Entrez

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Le système global de recherches inter-bases de données Entrez (en anglais Entrez Global Query Cross-Database Search System) permet d'accéder à des bases de données du site internet du National Center for Biotechnology Information (NCBI). Le NCBI fait partie de la National Library of Medicine (NLM), qui est elle-même un département des National Institutes of Health (NIH) du gouvernement des États-Unis.

Sommaire

[modifier] Recherches

[modifier] Bases de Données

Entrez permet de faire une recherche globale ou filtrée dans les bases de données suivantes:

  • All Databases: recherche dans toutes les bases de donnée ci-dessous
  • NCBI web site: NCBI web and FTP web sites
  • PubMed: littérature scientifique et biomédicale avec le plus souvent accès aux résumés (abstracts). La consultation de l'article intégral est également possible pour certains journaux lorsqu'un lien a été établi avec l'éditeur.
  • Protein: recherche de séquences de protéines
  • Nucleotide: recherche de séquences de nucléotides (GenBank)
  • EST: Expressed Sequence Tags Database
  • GSS: Genome Survey Sequences Database
  • Structure: structures macromoléculaires en 3D
  • Genome: séquences complètes de génomes Mapping
  • BioSystems: voies métaboliques et systèmes biologiques
  • Books: livres en ligne
  • CancerChromosomes: aberrations cytogénétiques des cancers
  • Conserved domains: domaines conservés des protéines
  • 3D Domains: domaines de protéines en 3D
  • Epigenomics: modifications qui contrôlent l'expression des gènes
  • Gene: information complète sur les gènes
  • Genome Project: informations issues du Human Genome Project
  • dbGAP: génotypes et phénotypes (database of Genotypes and Phenotypes)
  • dbVar: variations structurelles de l'ADN (inversions, translocations, insertions et délétions)
  • GENSAT: atlas d'expression de gènes du système nerveux central de la souris
  • GEO Profiles: profils d'expression de gènes
  • HomoloGene: séquences homologues chez des groupes eucaryotes
  • Images:images, figures et tableaux provenant des articles déposés dans PubMed Central
  • MeSH: Catalogue des descripteurs (Medical Subject Headings)
  • NLM Catalog: données bibliographiques de la bibliothèque Nationale de Médecine américaine (NLM)
  • OMIM: transmission mendelienne chez l'homme
  • OMIA: transmission mendelienne chez l'animal
  • Peptidome: données d'identification de peptides et de protéines par spectrographie de masse en tandem
  • PMC: Pubmed Central, sous-ensemble de Pubmed comportant l'intégralité des articles accessibles librement
  • PopSet: données sur l'étude des populations (épidémiologie)
  • Probe: séquences spécifiques pour sondes moléculaires
  • Protein cluster:
  • PubChem BioAssay: bioactivité des substances chimiques
  • PubChem Compound: activité biologique et structure chimique de composés uniques
  • PubChem Substance: activité biologique et structure chimique de composés complexes
  • SNP: polymorphismes nucléotidiques simples
  • SRA: données issues du séquençage de dernière génération (Short Read Archive (SRA))
  • Taxonomy: organismes dans GenBank Taxonomie
  • UniGene: groupe de séquences transcrites issues d'un même gène
  • UniSTS: séquences uniques de l'ADN dont la localisation est la position sont connues

[modifier] Genbank

Article principal : GenBank

[modifier] Catalogue NLM

[modifier] Voir aussi

[modifier] Lien externe

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