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Orthotospovirus

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Orthotospovirus
Description de cette image, également commentée ci-après
Tomate infectée par un tospovirus et montrant des tâches caractéristiques de décoloration.
Classification ICTV
 Rang ' royaume ' non reconnu  Riboviria
Règne Orthornavirae
Embranchement Negarnaviricota
Sous-embr. Polyploviricotina
Classe Ellioviricetes
Ordre Bunyavirales

Famille

Tospoviridae
ICTV 2018[1]

Genre

Orthotospovirus
ICTV 2016[2]

Espèces de rang inférieur

Selon ICTV[3] :

Orthotospovirus est un genre de virus, le seul de la famille des Tospoviridae, qui comprend 26 espèces. Ce sont des Virus à ARN monocaténaire à polarité négative rattachés au groupe V de la classification Baltimore, qui infectent diverses espèces d'Angiospermes (phytovirus). C'est l'unique genre de cette famille créée par scission de la famille des Bunyaviridae. Toutes les autres espèces décrites de la famille des Bunyaviridae infectent des animaux vertébrés.

Ce genre tire son nom de la découverte du Tomato Spotted Wilt Virus (TSWV, virus de la maladie bronzée de la tomate) en Australie en 1915. Il est resté le seul genre connu de la famille jusqu'au début des années 1990 quand la caractérisation génétique des virus découverts chez les plantes devint plus courante. Il existe au moins vingt « espèces » virales dans la famille. Dans l'ensemble, ces virus ont été documentés dans des infections concernant plus de 800 espèces de plantes de 82 familles différentes.

Génome

Ce virus a un génome ARN , il est donc classé dans le Groupe V des virus à ARN simple brin à polarité négative). La structure du génome ressemble à celle du genre Phlebovirus. Le génome est linéaire et a une taille de 17,2 kb. Il comprend trois segments appelés S (2,9 kb), M (5,4 kb) et L (8,9kb). les segments d'ARN M et S codent des protéines dans une orientation ambisens.

Transmission

Les Tospovirus sont des Arbovirus dont le vecteur est généralement un thrips. Au moins dix espèces de thrips de la famille des Thripidae ont été confirmés comme vecteurs de la transmission de treize, ou plus, Tospovirus[4]. Les thrips vecteurs ne sont pas étroitement apparentés, ce qui implique que l'infection de chaque espèce de thrips a une origine indépendante[5], qui a pu se transmettre horizontalement par l'intermédiaire d'hôtes communs. Il y a peut-être d'autres espèces de thrips capables de transmettre des virus similaires, mais elles n'ont pas été documentées sur des cultures ayant une importance économique significative.

Des recherches récentes concluent que les thrips ne peuvent être infectés par les Tospovirus que pendant les phases larvaires de leur développement, du fait que la nymphose et la métamorphose suppriment la connexion entre les glandes salivaires et les tissus musculaires infectés de l'intestin moyen[6]. Les adultes transmettent le virus par leurs glandes salivaires infectées, et les adultes non-infectés ne peuvent pas transmettre le virus. Bien entendu, le contrôle de l'infection en limitant la transmission des plantes infectées vers les larves de thrips ou en prévenant la dispersion des adultes à partir des plantes infectées sont des stratégies clés dans la prévention des épidémies de cette maladie[7],[8].

Importance en agriculture

L'infection par ces virus se traduit par des taches disséminées et le flétrissement des plantes, la réduction de la végétation, et finalement la mort de la plante hôte. Aucun traitement antiviral n'a été mis au point pour les plantes infectés par des Tospovirus, et les plantes infectées doivent être retirées du champ et détruites de manière à empêcher l'extension de la maladie.

Un grand nombre de familles de plantes sont connues pour être sensibles aux attaques des virus du genre Tospovirus. On y trouve notamment des plantes alimentaires (telles que arachides, pastèques, piments, tomates, courgettes, etc.) ainsi que des espèces ornementales importantes en horticulture florale (callas des fleuristes, impatientes, crysanthèmes, iris, 'etc.)[9].

