RollerCoaster Tycoon 3D reçoit un accueil très négatif de la critique spécialisée. Il obtient un score de 39% sur Metacritic sur la base de 14 critiques[3]. Nintendo Power considère que le jeu propose un bon degré de difficulté. Il déclare aussi qu'expérimenter avec la construction de montagnes russes est amusant. Cependant, il est déçu par la trop faible quantité d'attractions disponibles. Il déclare à ce sujet que le joueur « possède une quantité infinie de fonds et un énorme espace sur lequel travailler, mais qu'il y a une si petite limite d'attractions, morceaux de montagnes russes, éléments de décors, magasins et types de chemins à ajouter dans le parc. » Il regrette qu'il ne soit plus possible, contrairement aux autres jeux de la série, de connaître le statut des visiteurs ou encore qu'il ne soit plus possible de renommer les attractions. Enfin, il trouve l'interface très « lourde », trouvant particulièrement difficile de modifier certaines parties d'une montagne russe une fois construite[2].