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'''Émile Zuckerkandl''', né le {{Date de naissance|4|juillet|1922}} à [[Vienne (Autriche)|Vienne]] ([[Autriche]]) et décédé le {{Date de décès|9|novembre|2013}}, est un biologiste français d'origine autrichienne considéré comme l'un des fondateurs du domaine de [[Évolution moléculaire|l'évolution moléculaire]]<ref>{{Lien web |
'''Émile Zuckerkandl''', né le {{Date de naissance|4|juillet|1922}} à [[Vienne (Autriche)|Vienne]] ([[Autriche]]) et décédé le {{Date de décès|9|novembre|2013}}, est un biologiste français d'origine autrichienne considéré comme l'un des fondateurs du domaine de [[Évolution moléculaire|l'évolution moléculaire]]<ref>{{Lien web|langue=de|auteur=Thomas Trenkler|titre=Emile Zuckerkandl 1922–2013 - Zeit |url=http://derstandard.at/1381373750360/Emile-Zuckerkandl-1922--2013 |site=Der Standard|date= |consulté le=2013-11-20}}</ref>. Il a introduit, avec [[Linus Pauling]], le concept d'« [[horloge moléculaire]] », qui a ouvert la voie à la [[théorie neutraliste de l'évolution]]. |
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== La vie et le travail == |
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Zuckerkandl a été élevé à [[Vienne (Autriche)|Vienne]], en [[Autriche]], dans une famille d'intellectuels |
Zuckerkandl a été élevé à [[Vienne (Autriche)|Vienne]], en [[Autriche]], dans une famille [[Juifs|juive]] d'intellectuels. Celle-ci déménage en 1938 à [[Paris]], puis à [[Alger]], pour échapper aux [[Antisémitisme|persécutions antisémites]] du [[Troisième Reich]]. À la fin de la [[Seconde Guerre mondiale]], il étudie un an à l'[[Université de Paris (1896-1970)|Université de Paris]] (Sorbonne), puis part aux [[États-Unis]] pour étudier la [[physiologie]] et obtient, en 1947, une maîtrise à l'[[Université de l'Illinois à Urbana-Champaign|Université de l'Illinois]], sous la direction de C. Ladd Prosser. Il retourne après à la Sorbonne pour terminer un doctorat en biologie. Zuckerkandl a développé un vif intérêt pour les aspects moléculaires ; ses premières recherches dans le [[Station biologique de Roscoff|laboratoire de biologie marine]] à [[Roscoff]] ont mis l'accent sur les rôles des [[Copper oxidase|oxydases de cuivre]] et de l'[[hémocyanine]] dans les cycles de mue des crabes. En 1957, il rencontre le célèbre chimiste américain [[Linus Pauling]], qui commençait à s'intéresser aux maladies moléculaires et à l'évolution moléculaire dans le prolongement de son activisme sur des sujets concernant l'énergie nucléaire. Ensemble, ils ont démandé une bourse post-doctorale et Zuckerkandl (accompagné de sa femme Jane) est retourné aux États-Unis pour travailler avec Pauling au [[California Institute of Technology]] à partir de 1959<ref name="History">{{Article|langue=en|prénom1=Gregory J.|nom1=Morgan|titre=Emile Zuckerkandl, Linus Pauling, and the Molecular Evolutionary Clock, 1959–1965|périodique=Journal of the History of Biology|volume=31|numéro=2|date=1998-06-01|issn=1573-0387|doi=10.1023/A:1004394418084|lire en ligne=https://doi.org/10.1023/A:1004394418084|consulté le=2023-02-09|pages=155–178}}</ref>. Il se déclare athée<ref>{{Lien web |langue=en-US|auteur=David Klinghoffer|titre=‘Darwin Would Put God Out of Business’ |url=https://www.discovery.org/a/3712/ |site=Discovery Institute |date=2006-08-23 |consulté le=2023-02-09}} {{citation|L'auteur est Emile Zuckerkandl de l'Université de Stanford. Le professeur Zuckerkandl attaque férocement le Dessein Intelligent et toute croyance en un concepteur, Dieu ou autre "super fantôme".}}.</ref>. |
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=== Linus Pauling et l'hypothèse de l'horloge moléculaire === |
