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Higher Taxa in Extant Reptiles
- Sauropsida
- sous-classe Anapsida − W fr.W
- ordre Testudines − W fr.W
- sous-ordre Cryptodira − W fr.W
- famille Chelydridae (UICN) − W fr.W
- super-famille Testudinoidea − W fr.W
- super-famille Kinosternoidea − W fr.W
- famille Dermatemydidae (UICN) − W fr.W
- famille Kinosternidae (UICN) − W fr.W
- super-famille Trionychoidea − W fr.W
- famille Trionychidae (UICN) − W fr.W
- famille Carettochelyidae (UICN) − W fr.W
- super-famille Chelonioidea − W fr.W
- famille Dermochelyidae (UICN) − W fr.W
- famille Cheloniidae (UICN) − W fr.W
- sous-ordre Pleurodira − W fr.W
- famille Chelidae (UICN) − W fr.W
- super-famille Pelomedusoidea − W fr.W
- famille Pelomedusidae (UICN) − W fr.W
- famille Podocnemididae (UICN) − W fr.W
- sous-ordre Cryptodira − W fr.W
- ordre Testudines − W fr.W
- sous-classe Archosauria − W fr.W
- ordre Crocodylia − W fr.W
- sous-ordre Eusuchia − W fr.W
- famille Alligatoridae (UICN) − W fr.W
- famille Crocodylidae (UICN) − W fr.W
- famille Gavialidae (UICN) − W fr.W
- sous-ordre Eusuchia − W fr.W
- ordre Crocodylia − W fr.W
- sous-classe Lepidosauria − W fr.W
- ordre Rhynchocephalia − W fr.W
- sous-ordre Sphenodontida − W fr.W
- famille Sphenodontidae (UICN) − W fr.W
- sous-ordre Sphenodontida − W fr.W
- ordre Squamata − W fr.W
- sous-ordre Ophidia − W fr.W
- famille Aniliidae − W fr.W
- famille Gerrhopilidae − W fr.W
- famille Anomochilidae (UICN) − W fr.W
- famille Pythonidae − W fr.W
- famille Lamprophiidae − W fr.W
- sous-famille Prosymninae − W fr.W
- sous-famille Pseudaspidinae − W fr.W
- sous-famille Atractaspidinae − W fr.W
- sous-famille Pseudoxyrhophiinae − W fr.W
- sous-famille Psammophiinae − W fr.W
- sous-famille Lamprophiinae − W fr.W
- sous-famille Aparallactinae − W fr.W
- famille Bolyeriidae (UICN) − W fr.W
- famille Typhlopidae (UICN) − W fr.W
- famille Viperidae (UICN) − W fr.W
- sous-famille Crotalinae − W fr.W
- sous-famille Viperinae − W fr.W
- sous-famille Azemiopinae − W fr.W
- famille Xenopeltidae − W fr.W
- sous-famille Booidea − W fr.W
- famille Elapidae (UICN) − W fr.W
- sous-famille Elapinae − W fr.W
- sous-famille Hydrophiinae − W fr.W
- sous-famille Elapoidea − W fr.W
- famille Loxocemidae − W fr.W
- famille Colubridae (UICN) − W fr.W
- sous-famille Calamariinae − W fr.W
- sous-famille Pseudoxenodontinae − W fr.W
- sous-famille Grayiinae − W fr.W
- sous-famille Colubrinae − W fr.W
- sous-famille Natricinae − W fr.W
- sous-famille Dipsadinae − W fr.W
- sous-famille Scaphiodontophiinae − W fr.W
- famille Uropeltidae − W fr.W
- sous-famille Pythonoidea − W fr.W
- famille Tropidophiidae (UICN) − W fr.W
- sous-famille Acrochordoidea − W fr.W
- famille Boidae (UICN) − W fr.W
- sous-famille Erycinae − W fr.W
- sous-famille Colubroidea − W fr.W
- sous-famille Ungaliophiinae − W fr.W
- sous-famille Boinae − W fr.W
- famille Pareatidae − W fr.W
- famille Xenotyphlopidae − W fr.W
- famille Leptotyphlopidae (UICN) − W fr.W
