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La biologie évolutive du développement couvre un large éventail de domaines et d'exemples, permettant d'étudier l'évolution à travers les mécanismes du développement. Son but est essentiellement de comparer le rôles des différents gènes du développement dans l'évolution de différents taxons. Ici, nous nous concentrerons plus précisément sur le rôle que joue l'expression de différents gènes au cours du développement.