Utilisateur:Thomasprovoost/Brouillon
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| Environnement | Java |
|---|---|
| Type | Traitement d'image |
| Licence | GNU GPL |
| Site web | http://icy.bioimageanalysis.org/ |
Icy[1][2][3] est une plateforme open-source d'analyse et de traitement d'images, développée en Java et créée à l'Institut Pasteur. Les fonctionnalités du logiciel sont extensibles via des plugins, scripts et protocoles graphiques dont l'hébergement est centralisé sur le site internet de l'application.
Fonctionnalités[modifier | modifier le code]
Grâce à la librairie Bio-Format créée par le consortium international de microscopie Open Microscopy Environnement, le logiciel peut ouvrir en natif plus de 120 types[4] différents d'images. Il s'appuie également sur la librairie Micro-Manager[5] pour l'acquisition directement depuis le microscope.
Icy fournit par défaut des outils de visualisation, tels qu'un histogramme par canal de couleur, une table de correspondance des couleurs et un système de multiples vues sur un même jeu de donnée sans les dupliquer en mémoire.
Liens externes[modifier | modifier le code]
Articles connexes[modifier | modifier le code]
Citations[modifier | modifier le code]
- de Chaumont, F. et al. (2012) Icy: an open bioimage informatics platform for extended reproducible research, Nature Methods, 9, pp. 690-696 - http://icy.bioimageanalysis.org
- http://www.openmicroscopy.org/site/support/bio-formats4/users/icy/
- http://www.mybiosoftware.com/image-analysis/9258
- http://www.openmicroscopy.org/site/products/bio-formats
- http://valelab.ucsf.edu/~MM/MMwiki/
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