- sous-famille Epictinae − W fr.W
- sous-famille Leptotyphlopinae − W fr.W
- famille Cylindrophiidae − W fr.W
- famille Anomalepididae − W fr.W
- famille Homalopsidae − W fr.W
- famille Acrochordidae − W fr.W
- sous-famille Uropeltoidea − W fr.W
- famille Xenodermatidae − W fr.W
- sous-famille Typhlopoidea − W fr.W
- sous-ordre Sauria − W fr.W
- infra-ordre Dibamia − W fr.W
- infra-ordre Iguania − W fr.W
- famille Iguanidae (UICN) − W fr.W
- famille Dactyloidae − W fr.W
- famille Leiosauridae − W fr.W
- famille Polychrotidae (UICN) − W fr.W
- famille Liolaemidae − W fr.W
- famille Tropiduridae (UICN) − W fr.W
- famille Crotaphytidae (UICN) − W fr.W
- famille Hoplocercidae − W fr.W
- famille Opluridae − W fr.W
- famille Phrynosomatidae (UICN) − W fr.W
- famille Corytophanidae (UICN) − W fr.W
- famille Leiocephalidae − W fr.W
- famille Chamaeleonidae (UICN) − W fr.W
- famille Agamidae (UICN) − W fr.W
- famille Iguanidae (UICN) − W fr.W
- infra-ordre Gekkota − W fr.W
- famille Sphaerodactylidae − W fr.W
- famille Diplodactylidae − W fr.W
- famille Pygopodidae (UICN) − W fr.W
- famille Phyllodactylidae − W fr.W
- famille Carphodactylidae − W fr.W
- famille Gekkonidae (UICN) − W fr.W
- famille Eublepharidae (UICN) − W fr.W
- infra-ordre Diploglossa − W fr.W
- infra-ordre Platynota − W fr.W
- famille Lanthanotidae − W fr.W
- famille Helodermatidae (UICN) − W fr.W
- famille Varanidae (UICN) − W fr.W
- super-famille Shinisauroidea − W fr.W
- infra-ordre Scincomorpha − W fr.W
- sous-ordre Amphisbaenia − W fr.W
- sous-ordre Ophidia − W fr.W
- ordre Rhynchocephalia − W fr.W
- sous-classe Anapsida − W fr.W
References:
Overall taxonomy originally after
Zug,G.R.; Vitt, L.J. & Caldwell, J.P. (2001) Herpetology, 2nd ed. Academic Press San Diego, London, [...]XIV + 630 pp.
Turtles mainly after
Fujita, M.K.; Tag N. Engstrom, David E. Starkey and H. Bradley Shaffer (2004) Turtle phylogeny: insights from a novel nuclear intron. Molecular Phylogenetics and Evolution 31 (3): 1031-1040
For a more recent analysis see
Krenz, James G.; Gavin J.P. Naylor; H. Bradley Shaffer and Fredric J. Janzen (2005) Molecular phylogenetics and evolution of turtles. Molecular Phylogenetics and Evolution, Volume 37 (1):178-191
Squamata after multiple sources including
Gamble, T.; A. M. Bauer, e. Greenbaum & T. R. Jackman (2008) Out of the blue: a novel, trans-Atlantic clade of geckos (Gekkota, Squamata). Zoologica Scripta 37 (4): 355–366
Harris, D. J., Marshall, J.C. & Crandall, K.A. (2001) Squamate relationships based on C-mos nuclear DNA sequences: increased taxon sampling improves bootstrap support. Amphibia-Reptilia 22 (2): 235-242
Kumazawa, Y. (2007) Mitochondrial genomes from major lizard families suggest their phylogenetic relationships and ancient radiations. Gene 388: 19-26
Townsend, T. M., A. Larson, E. Louis, J. R. Macey. 2004. Molecular phylogentics of Squamata: The position of snakes, amphisbaenians, and dibamids, and the root of the squamate tree. Systematic Biology, 53(5):1-23.
