthythériens
                               │       │       │     ├─o Proboscidiens
                               │       │       │     └─o Siréniens
                               │       │       └─o Boréoeuthériens
                               │       │         ├─o Euarchontoglires
                               │       │         │ ├─o Glires
                               │       │         │ │ ├─o Lagomorphes
                               │       │         │ │ └─o Rongeurs
                               │       │         │ └─o Euarchontes
                               │       │         │   ├─o Dermoptères
                               │       │         │   └─o Primates lato sensu
                               │       │         │     ├─o Scandentiens
                               │       │         │     └─o Primates stricto sensu
                               │       │         │       ├─o Strepsirrhiniens
                               │       │         │       │ ├─o Lorisiformes
                               │       │         │       │ └─o Lémuriformes
                               │       │         │       └─o Haplorrhiniens
                               │       │         │         ├─o Tarsiiformes
                               │       │         │         └─o Simiiformes
                               │       │         │           ├─o Platyrrhiniens
                               │       │         │           └─o Catarrhiniens
                               │       │         │             ├─o Cercopithécoïdes
                               │       │         │             └─o Hominoïdes
                               │       │         │               ├─o Hylobatoïdés
                               │       │         │               └─o Hominoïdés
                               │       │         │                 ├─o Pongidés
                               │       │         │                 └─o Hominidés
                               │       │         │                   ├─o Gorillinés
                               │       │         │                   └─o Homininés
                               │       │         │                     ├─o Hominines
                               │       │         │                     └─o Panines
                               │       │         └─o Laurasiathériens
                               │       │           ├─o Eulipotyphles
                               │       │           └─o Scrotifères
                               │       │             ├─o Chiroptères
                               │       │             └─o Fereongulés
                               │       │               ├─o Périssodactyles
                               │       │               ├─o Ferae
                               │       │               │ ├─o Carnivores
                               │       │               │ └─o Pholidotes
                               │       │               └─o Cétartiodactyles
                               │       │                 ├─o Tylopodes
                               │       │                 └─o 
                               │       │                   ├─o Suines
                               │       │                   └─o
                               │       │                     ├─o Ruminants
                               │       │                     └─o
                               │       │                       ├─o Hippopotamidés
                               │       │                       └─o Cétacés
                               │       └─o Sauropsides
                               │         ├─o Chéloniens
                               │         └─o Diapsides
                               │           ├─o Lépidosauriens
                               │           │ ├─o Sphénodontiens
                               │           │ └─o Squamates
                               │           │   ├─o Dibamidés
                               │           │   └─o
                               │           │     ├─o
                               │           │     │ ├─o Pygopodinés
                               │           │     │ └─o Gekkonidés
                               │           │     └─o
                               │           │       ├─o
                               │           │       │ ├─o Scincidés
                               │           │       │ └─o
                               │           │       │   ├─o Cordylidés
                               │           │       │   └─o Xantusiidés
                               │           │       └─o
                               │           │         ├─o
                               │           │         │ ├─o Serpents
                               │           │         │ ├─o
                               │           │         │ │ ├─o Iguanoïdés
                               │           │         │ │ └─o Leiocephalus
                               │           │         │ └─o
                               │           │         │   ├─o Varanidés
                               │           │         │   └─o
                               │           │         │     ├─o Anguidés
                               │           │         │     └─o Helodermatidés
                               │           │         └─o
                               │           │           ├─o Teiioïdés
                               │           │           └─o
                               │           │             ├─o Lacertidés
                               │           │             └─o
                               │           │               ├─o Rhineuridés
                               │           │               └─o
                               │           │                 ├─o Bipedidés
                               │           │                 └─o
                               │           │                   ├─o Trogonophidés
                               │           │                   └─o Amphisbaenidés
                               │           └─o Archosauriens
                               │             ├─o Crocodiliens
                               │             └─o Oiseaux
                               │               ├─o Paléognathes
                               │               └─o Neognathes
                               │                 ├─o Galloanserées
                               │                 │ ├─o Ansériformes
                               │                 │ └─o Galliformes
                               │                 └─o Neoaves
                               │                   ├─o Psittaciformes
                               │                   ├─o Cuculiformes
                               │                   ├─o
                               │                   │ ├─o Strigiformes
                               │                   │ └─o
                               │                   │   ├─o Caprimulgiformes
                               │                   │   └─o Apodiformes
                               │                   ├─o
                               │                   │ ├─o Piciformes
                               │                   │ ├─o Passeriformes
                               │                   │ └─o
                               │                   │   ├─o Coliiformes
                               │                   │   └─o Coraciiformes
                               │                   ├─o
                               │                   │ ├─o Ciconiiformes
                               │                   │ └─o 
                               │                   │   ├─o Gruiformes
                               │                   │   ├─o Charadriiformes
                               │                   │   ├─o Falconiformes
                               │                   │   ├─o Ardéidés
                               │                   │   └─o Columbiformes
                               │                   └─o
                               │                     ├─o
                               │                     │ ├─o Procellariiformes
                               │                     │ └─o Pélécaniformes
                               │                     └─o
                               │                       ├─o Sphénisciformes
                               │                       └─o
                               │                         ├─o Podicipédiformes
                               │                         └─o Gaviiformes
                               └─o Actinoptérygiens
                                 ├─o Cladistiens
                                 └─o Actinoptères
                                   ├─o Chondrostéens
                                   └─o Néoptérygiens
                                     ├─o Ginglymodes
                                     └─o Halécostomes
                                       ├─o Halécomorphes
                                       └─o Téléostéens
                                         ├─o Ostéoglossomorphes
                                         └─o
                                           ├─o Élopomorphes
                                           └─o
                                             ├─o
                                             │ ├─o Clupéomorphes
                                             │ └─o Ostariophyses
                                             └─o
                                               ├─o
                                               │ ├─o Argentinoïdes
                                               │ ├─o
                                               │ │ ├─o Ésocoïdes
                                               │ │ └─o Salmonoïdes
                                               │ └─o
                                               │   ├─o Osmeroïdes
                                               │   └─o Stomiiformes
                                               └─o
                                                 ├─o
                                                 │ ├─o Aulopoïdes
                                                 │ └─o
                                                 │   ├─o Chlorophthalmidés
                                                 │   └─o Alépisauroïdes
                                                 └─o
                                                   ├─o Atéléopodiformes
                                                   └─o
                                                     ├─o Myctophiformes
                                                     └─o Acanthomorphes

Débat[modifier | modifier le code]

Les débats liés à certaines reconstructions phylogénétiques se trouvent dans les articles de la série inaugurée par l'article « Le vivant (classification phylogénétique) », et sur les pages de chaque taxon.

Notes et références[modifier | modifier le code]

Notes[modifier | modifier le code]

Références[modifier | modifier le code]

  1. 1re édition (ISBN 2-7011-2137-X)
  2. 3e édition (ISBN 2-7011-4273-3)
  3. Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader, Classification phylogénétique du vivant, Tome 2 : Plantes à fleurs, Cnidaires, Insectes, Squamates, Oiseaux, Téléostéens, Belin, Paris, 2013, 607 p. (ISBN 978-2-7011-3456-7)

Voir aussi[modifier | modifier le code]

Bibliographie[modifier | modifier le code]

Documentaire[modifier | modifier le code]

Articles connexes[modifier | modifier le code]