Coronaviridae

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Cet article concerne un type de virus zoonotique. Pour la pandémie en cours, voir Pandémie de Covid-19. Pour la nouvelle souche causant cette épidémie, voir SARS-CoV-2.

Coronaviridae
Description de cette image, également commentée ci-après
Coronavirus humain.
Classification ICTV
 Rang ' royaume ' non reconnu  Riboviria
Règne Orthornavirae
Embranchement Pisuviricota
Classe Pisoniviricetes
Ordre Nidovirales
Sous-ordre Cornidovirineae

Famille

Coronaviridae
ICTV 1975[1]

Genres de rang inférieur

Les Coronaviridae sont une famille de virus à ARN simple brin enveloppés, de sens positif. Le génome viral mesure de 26 à 32 kb. Les particules, quasi-sphériques, sont généralement décorées de grandes projections de surface (~ 20nm), en forme de massue ou de pétale (les péplomères ou spikes en anglais), qui créent une image qui rappelle la couronne solaire en micrographie électronique : cette propriété est à l'origine du nom des virus de cette famille, les « coronavirus ».

Structure

Schéma de la structure d'un virion de coronavirus

Les extrémités 5' et 3' du génome ont une coiffe et une « queue » poly(A), respectivement. L'enveloppe virale, obtenue par bourgeonnement à travers les membranes du réticulum endoplasmique (RE) et / ou de l'appareil de Golgi, contient invariablement deux espèces de (glyco)protéines codées par le virus, S et M. La glycoprotéine S comprend les grandes projections de surface, tandis que la protéine M est une protéine transmembranaire.

Les torovirus et un sous-ensemble de coronavirus (en particulier les membres du sous-groupe A du genre Betacoronavirus) possèdent, en plus des peplomères composés de S, un deuxième type de projections de surface composé de la protéine hémagglutinine-estérase.

Une autre protéine structurelle importante est la phosphoprotéine N, qui est responsable de la symétrie hélicoïdale de la nucléocapside qui renferme l'ARN génomique.

Taxinomie

La famille des Coronaviridae est organisée en 2 sous-familles, 5 genres, 26 sous-genres et une quarantaine d'espèces[2]:

Épidémiologie et pathologie

Les coronavirus sont transmis par voie fécale-orale ou par aérosols de sécrétions respiratoires. Ils sont présents dans le monde entier et infectent une large diversité de mammifères et d'oiseaux.

Bien que la plupart des maladies soient bénignes chez l'homme, elles peuvent parfois provoquer des situations plus graves, notamment des infections des voies respiratoires : syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) et maladie à coronavirus 2019 (Covid-19). Ils peuvent également provoquer des infections entériques chez les très jeunes enfants et, dans de rares situations, des syndromes neurologiques.

Notes et références

  1. ↑ ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 1er février 2021
  2. ↑ (en) « Virus taxonomy: 2019 release », sur ICTV online, (consulté le )
  3. ↑ DOI 10.1073/pnas.0506735102
  4. ↑ DOI 10.1093/database/baaa062

Références biologiques

v · m
Familles de virus
realm > règne > phylum > classe > ordre > famille(s)
Adnaviria (en)
Taleaviricota
Tokiviricetes
Ligamenvirales (en)
Primavirales
Duplodnaviria
Peploviricota
Herviviricetes
Herpesvirales
Uroviricota
Caudoviricetes
Crassvirales
Kirjokansivirales
Methanobavirales
Thumleimavirales
incertae sedis
Monodnaviria
Hofneiviricota
Faserviricetes
Tubulavirales (en)
Phixviricota
Malgrandaviricetes
Petitvirales
Cossaviricota (en)
Mouviricetes
Polivirales
Papovaviricetes
Sepolyvirales
Zurhausenvirales
Quintoviricetes
Piccovirales
Cressdnaviricota (en)
Arfiviricetes (en)
Baphyvirales
Cirlivirales
Cremevirales
Mulpavirales
Recrevirales
Rivendellvirales
Rohanvirales
Repensiviricetes
Geplafuvirales (en)
Saleviricota
Huolimaviricetes
Haloruvirales
Riboviria
Duplornaviricota (en)
Chrymotiviricetes
Ghabrivirales (en)
Resentoviricetes
Reovirales
Vidaverviricetes
Mindivirales
Kitrinoviricota
Alsuviricetes
Hepelivirales (en)
Martellivirales
Tymovirales (en)
Flasuviricetes
Amarillovirales
Magsaviricetes
Nodamuvirales (en)
Tolucaviricetes
Tolivirales (en)
Lenarviricota (en)
Amabiliviricetes
Wolframvirales
Howeltoviricetes
Cryppavirales
Leviviricetes (en)
Norzivirales (en)
Timlovirales (en)
Miaviricetes
Ourlivirales
Negarnaviricota
Chunqiuviricetes
Muvirales
Milneviricetes
Serpentovirales
Monjiviricetes
Jingchuvirales (en)
Mononegavirales
Yunchangviricetes
Goujianvirales
Ellioviricetes
Bunyavirales
Insthoviricetes
Articulavirales
Pisuviricota
Duplopiviricetes
Durnavirales (en)
Pisoniviricetes
Nidovirales
Picornavirales
Sobelivirales (en)
Stelpaviricetes
Patatavirales
Stellavirales
incertae sedis
Artverviricota
Revtraviricetes
Blubervirales
Ortervirales (en)
Non assignées
Ribozyviria
Varidnaviria (en)
Nucleocytoviricota
Megaviricetes
Algavirales
Imitervirales
Pimascovirales
Pokkesviricetes (en)
Asfuvirales
Chitovirales
Preplasmiviricota
Maveriviricetes
Priklausovirales
Polintoviricetes
Orthopolintovirales
Tectiliviricetes (en)
Belfryvirales
Kalamavirales
Rowavirales
Vinavirales
Dividoviricota
Laserviricetes
Halopanivirales
Non assignées
incertae sedis
Naldaviricetes (en)
Lefavirales (en)
Non assignées
Autres
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Il existe une catégorie consacrée à ce sujet : Coronaviridae.
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