Natura 2000 en France

Logo de Natura 2000.

Vue depuis les falaises calcaires, site des Rivières et Gorges du Loup (Alpes-Maritimes).

Le Réseau Natura 2000 regroupe, dans l'ensemble des pays de l'Union européenne, un ensemble d'aires protégées en vertu de deux directives :

• les zones de protection spéciale (ZPS) créées en application de la directive oiseau de 1976. Elles visent à protéger les espèces d'oiseaux, et leurs sites de nidification.
• les zones spéciales de conservation (ZSC) issues de la directives Habitat de 1992, dont l'objectif est de protéger les habitats naturels rares ou fragiles présents sur le territoire européen.

La France a choisi d'utiliser principalement une approche contractuelle dans la gestion de ses sites, au travers de contrats, donnant lieux à des subventions, pour des actions en faveur de la conservation de la nature ou des chartes pour le maintien en l'état des sites.

Les activités potentiellement néfastes sont, cependant, soumise à une évaluation et peuvent être interdites.

Le réseau Natura 2000 s'est doté d'un site web sur lequel est consultable en temps réel le nombre de sites et les surfaces par pays.

Historique

La France s'est dotée d'outils réglementaires efficaces à partir de 2001, au moyen de deux décrets :

1. décret n^o 2001-1031 du 8 novembre 2001 relatif à la procédure de désignation des sites Natura 2000 et modifiant le code rural (articles R. 214-15 à R. 214-22) ;
2. décret n^o 2001-1216 du 20 décembre 2001 relatif à la gestion des sites Natura 2000 et modifiant le code rural (articles R. 214-23 à R. 214-39).

Historiquement, après une période de « gel » de la procédure de désignation des sites, une réflexion nationale a permis de déterminer la méthode de désignation à mettre en œuvre en France, en application de la directive n^o 92/43/cee et de la directive n^o 2009/147/ce, selon des règles de désignation (et de gestion) traduites dans le droit français dans une section spécifique du Code de l'environnement (France).

Le réseau de sites Natura 2000 français a été particulièrement long à se mettre en place, souvent du fait des polémiques et du mauvais accueil réservé à ce qui a été perçu comme une confiscation des terres. Aussi la Cour de justice des Communautés européennes a sanctionné la France à trois reprises, malgré des avancées significatives, pour le retard pris dans la constitution du réseau Natura 2000 :

Massif des Maures vu depuis Gonfaron, dans la plaine des Maures.

• une première fois le 6 avril 2000, pour le retard pris par la France dans la transposition en droit national des deux directives Habitats et Oiseaux ;
• le 11 septembre 2001, pour insuffisance de propositions de zones spéciales de conservation (ZSC) ;
• le 26 novembre 2002, pour insuffisance de désignation de zones de protection spéciale (ZPS), notamment pour ne pas avoir classé une superficie suffisante de la plaine des Maures (département du Var) en ZPS.

À la suite de ces deux condamnations, les rapports entre la France et la Commission européenne sont devenus plus difficiles encore lorsque cette dernière a envoyé en 2004 à l’État français une mise en demeure, puis un avis motivé lui demandant de compléter rapidement son réseau de sites. Cet avis était assorti de menaces de sanctions, notamment de suspension des fonds structurels européens pour les régions qui ne se mettraient pas en conformité avec la directive Habitats.

Pour respecter ses engagements et éviter cette condamnation, la France a transmis en 2006 à la Commission européenne plus de 400 dossiers, se traduisant par un accroissement de la surface du réseau de + 14 % au titre de la directive Habitats-faune-flore et de + 167 % au titre de la directive Oiseaux. Cet effort considérable permet à la France de présenter, au 30 avril 2006, un réseau plus cohérent au regard des enjeux de sauvegarde de la biodiversité de son territoire.

En septembre 2007, le réseau français de sites Natura 2000 comptait 1 705 sites couvrant 6,8 millions d'hectares (hors milieux marins), soit 12,4 % du territoire métropolitain terrestre, comprenant :

• 1 334 sites d'intérêts communautaires (SIC) proposés, soit 4,6 millions d'hectares ;
• 371 zones de protection spéciales (ZPS) représentant 4,3 millions d'hectares.

La liste des sites français a été validée par la Commission européenne le 21 mars 2007, qui a classé définitivement les deux derniers contentieux pour insuffisance de désignation de sites Natura 2000 en France.

Le site internet européen « baromètre Natura 2000 » permet de suivre l'évolution du nombre de sites et de leur surface par pays, depuis 2011. Des ajustements manuels ont été faits régulièrement ce qui limite l'utilité des statistiques présentées.

La superficie terrestre couverte par le réseau Natura 2000 augmente lentement mais régulièrement, selon les chiffres présentés sur le baromètre européen.