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Le premier sujet d'étude de Zuckerkandl sous la direction de Pauling {{Incise|en collaboration avec le tout juste diplômé Richard T. Jones}} est l'application de nouvelles techniques d'identification des protéines |
Le premier sujet d'étude de Zuckerkandl sous la direction de Pauling {{Incise|en collaboration avec le tout juste diplômé Richard T. Jones}} est l'application de nouvelles techniques d'identification des protéines de [[Hémoglobine|l'hémoglobine]], qui combine la [[chromatographie sur papier]] et l'[[électrophorèse]], produisant un motif bidimensionnel. Les fragments peptidiques d'échantillons d'hémoglobine de différentes espèces, partiellement séparés par des [[enzymes digestives]], produiraient des modèles uniques qui pourraient être utilisés pour estimer les différences de structure des protéines. En 1960, Zuckerkandl, Jones et Pauling publient une comparaison des schémas d'identification de l'hémoglobine de plusieurs espèces<ref>{{Article|langue=en|prénom1=Emile|nom1=Zuckerkandl|prénom2=Richard T.|nom2=Jones|prénom3=Linus|nom3=Pauling|titre=A COMPARISON OF ANIMAL HEMOGLOBINS BY TRYPTIC PEPTIDE PATTERN ANALYSIS|périodique=Proceedings of the National Academy of Sciences|volume=46|numéro=10|date=1960-10|issn=0027-8424|issn2=1091-6490|pmid=16590757|pmcid=PMC223050|doi=10.1073/pnas.46.10.1349|lire en ligne=https://pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.46.10.1349|consulté le=2023-02-08|pages=1349–1360}}</ref>, qui démontre que le degré de dissemblance des schémas protéiques correspondait approximativement à la distance [[Phylogénie|phylogénétique]] entre ces espèces. Cependant, la méthode n'étant pas propice aux comparaisons quantitatives, Zuckerkandl commence à travailler sur la détermination de la [[Structure primaire|séquence peptidique]] réelle des chaînes α et β de l'hémoglobine [[Homo sapiens sapiens|humaine]] et de gorille<ref name="History" />. |
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Le premier article utilisant le concept d'[[horloge moléculaire]] de Pauling et Zuckerkandl (le concept n'est pas encore nommé ainsi) est publié en 1962. Comme un certain nombre d'articles collaboratifs ultérieurs, celui-ci n'est pas [[Évaluation par les pairs|évalué par des pairs]] {{Incise|c'est un article invité en l'honneur d'[[Albert Szent-Györgyi]]}} et ils en ont sciemment profité pour marquer les esprits : {{Citation|dire quelque chose de scandaleux}}. L'article a utilisé le nombre de différences dans les chaînes α et β de l'hémoglobine pour en déduire le temps écoulé depuis le dernier [[ancêtre commun]] pour un certain nombre d'espèces, à l'aune des preuves [[Paléontologie|paléontologiques]] pour les humains et les chevaux. Bien que l'article n'ait fourni aucune explication sur la raison pour laquelle les différences d'acides aminés dans une protéine devraient s'accumuler à un rythme uniforme (l'hypothèse essentielle de l'horloge moléculaire), il a montré que les résultats étaient assez cohérents avec ceux des paléontologues<ref |
Le premier article utilisant le concept d'[[horloge moléculaire]] de Pauling et Zuckerkandl (le concept n'est pas encore nommé ainsi) est publié en 1962. Comme un certain nombre d'articles collaboratifs ultérieurs, celui-ci n'est pas [[Évaluation par les pairs|évalué par des pairs]] {{Incise|c'est un article invité en l'honneur d'[[Albert Szent-Györgyi]]}} et ils en ont sciemment profité pour marquer les esprits : {{Citation|dire quelque chose de scandaleux}}. L'article a utilisé le nombre de différences dans les chaînes α et β de l'hémoglobine pour en déduire le temps écoulé depuis le dernier [[ancêtre commun]] pour un certain nombre d'espèces, à l'aune des preuves [[Paléontologie|paléontologiques]] pour les humains et les chevaux. Bien que l'article n'ait fourni aucune explication sur la raison pour laquelle les différences d'acides aminés dans une protéine devraient s'accumuler à un rythme uniforme (l'hypothèse essentielle de l'horloge moléculaire), il a montré que les résultats étaient assez cohérents avec ceux des paléontologues<ref name="History" />. |
