14 écluses à grand gabarit (190 m de long et 12 m de large) permettent la navigation commerciale comme plaisancière sur le Rhône entre Lyon à la mer, les écluses de Pierre-Bénite, Vaugris, Sablons, Gervans, Bourg-lès-Valence, Beauchastel, Logis-Neuf, Châteauneuf-du-Rhône, Bollène, Caderousse, Avignon, Beaucaire et pour rejoindre la mer méditerranée, l'écluse de Barcarin (non accessible aux plaisanciers) et le canal du Rhône à Fos ou l'écluse de Port-Saint-Louis-du-Rhône (132 m de long et 19 m de large) et le Canal Saint-Louis. Le passage des écluses est gratuit, possible 7 jours sur 7 et 24 heures sur 24 (seulement en journée pour les plaisanciers) et les écluses sont pilotées à distance par la CNR dans son Centre de Gestion de la Navigation (CGN) installé à Châteauneuf-du-Rhône[1].
Plusieurs ports commerciaux géré par la CNR sont disposé le long du fleuve entre Lyon et la mer : Le port Édouard-Herriot à Lyon, le port de Loire-Saint-Romain près de Vienne,
À Lyon, la navigation peut continuer sur la Saône. En amont de Lyon, les écluses de La Feyssine, Cusset et Jonage permettaient la poursuite de la navigation mais elles ont été abandonnées.
