Pseudoproline

Structure d'une pseudoproline formée à partir d'un résidu de sérine, de thréonine ou de cystéine.
X correspond à un atome d'oxygène dans le cas d'une oxazolidine et à un atome de soufre dans le cas d'une thiazolidine.

Une pseudoproline (ψ-Pro) est un segment dipeptidique produit artificiellement par modification d'un résidu de sérine, de thréonine ou de cystéine afin de d'introduire une structure de type oxazolidine ou thiazolidine dans les chaînes peptidiques dans le but de minimiser les phénomènes d'agrégation au cours de la synthèse peptidique en phase solide par Fmoc. Ces modifications sont réalisées à l'aide d'aldéhydes ou de cétones. Un résidu de sérine conduit ainsi à un cycle oxazolidine (Oxa), un résidu de thréonine conduit à un dérivé méthylé (Oxa(5-Me)), et un résidu de cystéine conduit à un cycle thiazolidine (Thz), analogue soufré de l'oxazolidine. Ces structures sont parfois notées Ser(ψPro), Thr(ψPro) et Cys(ψPro) respectivement.

La production de peptides de grande taille par synthèse peptidique en phase solide (SPPS) tend à être limitée par des problèmes de faible solvatation ou de faible solubilité de fragments peptidiques protégés : même les procédés les plus sélectifs sont affectés par l'auto-assemblage de segments peptidiques non protégés. La formation spontanée de feuillets β est notamment responsable d'une baisse significative de solvatation et de solubilité des précurseurs protéiques intervenant dans les SPPS Fmoc. L'une des méthodes permettant d'accroître la solvatation des peptides au cours de ces synthèses consiste à modifier certains résidus de sérine, de thréonine ou de cystéine pour former une pseudoproline qui altère les propriétés physicopchimiques des chaînes peptidiques par l'introduction d'un coude qui empêche leur empilement en feuillets β.