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Au cours des années suivantes, Zuckerkandl travaille à l'amélioration de l'horloge moléculaire. En 1963, avec Pauling, il invente le terme « {{Lien|trad=semantide|fr=sémantide}} » pour les séquences biologiques {{Incise|ADN, ARN et polypeptides}} possèdant des informations évolutives. Ils ont fait valoir que ces séquences pourraient être la base de la construction de [[Phylogénétique moléculaire|phylogénies moléculaires]], et avancent que la méthode de « l'horloge moléculaire » pourrait être utile pour d'autres sémantides en plus des protéines. La première publication d'{{Lien|trad=Emanuel Margoliash}} sur les données de séquence du [[cytochrome c]] a permis de comparer les taux d'évolution moléculaire de différentes protéines (le cytochrome c semblait évoluer plus rapidement que l'hémoglobine), dont Zuckerkandl a discuté lors d'une conférence en 1964 à [[Bruges]]. Le biologiste@ a également mis à jour les formules mathématiques de «l'horloge» en intégrant les observations de certaines positions dans une séquence d'acides aminés plus stables que d'autres, et de la probabilité de substitutions multiples à la même position. Zuckerkandl assiste à l'important symposium [[Evolving Genes and Proteins]], en septembre 1964, où il présente avec Pauling leur article le plus marquant : "Evolutionary Divergence and Convergence in Proteins", publié dans les actes de la conférence l'année suivante<ref>{{Chapitre|langue=en|prénom1=Émile|nom1=Zuckerkandl|prénom2=Linus|nom2=Pauling|titre |
Au cours des années suivantes, Zuckerkandl travaille à l'amélioration de l'horloge moléculaire. En 1963, avec Pauling, il invente le terme « {{Lien|trad=semantide|fr=sémantide}} » pour les séquences biologiques {{Incise|ADN, ARN et polypeptides}} possèdant des informations évolutives. Ils ont fait valoir que ces séquences pourraient être la base de la construction de [[Phylogénétique moléculaire|phylogénies moléculaires]], et avancent que la méthode de « l'horloge moléculaire » pourrait être utile pour d'autres sémantides en plus des protéines. La première publication d'{{Lien|trad=Emanuel Margoliash}} sur les données de séquence du [[cytochrome c]] a permis de comparer les taux d'évolution moléculaire de différentes protéines (le cytochrome c semblait évoluer plus rapidement que l'hémoglobine), dont Zuckerkandl a discuté lors d'une conférence en 1964 à [[Bruges]]. Le biologiste@ a également mis à jour les formules mathématiques de «l'horloge» en intégrant les observations de certaines positions dans une séquence d'acides aminés plus stables que d'autres, et de la probabilité de substitutions multiples à la même position. Zuckerkandl assiste à l'important symposium [[Evolving Genes and Proteins]], en septembre 1964, où il présente avec Pauling leur article le plus marquant : "Evolutionary Divergence and Convergence in Proteins", publié dans les actes de la conférence l'année suivante<ref>{{Chapitre|langue=en|prénom1=Émile|nom1=Zuckerkandl|prénom2=Linus|nom2=Pauling|titre=Evolutionary Divergence and Convergence in Proteins|titre ouvrage=Evolving Genes and Proteins|éditeur=Elsevier|date=1965|doi=10.1016/b978-1-4832-2734-4.50017-6|lire en