Le 28 janvier 2000[3], soit plus de deux ans après la sortie du jeu en Europe, Nintendo a sorti, au Japon, une version mise à jour de celui-ci sur Game Boy Color. Intitulée Donkey Kong GB: Diddy Kong & Dixie Kong, cette nouvelle version était non compatible avec la Game Boy originelle monochrome. De plus, pour plusieurs raisons, elle n'est jamais sortie ailleurs qu'au Japon[2].