Classification des virus

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La classification des virus ne peut être intégrée à celle réalisée pour les êtres vivants du fait que les virus ne sont pas considérés comme vivants, car ne pouvant se reproduire par leurs propres moyens. C'est ainsi qu'il a été nécessaire de mettre au point une classification particulière.

Il en existe deux qui font autorité :

Ces deux méthodes de classifications ne sont pas antagonistes et peuvent tout à fait s'intégrer l'une à l'autre, car la classification de l'ICTV reprend certains critères de la classification Baltimore.

Aucune des classifications n'est censée être phylogénétique, car les virus ne partagent pas d'origine commune.

Généralités[modifier | modifier le code]

Les formes variées des virus résultent du fait que l'un des deux brins d'ADN dans lesquels toutes les formes de vie cellulaire conservent leur information génétique est redondant, et que par conséquent les virus peuvent avoir des génomes à simple ou double brin. De plus, le génome de certains virus est formé d'ARN plutôt que d'ADN. L'ARN est présent dans les cellules comme intermédiaire lorsque les gènes sont traduits en protéines. Le génome des virus à ARN peut être codé dans deux directions différentes : soit les gènes sont stockés dans la direction 5'→3' (polarité positive ou +), comme celle dans laquelle les gènes sont codés dans l'ARN messager des cellules, soit ils sont stockés dans la direction opposée (polarité négative ou -).

La taxinomie des virus est similaire à celle des organismes cellulaires :

Ordre (-virales)
Famille (-viridae)
Sous-Famille (-virinae)
Genre (-virus)
Espèce

Cependant, le code de nomenclature géré par le Comité International sur la Taxinomie des Virus diffère des autres sur plusieurs aspects. Pour l'essentiel, les noms des ordres et des familles sont mis en italiques et les noms des espèces ne suivent pas la nomenclature binomiale mais sont souvent de la forme [Virus] de la [maladie]. La définition des ordres est très récente et a été délibérément lente ; à ce jour, seuls trois ont été nommés et la plupart des familles ne sont pas classées. En 2012, 96 familles et environ 2600 espèces virales sont décrites [1].

Classification par type de génome[modifier | modifier le code]

Virus à ADN[modifier | modifier le code]

L'information génétique de ces virus est stockée sous forme d'ADN.

Groupe I – Virus à ADN à double brin[modifier | modifier le code]

Groupe II – Virus à ADN à simple brin[modifier | modifier le code]

Virus à ARN[modifier | modifier le code]

L'information génétique est stockée sous forme d'ARN.

Groupe III – Virus à ARN à double brin[modifier | modifier le code]

Groupe IV – Virus à ARN simple brin à polarité positive (Virus (+)ssARN ou de type ARN messager)[modifier | modifier le code]

Groupe V – Virus à ARN simple brin à polarité négative[modifier | modifier le code]

Virus à ADN ou à ARN à transcription inverse[modifier | modifier le code]

Groupe VI – rétrovirus à ARN simple brin[modifier | modifier le code]

L'information génétique est codée sous forme d'ARN. Une enzyme associée au virus, la transcriptase inverse, crée de l'ADN à partir de l'ARN pour assurer la réplication dans une cellule hôte.

Groupe VII – Pararétrovirus à ADN double brin[modifier | modifier le code]

L'information génétique est codée sous forme d'ADN. La réplication se base sur l'ARNm.

Classification par type de capside[modifier | modifier le code]

Voir Capside

Voir aussi[modifier | modifier le code]

Note et référence[modifier | modifier le code]

  1. http://ictvonline.org
  2. (en) Michael J. Adams, John F. Antoniw et Jan Kreuze, « Virgaviridae: a new family of rod-shaped plant viruses », sur Springer, Archives of Virology,‎ 1er janvier 2009 (consulté le 1er novembre 2010).

Liens externes[modifier | modifier le code]