ligne=https://ia800704.us.archive.org/view_archive.php?archive=/24/items/wikipedia-scholarly-sources-corpus/10.1016%252F0968-0004%252892%252990304-R.zip&file=10.1016%252FB978-1-4832-2734-4.50017-6.pdf|format électronique=pdf|consulté le=2023-02-09|passage=97–166}}</ref>. L'article, essentiellement dû à Zuckerkandl, baptisait « l'horloge évolutive » et en présentait une nouvelle version de la formule mathématique. Bien que Zuckerkandl et Pauling considéraient l'horloge comme compatible avec la [[sélection naturelle]], celle-ci va devenir la base de la [[Théorie neutraliste de l'évolution|théorie neutre de l'évolution moléculaire]], dans laquelle la [[dérive génétique]] plutôt que la sélection est la force motrice de l'évolution au niveau moléculaire<ref name="History" />. |
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=== Travaux ultérieurs === |
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Il revient en France en 1965 pour diriger à Montpellier, le [http://www.crbm.cnrs.fr/?lang=en Centre de Recherche de Biochimie Macromoléculaire] du CNRS. En 1971, il devient rédacteur en chef fondateur du ''Journal of Molecular Evolution'', et devient à la fin des années 1970 président du [[Institut Linus-Pauling|Linus Pauling Institute]] (puis en 1992 de son successeur, l'Institute of Molecular Medical Sciences)<ref>{{Lien web |langue=en |titre=Profiles-Emile Zuckerkandl |url=https://authors.library.caltech.edu/5456/1/hrst.mit.edu/hrs/evolution/public/profiles/zuckerkandl.html |site=authors.library.caltech.edu |consulté le=2023-02-09}}</ref>. Son travail récent comprend la critique du constructionnisme social <ref>Emile |
Il revient en France en 1965 pour diriger à Montpellier, le [http://www.crbm.cnrs.fr/?lang=en Centre de Recherche de Biochimie Macromoléculaire] du CNRS. En 1971, il devient rédacteur en chef fondateur du ''Journal of Molecular Evolution'', et devient à la fin des années 1970 président du [[Institut Linus-Pauling|Linus Pauling Institute]] (puis en 1992 de son successeur, l'Institute of Molecular Medical Sciences)<ref>{{Lien web |langue=en |titre=Profiles-Emile Zuckerkandl |url=https://authors.library.caltech.edu/5456/1/hrst.mit.edu/hrs/evolution/public/profiles/zuckerkandl.html |site=authors.library.caltech.edu |consulté le=2023-02-09}}</ref>. Son travail récent comprend la critique du constructionnisme social <ref>{{Article|langue=en|prénom1=Emile|nom1=Zuckerkandl|titre=Social Constructionism, a Lost Cause|périodique=Journal of Molecular Evolution|volume=51|numéro=6|date=2000-12-01|issn=1432-1432|doi=10.1007/s002390010115|lire en ligne=https://doi.org/10.1007/s002390010115|consulté le=2023-02-09|pages=517–519}}.</ref> et du [[dessein intelligent]]<ref>{{Article|langue=en|prénom1=Emile|nom1=Zuckerkandl|titre=Intelligent design and biological complexity|périodique=Gene|volume=385|date=2006-12|issn=0378-1119|doi=10.1016/j.gene.2006.03.025|lire en ligne=http://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2006.03.025|consulté le=2023-02-09|pages=2–18}}.</ref>. |
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== Références == |
== Références == |
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Version du 10 février 2023 à 01:30
| Naissance |
Vienne (Autriche) |
|---|---|
| Décès |
(à 91 ans) Palo Alto (États-Unis) |
| Nationalité | Autrichien, Français puis Américain |
| Domaines | Biologie moléculaire, Génétique |
|---|---|
| Institutions | CNRS |
| Renommé pour | l'Horloge moléculaire |
Émile Zuckerkandl, né le à Vienne (Autriche) et décédé le , est un biologiste français d'origine autrichienne considéré comme l'un des fondateurs du domaine de l'évolution moléculaire[1]. Il a introduit, avec Linus Pauling, le concept d'« horloge moléculaire », qui a ouvert la voie à la théorie neutraliste de l'évolution.