Dans le domaine marin, une forte augmentation a eu lieu en 2014/2015 avec la création de sites en haute mer. L'élargissement s'est poursuivi avec l'ajout de huit nouveaux sites en 2018.

En décembre 2018, le réseau Natura 2000 compte en France 1 779 sites dont 212 sites marins, comprenant :

• 402 zones de protection spéciale (ZPS) pour les oiseaux ;
• 1 377 zones spéciales de conservation (ZSC) pour les habitats et les espèces.

La superficie totale est de 200 364 km², ce qui représente 12,9 % de la surface terrestre et marine du territoire de la France.

Évaluation périodique

L'article 17 de la directive Habitats impose une évaluation tous les six ans de l'état de conservation des habitats et espèces, par domaine biogéographique. Des évaluations ont eu lieu en 2013 et 2019. La directive oiseaux impose aux États-membres d'adresser à la commission européenne une synthèse sur les moyens mis en œuvre pour la protection des oiseaux, dans son article 12.

2007

Une première évaluation provisoire du réseau français a été menée pour la période 1995-2006 par divers experts regroupés par le MEDAD et le MNHN. Présentées en octobre 2007 cette évaluation a porté sur 132 habitats naturels et 290 espèces. Elle montre que même dans les zones Natura 2000, un grand nombre d'habitats et d'espèces sont dans un mauvais état de conservation : 53 % des habitats qui inscrits au titre de Natura 2000 sont en état de conservation « défavorable ou mauvais », de même que 43 % des 199 espèces de faune suivies et 43 % des 91 espèces floristiques patrimoniales suivies. Une analyse plus détaillée de cette évaluation doit être néanmoins faite, tous les groupes d'espèces ne sont pas en mauvais état de conservation (les mammifères sont jugés en bon état de conservation, à l'inverse des amphibiens par exemple), des nuances doivent être apportées selon le domaine biogéographique considéré.

On rappellera également que les habitats et espèces inscrits au titre de Natura 2000 ne sont pas représentatifs de la biodiversité, mais des espèces rares, et qui plus est du territoire européen, ce qui ne reflète pas la situation de l'un ou l'autre des États membres de l'Union.

2015

En 2015, le réseau natura 2000 français comptait 1758 sites pour 12,5 % de la superficie du territoire terrestre métropolitain.

La mission d'évaluation faisait le constat d'un climat largement apaisé sur la question du réseau Natura 2000, mais recommandait l'amélioration des mécanismes budgétaires et de suivi financier et le maintien du budget pour éviter que des tensions ne ressurgissent.

2021

En 2021, le réseau français compte 1756 sites Natura 2000, pour une superficie terrestre de 71 111 Km² et 132 610 Km² pour le domaine marin, ce qui représente 12.96 % du territoire national français.

Selon l'analyse de Paul Rouveyrol et Maya Leroy, publiée en janvier 2021, il existe des différences de conservation entre région biogéographique : dans les régions atlantiques et continentales les habitats et espèces sont dans un état de conservation fortement dégradé, par comparaison les régions méditerranéenne et alpine sont dans un meilleur état de conservation. Il faut dire que ces régions sont mieux couvertes par le réseau Natura 2000.

En matière de résultats, les deux chercheurs relèvent quatre points :

• Les espèces d'oiseaux spécialistes des milieux agricoles déclinent moins vite dans les sites Natura 2000 qu'en dehors, selon les données du STOC.
• Les communes dans lesquelles on trouve des ZPS ou ZSC ont perdu moins de surface de prairie permanente entre 2000 et 2010 que les autres.
• La quantité d'arbres de fort diamètre a plus augmenté dans les sites qu'en dehors.
• Les sites, aujourd'hui classés en Natura 2000, subissaient une urbanisation et un développement des grandes cultures moins rapide que dans le reste du territoire français. C'est toujours le cas, même s’il est difficile d'y voir un effet du classement.

En termes de moyens, les Mesures agro-environnementales et climatiques mobilisent la plus grosse part du budget, à l'échelle nationale.

Gestion

Chaque site Natura 2000 est géré par une « structure porteuse » désignée lors de la création du site. Il ne peut s'agir que d'une collectivité territoriale ou d'un groupement de collectivités territoriales concerné(e) par le site. Si aucune collectivité ne s'engage, c'est l'État qui le prend en charge.

Un comité de pilotage (dit Copil), équivalent du comité consultatif d'une réserve naturelle, doit veiller à la bonne application du droit et au bon déroulement de la gestion du site. Il regroupe des représentants des acteurs en présence sur le site : associations, agriculteurs, collectivités, pouvoirs publics, chasseurs, pêcheurs, etc. Selon le ministère de la transition écologique, 60% des Copil sont présidés par des élus, le reste étant par défaut présidé par des préfets.