Diagnostic

Les premiers symptômes d'une infection sont difficiles à diagnostiquer. Chez les plantes nouvellement infectées, les symptômes caractéristiques consistent en l'enroulement des feuilles vers l'intérieur et la multiplication de taches bronzées suivies par des points noirs sur les feuilles. Au fur et à mesure de la progression de l'infection, de nouveaux symptômes apparaissent parmi lesquels des stries sombres sur la tige principale et un flétrissement de la partie supérieure de la plante. les fruits peuvent se déformer, murir de façon inégale et souvent montrer des bosses à leur surface. Dès lors qu'une plante est infectée, la maladie ne peut plus être enrayée.

Épidémiologie

Le virus de la maladie bronzée de la tomate (TSWV) est répandu sous climat chaud dans les régions à forte population de thrips. Ce virus est un organisme nuisible pour l'agriculture en Asie, en Amérique, en Europe et en Afrique. Au cours des quinze dernières années, des attaques de maladie bronzée de la tomate se sont multipliées dans ces régions. le TSWV est donc décrit comme une maladie virale végétale émergente. Son expansion croissante est largement due à la pullulation du principal vecteur, le thrips Frankliniella occidentalis. Un autre thrips, Scirtothrips dorsalis, a aussi été impliqué dans la transmission d'au moins trois espèces de Tospovirus, mais son efficacité en tant que vecteur est discutée[10]. Des tests immunologiques et des études de « compétence » du vecteur indiquent que S. dorsalis pourrait être un porteur non-transmetteur pour certaines souches du virus.

Le succès de ce virus a également été attribué à l'acquisition dans le segment M du génome d'un gène qui code une protéine de mouvement. Cette protéine permet au virus d'infecter une large gamme d'hôtes. Le gène codant cette protéine a vraisemblablement été acquis par recombinaison soit d'un plante hôte, soit d'un autre phytovirus.

Lutte

La lutte contre cette maladie est difficile. L'une des raisons de cette difficulté réside dans la large gamme d'hôtes qui permet au virus d'hiverner en passant d'une culture à l'autre. Pour prévenir la diffusion du virus, il faut enlever et détruire immédiatement les plantes infectées. La lutte contre les insectes, en particulier les thrips, est essentielle pour limiter la diffusion du virus par ses vecteurs.

Notes et références

  1. ↑ ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 25 janvier 2021
  2. ↑ ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 25 janvier 2021
  3. ↑ (en) « Virus Taxonomy: 2019 Release », sur ICTV (consulté le ).
  4. ↑ (en) Jones, D. R. 2005. Plant viruses transmitted by thrips. European Journal of Plant Pathology 113: 119 - 157.
  5. ↑ (en) Mound, L. A. 2002. So many thrips – so few tospoviruses?, p. 15 - 18. In L. A. Mound and R. Marullo [eds.], Thrips and Tospoviruses: Proceedings of the 7th International Symposium on Thysanoptera. CSIRO Entomology, Reggio Calabria, Italy.
  6. ↑ (en) Moritz, G., S. Kumm, and L. A. Mound. 2004. Tospovirus transmission depends on thrips ontogeny. Virus research 100: 143 - 149.
  7. ↑ (en) Groves, R. L., J. F. Walgenbach, J. W. Moyer, and G. G. Kennedy. 2003. Seasonal Dispersal Patterns of Frankliniella fusca (Thysanoptera: Thripidae) and Tomato Spotted Wilt Virus Occurrence in Central and Eastern North Carolina. Journal of Economic Entomology 96: 1 - 11.
  8. ↑ (en) Nault, B. A., J. Speese III, D. Jolly, and R. L. Groves. 2003. Seasonal patterns of adult thrips dispersal and implications for management in eastern Virginia tomato fields. Crop Protection 22: 505 - 512.
  9. ↑ (en) Tospovirus host list « Copie archivée » (version du sur Internet Archive) at Kansas State University
  10. ↑ (en) Whitfield AE, Ullman DE, German TL (2005). Tospovirus-thrips interactions. Annual Review of Phytopathology. 43: 459–89.

Liens externes

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