Domaine (biologie)

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En biologie, le domaine (néolatinisé en dominium) est dans certaines classifications biologiques le premier niveau de rang au-dessus des règnes. Il est parfois considéré comme un synonyme du terme plus traditionnel d'empire, toutefois ces notions ne se recouvrent pas totalement.

Historique[modifier | modifier le code]

Le terme domaine a été introduit pour discuter de la classification du monde vivant selon un modèle divisant celui-ci en trois grands groupes holophylétiques. Bien qu'étant de fait synonymes, l'emploi des termes domaine ou empire n'est pas tout à fait neutre. Le mot domaine est généralement rejeté par les taxonomistes qui contestent le modèle à trois domaines de Woese. Ce terme est également parfois rejeté par des taxonomistes qui acceptent ce système, simplement au nom de l'antériorité du terme empire.

Le modèle à trois domaines[modifier | modifier le code]

Arbre phylogénétique universel montrant les trois domaines selon Guillaume Lecointre & Hervé Le Guyader (2006) et d'après Purificación López-Garcıá & David Moreira (2008)[1].

La classification de Carl Woese[2] distingue trois domaines supposés holophylétiques :

  1. le domaine Eubacteria ou Bacteria
  2. le domaine Archaebacteria ou Archaea
  3. et le domaine Eukaryota ou Eucarya

Ces taxons reflètent des différences évolutives fondamentales du génome des organismes vivants.

Les unicontes et bicontes sont des sous-domaines des Eucaryotes[3].

Variantes[modifier | modifier le code]

D'autres modèles ont été proposés, parmi lesquels :

Critiques[modifier | modifier le code]

Pour les évolutionnistes la classification du monde vivant ne devrait pas se fonder uniquement sur des clades. Pour eux l'unité de base d'une classification véritablement phylogénétique est le taxon (voir empire et plan d'organisation).

Pour certains cladistes le modèle à trois domaines est obsolète pour la simple raison que les avancées en matière de phylogénétique semblent montrer que le domaine Eubacteria est en fait paraphylétique.

Autres rangs taxonomiques[modifier | modifier le code]

Les rangs taxonomiques[7] utilisés en systématique pour la classification hiérarchique du monde vivant sont les suivants (par ordre décroissant) :

Notes et références[modifier | modifier le code]

  1. (en) Purificación López-Garcıá & David Moreira, "Tracking microbial biodiversity through molecular and genomic ecology", Research in Microbiology, Vol.159, No.1, January-February 2008, p.67–73. DOI:10.1016/j.resmic.2007.11.019
  2. (en) C. R. Woese, W. E. Balch, L. J. Magrum, G. E. Fox and R. S. Wolfe, « An ancient divergence among the bacteria », dans Journal of Molecular Evolution, vol. 9, 1977, p. 305–311
  3. (en) Alexandra Stechmann et Thomas Cavalier-Smith, « The root of the eukaryote tree pinpointed », Current Biology, vol. 13, no 17,‎ 2 septembre 2003, R665-R666 (PMID 12956967, DOI 10.1016/S0960-9822(03)00602-X, lire en ligne)
  4. (en) E. Mayr, « Two empires or three? », Proc. Natl. Acad. Sci USA., vol. 95, no 17,‎ 1998, p. 9720–9723 (PMCID 33883, DOI 10.1073/pnas.95.17.9720, lire en ligne)
  5. (en) T. Cavalier-Smith, « Only six kingdoms of life », Proc. R. Soc. Lond. B, vol. 271,‎ 2004, p. 1251–62 (PMID 15306349, PMCID 1691724, DOI 10.1098/rspb.2004.2705, lire en ligne)
  6. Michael L. Cain, Hans Damman, Robert A. Lue, Carol Kaeseuk Yoon, Découvrir la biologie, De Boeck Supérieur, Bruxelles, 2006, p.26-27. ISBN 2-8041-4627-8
  7. En gras les 7 rangs principaux, en romaine les 5 rangs secondaires, en italique les noms latins.
  8. Un embranchement en zoologie, ou division en botanique, est traditionnellement caractérisé par une description schématique appelée « plan d'organisation ».
  9. Les taxons aux rangs de race et de sous-race n'ont pas de noms scientifiques (animaux domestiques principalement).

À lire[modifier | modifier le code]

Voir aussi[modifier | modifier le code]