La vie et le travail
Zuckerkandl a été élevé à Vienne, en Autriche, dans une famille juive d'intellectuels. Celle-ci déménage en 1938 à Paris, puis à Alger, pour échapper aux persécutions antisémites du Troisième Reich. À la fin de la Seconde Guerre mondiale, il étudie un an à l'Université de Paris (Sorbonne), puis part aux États-Unis pour étudier la physiologie et obtient, en 1947, une maîtrise à l'Université de l'Illinois, sous la direction de C. Ladd Prosser. Il retourne après à la Sorbonne pour terminer un doctorat en biologie. Zuckerkandl a développé un vif intérêt pour les aspects moléculaires ; ses premières recherches dans le laboratoire de biologie marine à Roscoff ont mis l'accent sur les rôles des oxydases de cuivre et de l'hémocyanine dans les cycles de mue des crabes. En 1957, il rencontre le célèbre chimiste américain Linus Pauling, qui commençait à s'intéresser aux maladies moléculaires et à l'évolution moléculaire dans le prolongement de son activisme sur des sujets concernant l'énergie nucléaire. Ensemble, ils ont démandé une bourse post-doctorale et Zuckerkandl (accompagné de sa femme Jane) est retourné aux États-Unis pour travailler avec Pauling au California Institute of Technology à partir de 1959[2]. Il se déclare athée[3].
Linus Pauling et l'hypothèse de l'horloge moléculaire
Le premier sujet d'étude de Zuckerkandl sous la direction de Pauling — en collaboration avec le tout juste diplômé Richard T. Jones — est l'application de nouvelles techniques d'identification des protéines de l'hémoglobine, qui combine la chromatographie sur papier et l'électrophorèse, produisant un motif bidimensionnel. Les fragments peptidiques d'échantillons d'hémoglobine de différentes espèces, partiellement séparés par des enzymes digestives, produiraient des modèles uniques qui pourraient être utilisés pour estimer les différences de structure des protéines. En 1960, Zuckerkandl, Jones et Pauling publient une comparaison des schémas d'identification de l'hémoglobine de plusieurs espèces[4], qui démontre que le degré de dissemblance des schémas protéiques correspondait approximativement à la distance phylogénétique entre ces espèces. Cependant, la méthode n'étant pas propice aux comparaisons quantitatives, Zuckerkandl commence à travailler sur la détermination de la séquence peptidique réelle des chaînes α et β de l'hémoglobine humaine et de gorille[2].
Le premier article utilisant le concept d'horloge moléculaire de Pauling et Zuckerkandl (le concept n'est pas encore nommé ainsi) est publié en 1962. Comme un certain nombre d'articles collaboratifs ultérieurs, celui-ci n'est pas évalué par des pairs — c'est un article invité en l'honneur d'Albert Szent-Györgyi — et ils en ont sciemment profité pour marquer les esprits : « dire quelque chose de scandaleux ». L'article a utilisé le nombre de différences dans les chaînes α et β de l'hémoglobine pour en déduire le temps écoulé depuis le dernier ancêtre commun pour un certain nombre d'espèces, à l'aune des preuves paléontologiques pour les humains et les chevaux. Bien que l'article n'ait fourni aucune explication sur la raison pour laquelle les différences d'acides aminés dans une protéine devraient s'accumuler à un rythme uniforme (l'hypothèse essentielle de l'horloge moléculaire), il a montré que les résultats étaient assez cohérents avec ceux des paléontologues[2].
