Alphaproteobacteria
Cet article est une ébauche concernant la microbiologie.
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Règne | Pseudomonadati |
| Phylum | Pseudomonadota |
- Caulobacteria Cavalier-Smith 2020
- Alphabacteria Cavalier-Smith 2002
- Anoxyphotobacteria (Gibbons & Murray 1978) Murray 1988
Les Alphaproteobacteria (en français les Alphaprotéobactéries) sont une classe de bactéries à Gram négatif du phylum des Pseudomonadota. Son nom, formé sur les mots grecs alpha (ἄλφα : première lettre de l'alphabet) et Proteus (Προτεύς : Protée, dieu capable de se métamorphoser) complétés du néolatin bacteria (bactérie), n'est exceptionnellement pas dérivé du nom de son ordre type Caulobacterales.
C'est une classe très diversifiée qui comprend relativement peu de genres pathogènes humains tels que Bartonella, Brucella ou encore Rickettsia. On y trouve également des genres endosymbiotes d'arthropodes et de nématodes (Wolbachia), symbiotes de plantes dans la rhizosphère (Rhizobium),phototrophes (Rhodobacter) ou méthanotrophes (familles des Methylocystaceae et Beijerinckiaceae), etc. D'après la théorie endosymbiotique, les proto-mitochondries (en) dont proviennent les mitochondries actuelles sont vraisemblablement des Alphaproteobacteria proches des Rickettsia.
L'espèce Agrobacterium radiobacter (anciennement A. tumefaciens) est exploitée par le génie génétique comme vecteur de transfection pour introduire de l'ADN étranger dans des cellules végétales. Des adaptations à la présence de biocides et à des températures élevées ont été décrites chez Rubellimicrobium thermophilum dans un environnement industriel (fabrication de papier)[2].
Taxonomie
[modifier | modifier le code]Ce taxon est décrit en 2006 par G.M. Garrity et al. dans la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology[1]. Il est validé la même année par une publication dans l'IJSEM[3].
En 2013, M.P. Ferla et al. s'appuient sur un séquençage des gènes de l'ARN ribosomique de la grande et de la petite sous-unité pour proposer une subdivision des Alphaproteobacteria en trois sous-classes : Caulobacteridae, Magnetobacteridae et Ricketsiidae (corrig.)[4]
Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Alphaproteobacteria Garrity et al. 2006[5].
Le genre type est Caulobacter Henrici & Johnson 1935[5].
Synonymie
[modifier | modifier le code]Alphaproteobacteria a pour synonymes[5] :
- Alphabacteria Cavalier-Smith 2002
- Anoxyphotobacteria (Gibbons & Murray 1978) Murray 1988
- Candidatus Mariprofundia corrig. Emerson et al. 2007
- Candidatus Zetaproteobacteria Emerson et al. 2007
- Caulobacteria Cavalier-Smith 2020
- Magnetococcia Chuvochina et al. 2024
- Mariprofundia Cavalier-Smith 2020
- Zetaproteobacteria Makita et al. 2017
Liste d'ordres
[modifier | modifier le code]Ordres validement publiés
[modifier | modifier le code]Selon la LPSN (5 juin 2025)[5] :
- Caulobacterales Henrici & Johnson 1935 – ordre type
- Emcibacterales Iino et al. 2016
- Futianiales Liu et al. 2024
- Holosporales Szokoli et al. 2020
- Hyphomicrobiales Douglas 1957
- Iodidimonadales Iino et al. 2016
- Kordiimonadales Kwon et al. 2005
- Magnetococcales Bazylinski et al. 2013
- Mariprofundales Hördt et al. 2020
- Micropepsales Harbison et al. 2017
- Minwuiales Sun et al. 2018
- Rhodobacterales Garrity et al. 2006
- Rhodospirillales Pfennig & Trüper 1971
- Rhodothalassiales Venkata Ramana et al. 2014
- Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939
- Sneathiellales Kurahashi et al. 2008
- Sphingomonadales Yabuuchi & Kosako 2006
Ordres en attente de publication valide
[modifier | modifier le code]Selon la LPSN (5 juin 2025)[5] les ordres suivants sont en attente de publication valide (Ca. signifie Candidatus) :
- « Parvularculales » Garrity et al. 2003
- « Ca. Pelagibacterales » Grote et al. 2012
- « Ca. Puniceispirillales » Chuvochina et al. 2023
Voir aussi
[modifier | modifier le code]Articles connexes
[modifier | modifier le code]Liens externes
[modifier | modifier le code]- Ressource relative à la recherche : Ressource relative à la santé :
- (en) AlgaeBase : classe Alphaproteobacteria Garrity, Bell & Lilburn (+classification) (consulté le )
- (en) Catalogue of Life : Alphaproteobacteria Garrity et al., 2006 (consulté le )
- (fr + en) EOL : Alphaproteobacteria (consulté le )
- (fr + en) GBIF : Alphaproteobacteria (consulté le )
- (en) IRMNG : Alphaproteobacteria Garrity et al., 2006 (consulté le )
- (fr + en) ITIS : Alphaproteobacteria Garrity et al., 2006 (consulté le )
- (en) LPSN : Alphaproteobacteria Garrity et al. 2006 (consulté le )
- (en) NCBI : Alphaproteobacteria (taxons inclus) (consulté le )
- (en) OEPP : Alphaproteobacteria (consulté le )
- (en) Taxonomicon : Alphaproteobacteria Garrity et al. 2006 (consulté le )
- (en) WoRMS : Alphaproteobacteria (+ liste espèces) (consulté le )
Notes et références
[modifier | modifier le code]- Garrity GM, Bell JA & Lilburn T « Class I. Alphaproteobacteria class. nov. » In : Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2e édition, vol. 2 (The Proteobacteria), partie C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria). Springer, New York, 2005. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-0-387-29298-4_1
- ↑ (en) Ewald B. M. Denner, Marko Kolari, Douwe Hoornstra, Irina Tsitko, Peter Kämpfer, Hans-Jürgen Busse et Mirja Salkinoja-Salonen, « Rubellimicrobium thermophilum gen. nov., sp. nov., a red-pigmented, moderately thermophilic bacterium isolated from coloured slime deposits in paper machines », Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 56, no Pt 6, , p. 1355--1362 (DOI 10.1099/ijs.0.63751-0, résumé, lire en ligne, consulté le )
- ↑ Euzéby JP « Validation list no. 107. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published » Int J Syst Evol Microbiol. 2006;56(1):1-6. Accès libre.
- ↑ Ferla MP et al. « New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability » PLoS One 2013;8(12):e83383. Accès libre.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 5 juin 2025.
