Variant Iota du SARS-CoV-2
Le variant Iota[1], également connu sous le nom de lignée B.1.526, est l'un des variants du SARS-CoV-2, le virus qui cause la COVID-19. Il a été détecté pour la première fois à New York en novembre 2020. Le variante est apparue avec deux mutations notables : la mutation Spike E484K, qui peut aider le virus à échapper aux anticorps, et la mutation S477N, qui peut aider le virus à se lier plus étroitement aux cellules humaines.
En février 2021, il s'était propagé rapidement dans la région de New York et représentait environ une séquence virale sur quatre[2]. Au 11 avril 2021, le variant avait été détecté dans au moins 48 États américains et 18 pays[3],[4].
Dans le cadre du schéma de dénomination simplifié proposé par l'Organisation mondiale de la santé, B.1.526 a été étiqueté variant Iota et est considéré comme un variant d'intérêt (VOI), mais pas comme un variant préoccupant[5].
Mutation
[modifier | modifier le code]Le génome d'Iota (B.1.526) contient les mutations d'acides aminés suivantes, toutes présentes dans le code de la protéine Spike du virus : L5F, T95I, D253G, E484K, D614G et A701V[6].
Chronologie
[modifier | modifier le code]La propagation du variant Iota a été détectée par des chercheurs du California Institute of Technology en recherchant des mutations dans une base de données connue sous le nom de GISAID, une initiative scientifique mondiale qui a documenté plus de 700 000 séquences génomiques du SRAS-CoV-2[7].
La proportion de cas américains représentés par le variant Iota avait fortement diminué fin juillet 2021, le variant Delta devenant dominant[8].
Notes et références
[modifier | modifier le code]- (en) « Tracking SARS-CoV-2 variants », www.who.int (consulté le )
- (en-US) Rosa-Aquino, « Everything We Know About the Coronavirus Variant Spreading in New York City », Intelligencer, (consulté le )
- (en) « outbreak.info », outbreak.info (consulté le )
- « PANGO lineages Lineage B.1.526 », cov-lineages.org, (consulté le )
- (en) « Tracking SARS-CoV-2 variants », www.who.int (consulté le )
- « SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions », CDC.gov, Centers for Disease Control and Prevention (consulté le )
- (en) West, Barnes, Yang et Bjorkman, « SARS-CoV-2 lineage B.1.526 emerging in the New York region detected by software utility created to query the spike mutational landscape », bioRxiv, , p. 2021.02.14.431043 (PMID 33907745, PMCID 8077570, DOI 10.1101/2021.02.14.431043, lire en ligne)
- SARS-CoV-2 sequences by variant, Jul 26, 2021, USA Our World in Data
Voir aussi
[modifier | modifier le code]Articles connexes
[modifier | modifier le code]- Variants du SARS-CoV-2 : Variant Alpha du SARS-CoV-2, Variant Bêta du SARS-CoV-2, Variant Gamma du SARS-CoV-2, Variant Delta du SARS-CoV-2, Variant Epsilon du SARS-CoV-2, Variant Zeta du SARS-CoV-2, Variant Eta du SARS-CoV-2, Variant Theta du SARS-CoV-2, Variant Kappa du SARS-CoV-2, Variant Lambda du SARS-CoV-2, Variant Mu du SARS-CoV-2, Variant Omicron du SARS-CoV-2.