Au cours des années suivantes, Zuckerkandl travaille à l'amélioration de l'horloge moléculaire. En 1963, avec Pauling, il invente le terme « sémantide (en) » pour les séquences biologiques — ADN, ARN et polypeptides — possèdant des informations évolutives. Ils ont fait valoir que ces séquences pourraient être la base de la construction de phylogénies moléculaires, et avancent que la méthode de « l'horloge moléculaire » pourrait être utile pour d'autres sémantides en plus des protéines. La première publication d'Emanuel Margoliash (en) sur les données de séquence du cytochrome c a permis de comparer les taux d'évolution moléculaire de différentes protéines (le cytochrome c semblait évoluer plus rapidement que l'hémoglobine), dont Zuckerkandl a discuté lors d'une conférence en 1964 à Bruges. Le biologiste@ a également mis à jour les formules mathématiques de «l'horloge» en intégrant les observations de certaines positions dans une séquence d'acides aminés plus stables que d'autres, et de la probabilité de substitutions multiples à la même position. Zuckerkandl assiste à l'important symposium Evolving Genes and Proteins, en septembre 1964, où il présente avec Pauling leur article le plus marquant : "Evolutionary Divergence and Convergence in Proteins", publié dans les actes de la conférence l'année suivante[5]. L'article, essentiellement dû à Zuckerkandl, baptisait « l'horloge évolutive » et en présentait une nouvelle version de la formule mathématique. Bien que Zuckerkandl et Pauling considéraient l'horloge comme compatible avec la sélection naturelle, celle-ci va devenir la base de la théorie neutre de l'évolution moléculaire, dans laquelle la dérive génétique plutôt que la sélection est la force motrice de l'évolution au niveau moléculaire[2].
Travaux ultérieurs
Il revient en France en 1965 pour diriger à Montpellier, le Centre de Recherche de Biochimie Macromoléculaire du CNRS. En 1971, il devient rédacteur en chef fondateur du Journal of Molecular Evolution, et devient à la fin des années 1970 président du Linus Pauling Institute (puis en 1992 de son successeur, l'Institute of Molecular Medical Sciences)[6]. Son travail récent comprend la critique du constructionnisme social [7] et du dessein intelligent[8].
Références
- (de) Thomas Trenkler, « Emile Zuckerkandl 1922–2013 - Zeit », sur Der Standard (consulté le )
- (en) Gregory J. Morgan, « Emile Zuckerkandl, Linus Pauling, and the Molecular Evolutionary Clock, 1959–1965 », Journal of the History of Biology, vol. 31, no 2, , p. 155–178 (ISSN 1573-0387, DOI 10.1023/A:1004394418084, lire en ligne, consulté le )
- (en-US) David Klinghoffer, « ‘Darwin Would Put God Out of Business’ », sur Discovery Institute, (consulté le ) « L'auteur est Emile Zuckerkandl de l'Université de Stanford. Le professeur Zuckerkandl attaque férocement le Dessein Intelligent et toute croyance en un concepteur, Dieu ou autre "super fantôme". ».
- (en) Emile Zuckerkandl, Richard T. Jones et Linus Pauling, « A COMPARISON OF ANIMAL HEMOGLOBINS BY TRYPTIC PEPTIDE PATTERN ANALYSIS », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 46, no 10, , p. 1349–1360 (ISSN 0027-8424 et 1091-6490, PMID 16590757, PMCID PMC223050, DOI 10.1073/pnas.46.10.1349, lire en ligne, consulté le )
- (en) Émile Zuckerkandl et Linus Pauling, « Evolutionary Divergence and Convergence in Proteins », dans Evolving Genes and Proteins, Elsevier, (DOI 10.1016/b978-1-4832-2734-4.50017-6, lire en ligne [PDF]), p. 97–166
- (en) « Profiles-Emile Zuckerkandl », sur authors.library.caltech.edu (consulté le )
- (en) Emile Zuckerkandl, « Social Constructionism, a Lost Cause », Journal of Molecular Evolution, vol. 51, no 6, , p. 517–519 (ISSN 1432-1432, DOI 10.1007/s002390010115, lire en ligne, consulté le ).
- (en) Emile Zuckerkandl, « Intelligent design and biological complexity », Gene, vol. 385, , p. 2–18 (ISSN 0378-1119, DOI 10.1016/j.gene.2006.03.025, lire en ligne, consulté le ).