Vidal, Nicolas and S. Blair Hedges (2005) The phylogeny of squamate reptiles (lizards, snakes, and amphisbaenians) inferred from nine nuclear protein-coding genes. Comptes Rendus Biologies 328 (10-11): 1000-1008
Douglas et al. (2006) found that snakes formed a sister clade to amphisbaenians which is rejected by Vidal et al. (2005).
Douglas, D.A.; Janke, A. & Arnason, U. (2006) A mitogenomic study on the phylogenetic position of snakes. Zoologica Scripta, 35: 545–558
Iguania after
Frost, D.R.; Etheridge, R.; Janies, D. & Titus, T.A. (2001) Total evidence, sequence alignment, evolution of Polychrotid lizards, and a reclassification of the Iguania (Squamata: Iguania). American Museum Novitates 3343: 38 pp.
Snakes mainly after
Pyron, R.A., et al. (2010) The phylogeny of advanced snakes (Colubroidea), with discovery of a new subfamily and comparison of support methods for likelihood trees. Mol. Phylogenet. Evol. (2010), doi:10.1016/j.ympev.2010.11.006
Lee, Michael S. Y.; Andrew F. Hugall, Robin Lawson & John D. Scanlon (2007) Phylogeny of snakes (Serpentes): combining morphological and molecular data in likelihood, Bayesian and parsimony analyses. Systematics and Biodiversity 5 (4): 371–389
Vidal, N., Delmas, A.S., David, P., Cruaud, C., Couloux, A., Hedges, S.B. (2007). The phylogeny and classification of caenophidian snakes inferred from seven nuclear protein-coding genes. Comptes Rendus Biologies 330: 182-187
Vidal et al. (2007) The higher-level relationships of alethinophidian snakes inferred from seven nuclear and mitochondrial genes. In: Henderson, R.W., Powell, R., (eds). Biology of the Boas and Pythons, Eagle Mountain Publ., Eagle Montain, Utah. Pp. 27-33.
Note 1: Scincomorpha, Diploglossa, Platynota are not monophyletic groups. According to Harris et al. the Cordylidae, Gerrhosauridae, Scincidae, and Xantusiidae form a clade whereas the Lacertidae and Teiidae from independent clades. Vidal & Hedges (2009) recognize Diploglossidae as a family.
Vidal, N. & Hedges, S.B. (2009) The molecular evolutionary tree of lizards, snakes, and amphisbaenians. Comptes Rendus Biologies, 332: 129–139; doi:10.1016/j.crvi.2008.07.010
However, a morphological analysis of the vaginal-cloacal region still yields a different topology, e.g. with the Dibamidae, Xantusiidae, and Amphisbaenia forming one branch:
Sánchez-Martínez, Paola María; Martha Patricia Ramírez-Pinilla and Daniel Rafael Miranda-Esquivel (2007) Comparative histology of the vaginal–cloacal region in Squamata and its phylogenetic implications. Acta Zoologica (Stockholm) 88: 289–307
Note 2: Vidal et al. (2005, 2007) and other authors suggested various conflicting trees of different topology. While some trees revealed some interesting relationships, such as the Anguidae forming a clade with the Helodermatidae and Varanidae (forming the Anguimorpha), they often lacked certain families (such as the Anniellidae, Xenosauridae etc.).
Note 3: Kelly et al. (2009) split the superfamily Elapoidea into 5 families: Atractaspididae (including Atractaspidinae and Aparallactinae), Lamprophiidae, Prosymnidae, Psammophiidae, Pseudaspididae, Pseudoxyrhophiidae (including Pseudoxyrhophiinae and Amplorhininae). While we follow Pyron et al. (2010) here, you can find Kelly's largely equivalent groups (e.g. their Atractaspididae) in the database (as Atractaspidinae etc).
Kelly, Christopher M. R.; Nigel P. Barker, Martin H. Villet and Donald G. Broadley 2009 PHYLOGENY, BIOGEOGRAPHY AND CLASSIFICATION OF THE SNAKE SUPERFAMILY ELAPOIDEA: A RAPID RADIATION IN THE LATE EOCENE. Cladistics 25: 38-63
For further taxonomic references on higher taxa see family pages or follow links to phylogeny pages.