Alphaproteobacteria

Classification LPSN
Domaine	Bacteria
Embranchement	Pseudomonadota

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Les Alphaproteobacteria (en français les Alphaprotéobactéries) sont une classe de bactéries à Gram négatif de l'embranchement des Pseudomonadota. Son nom, formé sur les mots grecs alpha (ἄλφα : première lettre de l'alphabet) et Proteus (Προτεύς : Protée, dieu capable de se métamorphoser) complétés du néolatin bacteria (bactérie), n'est exceptionnellement pas dérivé du nom de son ordre type Caulobacterales.

C'est une classe très diversifiée qui comprend relativement peu de genres pathogènes humains tels que Bartonella, Brucella ou encore Rickettsia. On y trouve également des genres endosymbiotes d'arthropodes et de nématodes (Wolbachia), symbiotes de plantes dans la rhizosphère (Rhizobium),phototrophes (Rhodobacter) ou méthanotrophes (familles des Methylocystaceae et Beijerinckiaceae), etc. D'après la théorie endosymbiotique, les proto-mitochondries (en) dont proviennent les mitochondries actuelles sont vraisemblablement des Alphaproteobacteria proches des Rickettsia.

L'espèce Agrobacterium radiobacter (anciennement A. tumefaciens) est exploitée par le génie génétique comme vecteur de transfection pour introduire de l'ADN étranger dans des cellules végétales. Des adaptations à la présence de biocides et à des températures élevées ont été décrites chez Rubellimicrobium thermophilum dans un environnement industriel (fabrication de papier)^[2].

Taxonomie

Ce taxon est décrit en 2006 par G.M. Garrity et al. dans la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology^[1]. Il est validé la même année par une publication dans l'IJSEM^[3].

En 2013, M.P. Ferla et al. s'appuient sur un séquençage des gènes de l'ARN ribosomique de la grande et de la petite sous-unité pour proposer une subdivision des Alphaproteobacteria en trois sous-classes : Caulobacteridae, Magnetobacteridae et Ricketsiidae (corrig.)^[4]

Liste d'ordres

Ordres validement publiés

Selon la LPSN (3 décembre 2022)^[5] :

Caulobacterales Henrici & Johnson 1935 – ordre type
Emcibacterales Iino et al. 2016
Holosporales Szokoli et al. 2020
Hyphomicrobiales Douglas 1957
Iodidimonadales Iino et al. 2016
Kordiimonadales Kwon et al. 2005
Magnetococcales Bazylinski et al. 2013
Micropepsales Harbison et al. 2017
Minwuiales Sun et al. 2018
Rhodobacterales Garrity et al. 2006
Rhodospirillales Pfennig & Trüper 1971
Rhodothalassiales Venkata Ramana et al. 2014
Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939
Sneathiellales Kurahashi et al. 2008
Sphingomonadales Yabuuchi & Kosako 2006

Ordres en attente de publication valide

Selon la LPSN (3 décembre 2022)^[5] les ordres suivants sont en attente de publication valide (Ca. signifie Candidatus) :

« Parvularculales » Garrity et al. 2003
« Ca. Pelagibacterales » Grote et al. 2012

Voir aussi

Articles connexes

Notes et références

↑ ^{a et b} Garrity GM, Bell JA & Lilburn T « Class I. Alphaproteobacteria class. nov. » In : Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2^e édition, vol. 2 (The Proteobacteria), partie C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria). Springer, New York, 2005. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-0-387-29298-4_1
↑ (en) Ewald B. M. Denner, Marko Kolari, Douwe Hoornstra, Irina Tsitko, Peter Kämpfer, Hans-Jürgen Busse et Mirja Salkinoja-Salonen, « Rubellimicrobium thermophilum gen. nov., sp. nov., a red-pigmented, moderately thermophilic bacterium isolated from coloured slime deposits in paper machines », Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 56, n^o Pt 6,‎ juin 2006, p. 1355--1362 (DOI 10.1099/ijs.0.63751-0, résumé, lire en ligne, consulté le 27 février 2015)
↑ Euzéby JP « Validation list no. 107. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published » Int J Syst Evol Microbiol. 2006;56(1):1-6. Accès libre.
↑ Ferla MP et al. « New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability » PLoS One 2013;8(12):e83383. Accès libre.
↑ ^{a et b} List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 3 décembre 2022

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[Garrity_2006-1] {a et b} Garrity GM, Bell JA & Lilburn T « Class I. Alphaproteobacteria class. nov. » In : Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2^e édition, vol. 2 (The Proteobacteria), partie C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria). Springer, New York, 2005. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-0-387-29298-4_1

[2] (en) Ewald B. M. Denner, Marko Kolari, Douwe Hoornstra, Irina Tsitko, Peter Kämpfer, Hans-Jürgen Busse et Mirja Salkinoja-Salonen, « Rubellimicrobium thermophilum gen. nov., sp. nov., a red-pigmented, moderately thermophilic bacterium isolated from coloured slime deposits in paper machines », Int. J. Syst. Evol. Microbiol., vol. 56, n^o Pt 6,‎ juin 2006, p. 1355--1362 (DOI 10.1099/ijs.0.63751-0, résumé, lire en ligne, consulté le 27 février 2015)

[3] Euzéby JP « Validation list no. 107. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published » Int J Syst Evol Microbiol. 2006;56(1):1-6. Accès libre.

[4] Ferla MP et al. « New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability » PLoS One 2013;8(12):e83383. Accès libre.

[LPSN3_décembre_2022-5] {a et b} List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 3 décembre 2022

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