Utilisateur:NThor/F@h
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| Développé par | Stanford University / Pande Group |
|---|---|
| Dernière version |
Windows: 6.23 (Uniprocessor) 6.23 (GPU) Mac OS X: 6.20 (PPC-Uniprocessor) 6.20 (x86-SMP) Linux: 6.02 (Uniprocessor) 6.02 (x64-SMP) PlayStation 3: 1.4 [1] (2008-11-26 (Windows 6.23)) |
| Version avancée |
6.23beta (Windows SMP) 6.24beta (Linux x64-SMP) 6.24beta (Mac OS X x86-SMP) (2009-01-20 (6.24betas)) |
| Environnement | Windows Vista, Windows XP, Linux |
| Type | calcul réparti |
| Licence | Proprietary [2] |
| Site web | folding.stanford.edu |
Folding@home (Parfois raccourcis en FAH ou F@h) est un projet deCalcul distribué conçus pour calculer informatiquement des simulations intensives de repliement des protéines et autre dynamique moléculaire Il a été lancé le 1er octobre, 2001 et est actuellement géré par le Pande Group, avec le département chimie de l'l'université Stanford sous la supervision du professeur Vijay Pande Folding@home est le cluster de calcul distribué le plus puissant au monde selon le Livre Guinness des records, [1] et l'un des projets de calculs distribués les plus grand.[2]Le but du projet est de "comprendre le repliement des protéines, leur mauvais repliement et les maladies qui y sont liés.[3]
Objectifs[modifier | modifier le code]
La simulations précise des bons et mauvais pliage de protéines permettent à la communauté scientifique de mieux comprendre le développement de nombreuses maladies, parmi lesquels sickle-cell disease (drepanocytosis), la Maladie d'Alzheimer, la Maladie de Parkinson, la maladie de la vache folle, le cancer, Huntington's disease, cystic fibrosis, osteogenesis imperfecta, alpha 1-antitrypsin deficiency, et autre maladies "aggregation-related".[4] Plus fondamentalement, comprendre le processus de pliage des protéines — comment les molécules biologiques s'assemble en un état fonctionnel - est un des est problèmes "en suspens" de la biologie moléculaire. Jusqu'ici, le projet Folding@home a effectué avec succès des simulations de pliage à l'échelle des 5-10 microsecond — ce qui est une simulation bien plus longue qu'il était précédemment possible d'imaginer modéliser. Le but du Pande Group est d'affiner et d'améliorer les techniques de "MD and Folding@home DC" de tels manière qu'elles deviennent un outil essentiel pour la recherche MD.[5] Pour atteindre ce but, ils collabores avec de nombreuses institutions scientifiques.[6] Ainsi, à la date du 19 février, 2009, soixante trois articles de recherches scientifiques avait été publiés grâce au travail obtenu du projet.[7] A University of Illinois at Urbana-Champaign report dated October 22, 2002 states that Folding@home distributed simulations of protein folding are demonstrably accurate.[8]
Function[modifier | modifier le code]
Folding@home does not rely on powerful supercomputers for its data processing; instead, the primary contributors to the Folding@home project are many hundreds of thousands of personal computer users who have installed a small client program. The client will, at the user's choice, run in the background, utilizing otherwise unused CPU power, or run as a screensaver only while the user is away. In most modern personal computers, the CPU is rarely used to its full capacity at all times; the Folding@home client takes advantage of this unused processing power.
The Folding@home client periodically connects to a server to retrieve "work units", which are packets of data upon which to perform calculations. Each completed work unit is then sent back to the server. As data integrity is a major concern for all distributed computing projects, all work units are validated through the use of a 2048 bit digital signature.
Contributors to Folding@home may have user names used to keep track of their contributions. Each user may be running the client on one or more CPUs; for example, a user with two computers could run the client on both of them. Users may also contribute under one or more team names; many different users may join together to form a team. Contributors are assigned a score indicating the number and difficulty of completed work units. Rankings and other statistics are posted to the Folding@home website.
- Engadget, among other sites, announces that Guinness has recognized FAH as the most powerful distributed cluster, October 31, 2007. Retrieved November 5, 2007
- « Client Statistics by OS », Folding@home distributed computing, Stanford University, 2006-11-12 (updated automatically) (consulté le )
- Vijay Pande, « Folding@home distributed computing home page », Stanford University, (consulté le )
- « Folding@home diseases studied FAQ », Stanford University
- « Futures in Biotech 27: Folding@home at 1.3 Petaflops » [Interview, webcast]
- « Folding@home - About » [FAQ]
- Vijay Pande and the Folding@home team, « Folding@home - Papers », Folding@home distributed computing, Stanford University, (consulté le )
- C. Snow, H. Nguyen, V. S. Pande, and M. Gruebele., « Absolute comparison of simulated and experimental protein-folding dynamics », Nature, vol. 420, no 6911, , p. 102–106 (PMID 12422224, DOI 10.1038/nature01160)