PyMOL

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PyMOL
Les interfaces graphiques de PyMOL.
Les interfaces graphiques de PyMOL.

Développeur Schrödinger
Environnement Multiplate-forme
Langues Multilingue
Type Chemo-informatique
Licence Licence Python
Site web Site de PyMOL

PyMOL est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D créé par Warren DeLano. Il est principalement utilisé par les étudiants, les professeurs et les chercheurs en chimie et en biologie structurale. Il est développé en Python et est multi-plateformes. Ainsi, il fonctionne sous Windows, Mac OS X, Linux et les systèmes Unix. Ce logiciel est régulièrement utilisé pour produire des images 3D de grande qualité pour la publication scientifique. Selon l'auteur, environ un quart des images 3D de protéines publiées dans la littérature scientifique est réalisé avec PyMOL.


Modes de visualisation[modifier | modifier le code]

Le logiciel PyMOL supporte de nombreux modes de visualisation :

  • Fil de fer
  • Boule et bâton
  • Remplissage CPK
  • Ruban
  • Cartoon
  • Surface


Fichiers supportés[modifier | modifier le code]

PyMOL, de par son utilisation dans plusieurs domaines de la chimie et de la biologie, supporte plusieurs types de fichier :

  • structure (PDB, CIF, MOL, SDF, MOL2, ...) ;
  • carte de densité électronique (x-plor, cube, ...) ;
  • séquence biologique (fasta, ...).


Voir aussi[modifier | modifier le code]

Articles connexes[modifier | modifier le code]


Liens externes[modifier | modifier le code]