« Haplogroupe H (ADNmt) » : différence entre les versions

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===H18===
H18 se rencontre dans la péninsule arabique.
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Version du 31 janvier 2020 à 10:58

Page d’aide sur l’homonymie

Pour les articles homonymes, voir Haplogroupe H.

Répartition spatiale des fréquences pour les haplogroupes H*, H1, H2a, H3, H4, H5a, H6a, H7, H8 and H11.

L'haplogroupe H est un haplogroupe du génome mitochondrial en génétique humaine. Il est particulièrement répandu en Europe où 40 % des habitants auraient des mitochondries de ce type, mais on le trouve tout autour de la Méditerranée et dans le Caucase, avec des poussées le long de l'est Africain et vers l'Asie centrale. Il existe différents sous-haplogroupe de H.

Histoire

Son histoire semble liée à celle de l'haplogroupe R1b, un haplogroupe du chromosome Y qui serait apparu il y a plus de 20 000 ans. En effet, leur aires de répartitions sont assez semblables. Le clade serait originaire d' Asie du Sud-Ouest il y a environ 20 000 à 25 000 ans.

Il s'est d'abord développé dans le nord du Proche-Orient et du Caucase du Sud entre 33 000 et 26 000 ans, et les migrations ultérieures de la péninsule ibérique suggèrent que le clade a atteint l'Europe avant le maximum de la dernière période glaciaire, il n'y a guère plus de 20 000 à 25 000 ans[1]. L'haplogroupe s'est également répandu dans certaines parties de l'Afrique, de la Sibérie et de l'Asie intérieure. Aujourd'hui, environ 40 % de toutes les lignées maternelles en Europe appartiennent à l'haplogroupe H.

Particulièrement présents sur la rive atlantique de l'Europe[2] (jusqu'à 50 % de la population chez les Basques notamment), ainsi qu'en Sardaigne et dans le sud de la péninsule Scandinave, il s'étend néanmoins jusqu'au Maghreb et en Europe de l'est, quoique dans une moindre mesure (autour de 10 %).

Les schémas phylogéographiques des sous-haplogroupes H1 et H3 ressemblent beaucoup à ceux de l'haplogroupe V. Les phylogénie en forme d'étoile, la répartition géographique et l'âge approximatif des trois clades suggèrent qu'ils ont tous participé à une expansion majeure du sud-ouest au nord-est de l'Europe il y a environ 12 000 à 14 000 ans. H1 et H3 représentent environ 65 % des lignées d'haplogroupe H dans la péninsule Ibérique, environ 46 % dans le nord-ouest, environ 27 % dans les pays d'Europe centrale et orientale et environ 5 % à 15 % au Proche-Orient et dans le Caucase, puis jusqu'à zéro dans le Golfe. Ces deux sous-clades seraient ainsi associés à l'expansion magdalénienne du sud-ouest européen il y a environ 13 000 ans[1].

Sous-clades

H1

H1 englobe une fraction importante des lignées d'ADNmt d'Europe occidentale et atteint son apogée parmi les Basques contemporains (27,8 %). Le clade est également présent à des fréquences élevées ailleurs dans la péninsule Ibérique et au Maghreb. La fréquence des haplogroupes est supérieure à 10 % dans de nombreuses autres régions d'Europe (France, Sardaigne, îles Britanniques, Alpes, grandes parties de l'Europe de l'Est) et dépasse 5 % dans presque tout le continent. Son sous-groupe H1b est le plus répandu en Europe orientale et dans le nord-ouest de la Sibérie.

En 2010, la fréquence la plus élevée du sous-groupe H1 a été constatée chez les Touareg vivant dans la région du Fezzan en Libye (61 %). L'haplogroupe H1* de base est trouvé chez les Touaregs habitant dans la région de Gossi au Mali (4,76%)

H2, H6 et H8

Les haplogroupes H2, H6 et H8 sont assez communs en Europe de l'Est et dans le Caucase. Ils sont sans doute les sous-clades H les plus communs parmi les Asiatiques centraux et ont également été trouvés en Asie occidentale. H2a5 a été trouvé au Pays basque, en Espagne ainsi qu'en Norvège , en Irlande et en Slovaquie.

H3

H3 est présent dans toute l'Europe et au Maghreb, mais n'existe pas en Extrême-Orient. On pense qu'il est né parmi les chasseurs-cueilleurs mésolithiques du sud-ouest de l'Europe il y a 9 000 à 11 000 ans. H3 représente la deuxième plus grande fraction du génome H après H1 et présente une distribution assez similaire, avec des pics au Portugal, en Espagne, en Scandinavie et en Finlande. Il est courant au Portugal (12%), en Sardaigne (11%), en Galice (10%), au Pays basque (10%), en Irlande (6%), en Norvège (6%), en Hongrie (6%) et dans le sud-ouest de la France (5%).

