Bonnie Berger

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Bonnie Berger
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Bonnie Anne Berger est une mathématicienne et informaticienne américaine, qui travaille comme professeure Simons de mathématiques et professeure de génie électrique et d'informatique au Massachusetts Institute of Technology. Ses intérêts de recherche portent sur les algorithmes, la bioinformatique et la biologie moléculaire computationnelle[1].

Éducation[modifier | modifier le code]

Berger a fait ses études de premier cycle à l'Université Brandeis et a obtenu son doctorat du MIT en 1990 sous la direction de Silvio Micali[1],[2]. En tant qu'étudiante, elle a remporté le prix Machtey (en) en 1989 pour un article sur les algorithmes parallèles (en) qu'elle a publié avec son camarade John Rompel au Symposium on Foundations of Computer Science[3].

Carrière et travaux[modifier | modifier le code]

Après avoir terminé son doctorat, Berger est restée au MIT pour des recherches postdoctorales où elle est devenue membre du corps professoral en 1992[1]. Ses recherches en bio-informatique ont été publiées dans des revues scientifiques à comité de lecture de premier plan, notamment Science, le Journal of Algorithms[4],[5]. Parmi ses anciens doctorants figurent Serafim Batzoglou (en)[2], Lior Pachter (en)[6], Mona Singh (en)[7], Manolis Kellis (en) et Phil Bradley (en).

Berger a été vice-présidente de l'International Society for Computational Biology (ISCB)[8] et présidente du comité directeur de RECOMB[9].

Prix et distinctions[modifier | modifier le code]

Berger est la lauréate 1997 du Margaret Oakley Dayhoff Award (en)[10]. En 1998, elle a été conférencière invitée du Congrès international des mathématiciens à Berlin (mais elle n'a pas pu faire une apparition personnelle)[11]. En 1999, Berger est incluse dans une liste des 100 meilleurs innovateurs (en) publiée par Technology Review[12]. En 2003, Berger est devenue membre de l'Association for Computing Machinery (ACM)[13] et en 2012, elle est devenue membre élue de l'Académie américaine des arts et des sciences et membre de l'International Society for Computational Biology (ISCB)[14],[15]. En 2016, Berger a été intronisée au collège des boursiers de l'American Institute for Medical and Biological Engineering (en) (AIMBE)[16]. Elle a été incluse dans la classe 2019 des fellows de l'American Mathematical Society « pour ses contributions à la biologie computationnelle, à la bioinformatique, aux algorithmes et au mentorat »[17]. Elle a également reçu un doctorat honorifique de l'École polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL). Elle est membre à titre personnel de la section des mathématiques de l'Association américaine pour l'avancement des sciences (AAAS). Elle a reçu le ISCB Accomplishment by a Senior Scientist Award en 2019. En 2020, elle a donné la conférence Sofia Kovalevskaïa de l'AWM - SIAM[18] et a en outre été élue à l'Académie nationale des sciences[19].

Références[modifier | modifier le code]

(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Bonnie Berger » (voir la liste des auteurs).
  1. ↑ a b et c « Bonnie Berger - MIT Mathematics », math.mit.edu
  2. ↑ a et b (en) « Bonnie Berger », sur le site du Mathematics Genealogy Project
  3. ↑ Fogg, Shamir et Kovats, « Bonnie Berger - Awards », Bioinformatics, vol. 36, no 20,‎ , p. 5122–5123 (PMID 33351928, PMCID 7755407, DOI 10.1093/bioinformatics/btz389)
  4. ↑ (en) S. Roy, J. Ernst, P. V. Kharchenko et P. Kheradpour, « Identification of Functional Elements and Regulatory Circuits by Drosophila modENCODE », Science, vol. 330, no 6012,‎ , p. 1787–1797 (ISSN 0036-8075, PMID 21177974, PMCID 3192495, DOI 10.1126/science.1198374, Bibcode 2010Sci...330.1787R).
  5. ↑ (en) Bonnie Berger, « Tight Bounds for the Maximum Acyclic Subgraph Problem », Journal of Algorithms, vol. 25,‎ , p. 1–18 (DOI 10.1006/jagm.1997.0864).
  6. ↑ (en) « Curriculum vitae: Lior Pachter », (consulté le ).
  7. ↑ (en) Mona Singh, Learning algorithms with applications to robot navigation and protein folding (thèse de doctorat), Massachusetts Institute of Technology, (OCLC 680493381, hdl 1721.1/40579).
  8. ↑ (en) « Aug 18, 2014 - ISCB Announces Results of the 2014 Officer Elections », ISCB (consulté le ).
  9. ↑ (en) « RECOMB STEERING COMMITTEE » (consulté le ).
  10. ↑ Dayhoff Award, Biophysical Society, retrieved January 15, 2015.
  11. ↑ (en) Serafim Batzoglou, Bonnie Berger, Daniel J. Kleitmanv, Eric Lander et Lior Pachter, Doc. Math. (Bielefeld) Extra Vol. ICM Berlin, 1998, vol. I, , 649–658 p., « Recent developments in computational gene recognition ».
  12. ↑ (en) « Bonnie Berger, 34 », Innovators Under 35, sur technologyreview.com, Technology Review, .
  13. ↑ (en) « Bonnie Berger: ACM Fellow », awards.acm.org.
  14. ↑ (en) 2012 new members, American Academy of Arts and Sciences, consulté le 15 janvier 2015.
  15. ↑ (en) « Berger Named ISCB Fellow - MIT CSAIL » (consulté le ).
  16. ↑ (en) « Bonnie Berger to be Inducted into Medical and Biological Engineering Elite », AIMBE (consulté le ).
  17. ↑ (en) « 2019 Class of the Fellows of the AMS », American Mathematical Society (consulté le ).
  18. ↑ (en) « Sonia Kovalevsky Lectures ».
  19. ↑ (en) « 2020 NAS Election », www.nasonline.org (consulté le ).

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