Staphylococcus agnetis
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| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Phylum | Bacillota |
| Classe | Bacilli |
| Ordre | Caryophanales |
| Famille | Staphylococcaceae |
| Genre | Staphylococcus |
Staphylococcus agnetis est une bactérie émergente appartenant au genre Staphylococcus, qui fait partie du phylum des Bacillota (ex-Firmicutes), de la classe des Bacilli, de l'ordre des Caryophanales et de la famille des Staphylococcaceae.
Historique[modifier | modifier le code]
Cette bactérie a été isolée pour la première fois à partir d'échantillons de lait provenant de vaches laitières du sud de la Finlande, présentant des infections intramammaires subcliniques et légèrement cliniques. Depuis sa découverte initiale, S. agnetis a été identifiée dans différentes régions du globe[1],[2],[3].
Taxonomie[modifier | modifier le code]
Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Staphylococcus agnetis Taponen et al. 2012[4].
Étymologie[modifier | modifier le code]
L'étymologie de cette espèce est la suivante : « N.L. gen. fem. n. agnetis, of Agnes, named in honour of Europe’s first female veterinary surgeon, the Finn, Agnes Sjöberg (1888-1964), who struggled her way into the profession, despite resistance from her male colleagues »[4].
Le nom de S. agnetis est un hommage à Agnes Sjöberg[5], une vétérinaire finlandaise (1888-1964), qui fut la première femme vétérinaire en Europe et la première femme en Europe à obtenir un doctorat en médecine vétérinaire en 1918.
Pathogénicité[modifier | modifier le code]
Des études révèlent que S. agnetis est responsable de diverses maladies chez les poulets de chair et les poulets reproducteurs.
Description[modifier | modifier le code]
Cette bactérie Gram positive est coagulase-variable et facultativement anaérobie. Elle se présente sous forme de cocci non mobiles, non sporulés, pouvant se regrouper seuls, en paires ou en petits amas.
Les colonies de S. agnetis sur l'agar sang présentent une morphologie similaire à celles de S. hyicus, ce qui peut entraîner une mauvaise identification de ces deux espèces[6]. Contrairement à S. aureus, les colonies de S. agnetis ne montrent pas de pigmentation jaunâtre et peuvent être β-hémolytiques ou non hémolytiques.
D'un point de vue biochimique, S. agnetis est étroitement lié à S. hyicus et S. chromogenes. Certaines méthodes d'identification génétique, telles que le séquençage de l'ADNr 16S ou du gène dnaJ (protéine de choc thermique 40, Hsp40), se sont révélées insuffisamment précises pour différencier S. agnetis des autres espèces de Staphylococcus[7],[8].
Le séquençage des gènes de la sous-unité β de l'ARN polymérase (rpoB) et du facteur d'élongation Tu (tuf) permet de différencier S. agnetis de S. hyicus en utilisant des seuils suffisamment élevés[8].
Il convient de noter que la plupart des cas d'infections opportunistes signalés chez les poulets de chair causées par S. hyicus ont été enregistrés avant que S. agnetis ne soit reconnu en tant qu'espèce distincte. Il est possible que S. agnetis se soit divergé de S. hyicus il y a longtemps, et certaines des infections diagnostiquées à l'époque comme étant causées par S. hyicus pourraient en réalité avoir été causées par S. agnetis.
Pour faciliter la distinction entre S. hyicus, S. agnetis et S. aureus, une méthode utilisant un test PCR multiplex associé à l'électrophorèse en champ pulsé (PFGE) a été proposée. Le segment partiel du gène aroD a été amplifié dans le PCR multiplex pour identifier S. hyicus et S. agnetis, tandis que le gène nuc a été amplifié pour identifier S. aureus.
S. agnetis représente donc un nouvel agent pathogène émergent qui peut provoquer une chondronecrose bactérienne avec ostéomyélite, une endocardite et une septicémie chez les poulets de chair, nécessitant une attention particulière dans le domaine de la santé animale[9].
