Désoxyribonucléase
Désoxyribonucléase | ||
Structure d'une DNase I humaine (PDB 4AWN) | ||
Caractéristiques générales | ||
---|---|---|
Symbole | DNASE | |
Code ATC | B06 | |
Gène DNASE1 – DNase I | ||
Homo sapiens | ||
Locus | 16p13.3 | |
Masse moléculaire | 31 434 Da[1] | |
Nombre de résidus | 282 acides aminés[1] | |
N° EC | 3.1.21.1 | |
Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO. | ||
Gène DNASE2 – DNase II lysosomale | ||
Homo sapiens | ||
Locus | 19p13.13 | |
Masse moléculaire | 39 581 Da[1] | |
Nombre de résidus | 360 acides aminés[1] | |
N° EC | 3.1.22.1 | |
Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO. | ||
Gène DNASE2B – DNase II β | ||
Homo sapiens | ||
Locus | 1p31.1 | |
Masse moléculaire | 41 713 Da[1] | |
Nombre de résidus | 361 acides aminés[1] | |
N° EC | 3.1.22.1 | |
Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO. | ||
La désoxyribonucléase (ou ADNase ou DNAse) est une enzyme clivant les acides désoxyribonucléiques en nucléotides ou polynucléotides. Elle hydrolyse les liaisons phosphodiester.
Prenons le cas de la DNase I : cette endonucléase réalise une coupure de type a, de préférence sur les bases pyrimidiques. En présence d'ions manganèse (Mn2+), elle coupe les deux brins en bouts francs ; avec des ions magnésium (Mg2+) elle coupe un brin en petits fragments.
Coupure de type a en bouts francs
5'-----'3'-OH + P-5-----3' 3'-----'5'-P HO-3-----5'
La réaction catalysée est la suivante :
ADN + H2O → nucléotides et/ou polynucléotides
Chez les bactéries, on distingue deux types de DNAses :
- Les désoxyribonucléases thermolabiles ;
- Les désoxyribonucléases thermostables, ou thermonucléases.
N° EC | EC |
---|---|
N° CAS |
IUBMB | Entrée IUBMB |
---|---|
IntEnz | Vue IntEnz |
BRENDA | Entrée BRENDA |
KEGG | Entrée KEGG |
MetaCyc | Voie métabolique |
PRIAM | Profil |
PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
GO | AmiGO / EGO |
N° EC | EC |
---|---|
N° CAS |
IUBMB | Entrée IUBMB |
---|---|
IntEnz | Vue IntEnz |
BRENDA | Entrée BRENDA |
KEGG | Entrée KEGG |
MetaCyc | Voie métabolique |
PRIAM | Profil |
PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
GO | AmiGO / EGO |
Bactériologie
[modifier | modifier le code]De nombreuses bactéries possèdent une ou plusieurs enzymes capables d'hydrolyser l'ADN. La mise en évidence de l'enzyme se fait sur les géloses à l'ADN.
Par exemple :
- Chez les Staphylococcus, la mise en évidence d'une thermonucléase suffit à l'identification de l'espèce Staphylococcus aureus. De plus chez cette espèce, La DNAse sécrétée est capable d'hydrolyser des acides ribonuléiques (elle possède une activité RNAse).
- Chez les Enterobacteriaceae TDA négatives, seules les souches appartenant au genre Serratia sécrètent une DNAse.
Applications pratiques
[modifier | modifier le code]En bactériologie, la recherche de la DNAse est un critère important dans l'identification de nombreux genres et espèces : Streptococcus ß-hémolytiques, Moraxella, Pseudomonas aeruginosa, Brevundimonas diminua, Stenotrophomonas maltophilia, Vibrio, Aeromonas, Bacillus, Micrococcus etc.
Notes et références
[modifier | modifier le code]- Les valeurs de la masse et du nombre de résidus indiquées ici sont celles du précurseur protéique issu de la traduction du gène, avant modifications post-traductionnelles, et peuvent différer significativement des valeurs correspondantes pour la protéine fonctionnelle.
Voir aussi
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