La structure porteuse doit élaborer un document d'objectifs (couramment appelé DOCOB), Celui-ci dresse l'état des lieux naturels et socio-économiques et établit les objectifs de gestion du site, pour la conservation du patrimoine naturel, l'information et la sensibilisation du public, le travail réalisé en collaboration avec les acteurs locaux. Le DocOb comprend un échéancier des actions prévues. La rédaction peut être confiée à un tiers, le rédacteur du DocOb est appelé « Opérateur ». Sur le terrain, le suivi des actions réalisées peut être confié à une autre entité qui sera qualifiée de « structure animatrice ».

Le document d'objectifs d'un site est mis à la disposition du public dans toutes les mairies situées sur le territoire du site en question.

Les propriétaires fonciers peuvent s'engager sur des actions prévues dans une « charte Natura 2000 », tandis que les exploitants et autres ayants-droit (propriétaires compris) peuvent s'engager sur des « contrats », enfin les travaux sans rapport avec la protection de la nature sont soumis à des « études d'incidence ».

Contrats Natura 2000

L'entretien des haies fait partie des objectifs de certains contrats Natura 2000 visant à conserver le bocage traditionnel, ici dans le Boulonnais, Pas-de-Calais, France.

Il existe 3 types de contrat Natura 2000 : agricoles, forestier ou « ni-ni ».

Pour les terres agricoles ce sont les MAEC, « Mesures agro-environnementales et climatiques » (appelées MAET avant 2013, ou CAD avant 2007). Un contrat Natura 2000 indique la liste des « bonnes pratiques agro-environnementales » que le contractant s'engage à appliquer, ainsi que le descriptif des engagements qui, allant au-delà de ces bonnes pratiques, ouvrent droit à une contrepartie financière.

Les mesures agro-environnementales visent souvent à maintenir des pratiques agricoles anciennes, favorables à la biodiversité, comme le pâturage extensif, l'entretien du bocage ou de mares.

Le financement est assuré en partie par l'État et par l'Union européenne via le second pilier de la PAC et le FEADER géré par les régions. La rémunération du contractant est versée par l'Agence de Service et de Paiement (fusion en 2009 du CNASEA (Centre national pour l'aménagement des structures des exploitations agricoles) et de l'Agence unique de paiement).

Les contrats sont signés entre l'État et les propriétaires foncier ou les utilisateurs du terrain, leur rédaction nécessite cependant un important travail technique et administratif de la part des animateurs. Ce travail a tendance à être rendu invisible par la forme du contrat.

Chartes Natura 2000

Les Chartes Natura 2000 sont un nouvel outil contractuel mis en place par le gouvernement français, progressivement depuis 2005. Spécifique à chaque site et décrite dans le document d'objectifs, la charte Natura 2000 peut être considérée comme un contrat Natura 2000 simplifié : elle décrit les bonnes pratiques agro-environnementales auxquelles les propriétaires de terrain en site Natura 2000 peuvent souscrire, sans les contraindre trop fortement. Cet engagement permet néanmoins d'être exonéré de la taxe foncière sur les terrains non bâtis. Le signataire de la charte peut s'engager sur cinq ou dix ans, indépendamment ou en plus d'un contrat Natura 2000.

Une circulaire interministérielle du 30 avril 2007 précise le contenu de la charte Natura 2000, les modalités de son élaboration dans le cadre du DOCOB et la procédure d’adhésion à la charte.

Études d'incidence

Pour tout projet d'envergure non prévus par le DOCOB, la directive Habitats prévoit une procédure d'évaluation d'impact sur le site (pour une ZSC comme pour une ZPS). Si le projet peut avoir un impact important, il est annulé, sauf dérogation exceptionnelle pour des raisons impératives d'intérêt public (santé publique, sécurité publique, bénéfice économique et social vital, ou bénéfice environnemental indirect). Les projets soumis à ces études d'incidences sont répertoriés dans une liste nationale complétée par 2 listes départementales. Il peut s'agir de modification ou de rédaction de documents de planification, de projets de travaux, de manifestation ou de tout type d'interventions.

Pesticides

À la suite d'un recours de l'association France Nature Environnement, dans sa décision n°437613 du 15 novembre 2021, le conseil d'État impose au gouvernement d'interdire ou de réglementer l'usage des pesticides dans les zones Natura 2000, dans un délai de 6 mois.