Références[modifier | modifier le code]
- (en) K.M. Cicconi-Hogan, N. Belomestnykh, M. Gamroth et P.L. Ruegg, « Short communication: Prevalence of methicillin resistance in coagulase-negative staphylococci and Staphylococcus aureus isolated from bulk milk on organic and conventional dairy farms in the United States », Journal of Dairy Science, vol. 97, no 5, , p. 2959–2964 (DOI 10.3168/jds.2013-7523, lire en ligne, consulté le )
- (en) Carla C. Lange, Maria A.V.P. Brito, Daniele R.L. Reis et Marco A. Machado, « Species-level identification of staphylococci isolated from bovine mastitis in Brazil using partial 16S rRNA sequencing », Veterinary Microbiology, vol. 176, nos 3-4, , p. 382–388 (DOI 10.1016/j.vetmic.2015.01.024, lire en ligne, consulté le )
- Sudipta Mahato, Hiral U. Mistry, Shalini Chakraborty et Paresh Sharma, « Identification of Variable Traits among the Methicillin Resistant and Sensitive Coagulase Negative Staphylococci in Milk Samples from Mastitic Cows in India », Frontiers in Microbiology, vol. 8, (ISSN 1664-302X, PMID 28824577, PMCID PMC5534481, DOI 10.3389/fmicb.2017.01446, lire en ligne, consulté le )
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 13 septembre 2023
- (en) « Species: Staphylococcus agnetis », sur lpsn.dsmz.de (consulté le )
- (en) Louise Ladefoged Poulsen, Ida Thøfner, Magne Bisgaard et Rikke Heidemann Olsen, « Staphylococcus agnetis, a potential pathogen in broiler breeders », Veterinary Microbiology, vol. 212, , p. 1–6 (DOI 10.1016/j.vetmic.2017.10.018, lire en ligne, consulté le )
- (en) Anna Wanecka, Jarosław Król, Jan Twardoń et Jacek Mrowiec, « Efficacy of MALDI-TOF mass spectrometry as well as genotypic and phenotypic methods in identification of staphylococci other than Staphylococcus aureus isolated from intramammary infections in dairy cows in Poland », Journal of Veterinary Diagnostic Investigation, vol. 31, no 4, , p. 523–530 (ISSN 1040-6387 et 1943-4936, PMID 31006359, PMCID PMC6857020, DOI 10.1177/1040638719845423, lire en ligne, consulté le )
- (en) P. R. F. Adkins, J. R. Middleton, M. J. Calcutt et G. C. Stewart, « Species Identification and Strain Typing of Staphylococcus agnetis and Staphylococcus hyicus Isolates from Bovine Milk by Use of a Novel Multiplex PCR Assay and Pulsed-Field Gel Electrophoresis », Journal of Clinical Microbiology, vol. 55, no 6, , p. 1778–1788 (ISSN 0095-1137 et 1098-660X, PMID 28330895, PMCID PMC5442534, DOI 10.1128/JCM.02239-16, lire en ligne, consulté le )
- (en) Gustaw M. Szafraniec, Piotr Szeleszczuk et Beata Dolka, « A Review of Current Knowledge on Staphylococcus agnetis in Poultry », Animals, vol. 10, no 8, , p. 1421 (ISSN 2076-2615, PMID 32823920, PMCID PMC7460464, DOI 10.3390/ani10081421, lire en ligne, consulté le )
Bibliographie[modifier | modifier le code]
- Publication originale (en) Suvi Taponen, Karlien Supré, Veerle Piessens, Els Van Coillie, Sarne De Vliegher et Joanna M. K. Koort, « Staphylococcus agnetis sp. nov., a coagulase-variable species from bovine subclinical and mild clinical mastitis. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 62, no 1, , p. 61-65 (DOI 10.1099/ijs.0.028365-061-65)
Liens externes[modifier | modifier le code]
- (en) Référence Catalogue of Life : Staphylococcus agnetis Taponen et al., 2012 (consulté le )
- (fr + en) Référence EOL : Staphylococcus agnetis (consulté le )
- (fr + en) Référence GBIF : Staphylococcus agnetis Taponen et al., 2012 (consulté le )
- (en) Référence LPSN : Staphylococcus agnetis Taponen et al. 2012 (consulté le )
- (en) Référence Taxonomicon : Staphylococcus agnetis Taponen et al. 2012 (consulté le )