Marie-Thérèse d'Autriche ferait partie de l'Haplogroupe H3 (H3s précisément)[3].

H4, H7 et H13

Les trois sous-clades H4, H7 et H13 sont assez rares. Ils sont présents à la fois en Europe et dans l'ouest de l'Asie.

Le sous-haplogroupe H4 est présent à la fois dans la péninsule ibérique, en Grande-Bretagne et en Irlande.

Le sous-clade H13 se rencontre aussi dans le Caucase ; H13c a été découvert dans un échantillon de 9 700 ans dans un site datant du Mésolithique en Géorgie.

H4 et H13, comme H2 concourent à 42% des lignées de l'haplogroupe H en Égypte.

H5

H5 et H7 sont également fréquents dans le Caucase, mais leur incidence plus faible autour de la Méditerranée, et une fréquence plus élevée de l'Anatolie jusqu'aux Alpes via le Danube laissent entrevoir un lien possible avec la propagation de l'agriculture (G2a, etc.) ou des Indo-Européens haplogroupés de R1b-L23.

L'haplogroupe H5 s'étend lui aussi à travers l'Europe et autour de la Méditerranée jusqu'au Moyen-Orient, mais il est particulièrement représenté dans les Alpes, dans le pays de Galles, en Slovaquie ou encore en Lettonie, sans dépasser toutefois 10 % des populations.

Une sous-population de la région franco-cantabre d'haplogroupe H5+16192 pourrait être autochtone du nord de l'Espagne en particulier des Asturies. Celle-ci est une région très montagneuse historiquement isolée jusqu'au XXème siècle. L'haplogroupe H5+16192 représente 1,86 % de sa population asturienne et environ 25 % de ceux-ci qui partageraient la mutation en question.

Le sous-clade "H5a1-T152C!" débute l'homo sapien en Finlande, et parmi les habitantes actuelles en Normandie ayant des ancêtres Vikings[4].

H10

Le sous haplogroupe H10 est un sous clade âgé de 6 300 à 10 900 ans. Ses branches descendantes sont H10a H10b H10c H10d H10e H10f H10g et H10h.[5]

L'Haplogroupe H10e a été découvert sur un site datant du Néolithique, identifié sous le nom de la grotte Bom Santo près de Lisbonne, au Portigal. C'est le plus vieil échantillon of H10 jamais découvert et qui est daté de -3735 ans avant notre ère, à 45 ans près.[6]

H11

H11 s'observe plus fréquemment en Europe centrale. [7]

H18

H18 se rencontre dans la péninsule arabique. [8]


Arborescence

Arbre Philogénétique de l'Haplogroupe H

Cet arbre phylogénétique des sous-classes du haplogroupe H est basé sur Build 16 () du Phylotree, une norme internationalement acceptée.[9] L'arbre complet peut être vu à Phylotree.

Notes et références

  1. ↑ a et b Luísa Pereira, Martin Richards, Ana Goios et Antonio Alonso, « High-resolution mtDNA evidence for the late-glacial resettlement of Europe from an Iberian refugium », Genome Research, (ISSN 1088-9051, PMID 15632086, DOI 10.1101/gr.3182305, consulté le ), p. 19–24
  2. ↑ [1], Roostalu et coll., 2006
  3. ↑ http://www.eupedia.com/europe/Haplogroupe_H_ADNmt.shtml#c%C3%A9l%C3%A9brit%C3%A9s
  4. ↑ Homo sapiens haplogroup H5a1 mitochondrion
  5. ↑ « A "Copernican" reassessment of the human mitochondrial DNA tree from its root », American Journal of Human Genetics, vol. 90, no 4,‎ , p. 675–84 (PMID 22482806, PMCID 3322232, DOI 10.1016/j.ajhg.2012.03.002)
  6. ↑ (en) António Faustino de Carvalho, Bom Santo cave (Lisbon) and the middle neolithic societies of southern Portugal, Faro, Universidade do Algarvede., (ISBN 9789899766631, OCLC 946308166)
  7. ↑ Erreur de référence : Balise <ref> incorrecte : aucun texte n’a été fourni pour les références nommées pmid19340307
  8. ↑ « Mitochondrial DNA haplogroup H structure in North Africa », BMC Genetics, vol. 10,‎ , p. 8 (PMID 19243582, PMCID 2657161, DOI 10.1186/1471-2156-10-8)
  9. ↑ (en) « PhyloTree.org mtDNA subtree R0 »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?)

Voir aussi

Arbre phylogénétique des Haplogroupes de l'ADN mitochondrial (ADNmt) humain.

  Ève mitochondriale (L)    
L0 L1–6
L1 L2 L3   L4 L5 L6
  M   N  
CZ D E G Q   O A S   R   I W X Y
C Z B F R0   pre-JT P  U
HV JT K
H V J T
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