Liste par département

#	Département	SIC	ZPS	Total
01	Ain	+19,	+08,	+27,
02	Aisne	+13,	+05,	+18,
03	Allier	+18,	+05,	+23,
04	Alpes-de-Haute-Provence	+23,	+04,	+27,
05	Hautes-Alpes	+16,	+07,	+23,
06	Alpes-Maritimes	+23,	+03,	+26,
07	Ardèche	+19,	+03,	+22,
08	Ardennes	+14,	+05,	+19,
09	Ariège	+15,	+06,	+21,
10	Aube	+17,	+05,	+22,
11	Aude	+19,	+16,	+35,
12	Aveyron	+26,	+03,	+29,
13	Bouches-du-Rhône	+16,	+14,	+30,
14	Calvados	+18,	+05,	+23,
15	Cantal	+27,	+04,	+31,
16	Charente	+19,	+05,	+24,
17	Charente-Maritime	+32,	+12,	+44,
18	Cher	+13,	+02,	+15,
19	Corrèze	+16,	+02,	+18,
2A	Corse-du-Sud	+37,	+10,	+47,
2B	Haute-Corse	+37,	+15,	+52,
21	Côte-d'Or	+14,	+03,	+17,
22	Côtes-d'Armor	+15,	+05,	+20,
23	Creuse	+11,	+02,	+13,
24	Dordogne	+21,	+00,	+21,
25	Doubs	+20,	+09,	+29,
26	Drôme	+27,	+06,	+33,
27	Eure	+16,	+02,	+18,
28	Eure-et-Loir	+04,	+02,	+06,
29	Finistère	+28,	+12,	+40,
30	Gard	+27,	+16,	+43,
31	Haute-Garonne	+08,	+04,	+12,
32	Gers	+06,	+00,	+06,
33	Gironde	+46,	+09,	+55,
34	Hérault	+35,	+17,	+52,
35	Ille-et-Vilaine	+10,	+03,	+13,
36	Indre	+07,	+02,	+09,
37	Indre-et-Loire	+06,	+04,	+10,
38	Isère	+22,	+04,	+26,
39	Jura	+28,	+11,	+39,
40	Landes	+26,	+05,	+31,
41	Loir-et-Cher	+07,	+06,	+13,
42	Loire	+16,	+05,	+21,
43	Haute-Loire	+25,	+02,	+27,
44	Loire-Atlantique	+14,	+12,	+26,
45	Loiret	+10,	+04,	+14,
46	Lot	+19,	+00,	+19,
47	Lot-et-Garonne	+15,	+00,	+15,
48	Lozère	+17,	+03,	+20,
49	Maine-et-Loire	+09,	+05,	+14,
50	Manche	+18,	+06,	+24,
51	Marne	+22,	+05,	+27,
52	Haute-Marne	+39,	+05,	+44,
53	Mayenne	+07,	+01,	+08,
54	Meurthe-et-Moselle	+21,	+06,	+27,
55	Meuse	+20,	+08,	+28,
56	Morbihan	+17,	+07,	+24,
57	Moselle	+21,	+06,	+27,
58	Nièvre	+20,	+04,	+24,
59	Nord	+11,	+06,	+17,
60	Oise	+14,	+03,	+17,
61	Orne	+20,	+01,	+21,
62	Pas-de-Calais	+23,	+07,	+30,
63	Puy-de-Dôme	+28,	+04,	+32,
64	Pyrénées-Atlantiques	+37,	+15,	+52,
65	Hautes-Pyrénées	+20,	+02,	+22,
66	Pyrénées-Orientales	+19,	+10,	+29,
67	Bas-Rhin	+10,	+06,	+16,
68	Haut-Rhin	+11,	+05,	+16,
69	Rhône	+04,	+00,	+04,
70	Haute-Saône	+08,	+05,	+13,
71	Saône-et-Loire	+19,	+06,	+25,
72	Sarthe	+12,	+00,	+12,
73	Savoie	+18,	+07,	+25,
74	Haute-Savoie	+25,	+11,	+36,
75	Paris	+00,	+00,	+00,
76	Seine-Maritime	+17,	+02,	+19,
77	Seine-et-Marne	+14,	+04,	+18,
78	Yvelines	+06,	+03,	+09,
79	Deux-Sèvres	+11,	+05,	+16,
80	Somme	+15,	+03,	+18,
81	Tarn	+09,	+01,	+10,
82	Tarn-et-Garonne	+07,	+02,	+09,
83	Var	+23,	+08,	+31,
84	Vaucluse	+11,	+03,	+14,
85	Vendée	+12,	+08,	+20,
86	Vienne	+12,	+08,	+20,
87	Haute-Vienne	+12,	+01,	+13,
88	Vosges	+28,	+02,	+30,
89	Yonne	+14,	+01,	+15,
90	Territoire de Belfort	+03,	+02,	+05,
91	Essonne	+07,	+03,	+10,
92	Hauts-de-Seine	+00,	+00,	+00,
93	Seine-Saint-Denis	+00,	+01,	+01,
94	Val-de-Marne	+00,	+00,	+00,
95	Val-d'Oise	+03,	+01,	+04,

Voir aussi

Articles connexes

• Réseau Natura 2000
• Aire protégée de France

Liens externes

• Liste des sites Natura 2000 en France, classés par région et avec liens vers leurs fiches respectives. Sur le site de l’Inventaire National du Patrimoine Naturel (INPN).