« Korarchaeota » : différence entre les versions

Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre.
Contenu supprimé Contenu ajouté
Addbot (discuter | contributions)
m Retrait de 15 liens interlangues, désormais fournis par Wikidata sur la page d:q504947
Bob Saint Clar (discuter | contributions)
m Compléments.
Ligne 1 : Ligne 1 :
{{ébauche|bactériologie}}
{{Taxobox début | archaea | ''Korarchaeota'' | Korarchaeota.jpg | ''Korarchaeota'' }}
{{Taxobox début | archaea | ''Korarchaeota'' | Korarchaeota.jpg | ''Korarchaeota'' }}
{{Taxobox taxon | archaea | embranchement | Korarchaeota | [[Susan M. Barns|Barns]] ''et al.'' [[1996]]<ref>Barns, Susan M., Fundyga, R.E., Jeffries, M.W., and Pace, N.R. "Remarkable archaeal diversity detected in a Yellowstone National Park hot spring environment." Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1994) 91:1609-1613.</ref>}}
{{Taxobox taxon | archaea | embranchement | Korarchaeota | [[Susan M. Barns|Barns]] ''et al.'' [[1996]]<ref>Barns, Susan M., Fundyga, R.E., Jeffries, M.W., and Pace, N.R. "Remarkable archaeal diversity detected in a Yellowstone National Park hot spring environment." Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1994) 91:1609-1613.</ref>}}
{{Taxobox synonymes |
* ''Xenarchaeota''
* ''Xenarchaea''
}}
{{Taxobox phylogénie arbre |
* ''[[Archaea]]''
** ''[[Crenarchaeota]]''
** ''[[Euryarchaeota]]''
** ''[[Korarchaeota]]''
** ''[[Nanoarchaeota]]''
** ''[[Thaumarchaeota]]''
}}
{{Taxobox taxons | classe |
* ''Candidatus [[Korarchaeum]]''<ref>{{NCBI|498845|''Candidatus Korarchaeum''}}</ref>
}}
{{Taxobox fin}}
{{Taxobox fin}}
Les '''''Korarchaeota''''', ou '''''Xenarcheota''''', sont un [[Embranchement (biologie)|embranchement]] (''phylum'') d'[[Archaea|archées]] [[thermophile]]s mis en évidence par l'analyse de séquences d'[[ARN ribosomique|ARNr 16S]]<ref>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC38617/</ref> à partir d'échantillons environnementaux provenant de [[Source chaude|sources chaudes]] du [[parc national de Yellowstone]]).


Ce organismes se seraient différentiés assez tôt des ''[[Crenarchaeota]]'' et des ''[[Euryarchaeota]]'', comme le suggèrent des études [[génétique]]s<ref name="10.1073/pnas.93.17.9188">
Les '''''Korarchaeota''''' sont le troisième phylum d'[[Archaea]] mis en évidence par l'analyse de séquences d'ARNr<ref>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC38617/</ref> à partir d'échantillons environnementaux (sources du parc de Yellowstone).
{{Article
| langue = en
| nom1 = S. M. Barns, C. F. Delwiche, J. D. Palmer et N. R. Pace
| titre = Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences
| périodique = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
| volume = 93
| numéro = 17
| jour = 20
| mois = août
| année = 1996
| pages = 9188-9193
| url texte = http://www.pnas.org/content/93/17/9188
| consulté le = 4 juillet 2013
}} {{DOI|10.1073/pnas.93.17.9188}} {{PMID|8799176}}</ref>{{,}}<ref name="10.1073/pnas.0801980105">
{{Article
| langue = en
| nom1 = James G. Elkins, Mircea Podar, David E. Graham, Kira S. Makarova, Yuri Wolf, Lennart Randau, Brian P. Hedlund, Céline Brochier-Armanet, Victor Kunin, Iain Anderson, Alla Lapidus, Eugene Goltsman, Kerrie Barry, Eugene V. Koonin, Phil Hugenholtz, Nikos Kyrpides, Gerhard Wanner, Paul Richardson, Martin Keller et Karl O. Stetter
| titre = A korarchaeal genome reveals insights into the evolution of the Archaea
| périodique = Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
| volume = 105
| numéro = 23
| jour = 10
| mois = juin
| année = 2008
| pages = 8102-8107
| url texte = http://www.pnas.org/content/105/23/8102
| consulté le = 4 juillet 2013
}} {{DOI|10.1073/pnas.0801980105}} {{PMID|18535141}}</ref>. Leur diversité [[Phylogénie|phylogénétique]] semble avoir été sous-tendue par la dispersion géographique et les différences de températures et de salinité des milieux colonisés<ref name="10.1007/s00792-010-0340-5">
{{Article
| langue = en
| nom1 = Thomas A. Auchtung, Galina Shyndriayeva et Colleen M. Cavanaugh
| titre = 16S rRNA phylogenetic analysis and quantification of ''Korarchaeota'' indigenous to the hot springs of Kamchatka, Russia
| périodique = Extremophiles
| volume = 15
| numéro = 1
| jour =
| mois = janvier
| année = 2011
| pages = 105-116
| url texte = http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00792-010-0340-5
| consulté le = 4 juillet 2013
}} {{DOI|10.1007/s00792-010-0340-5}} {{PMID|21153671}}</ref>. Ils ne sont jamais présents en abondance dans les milieux étudiés jusqu'à présent<ref name="10.1007/s00792-010-0340-5"/>{{,}}<ref name="10.1038/ismej.2009.126">
{{Article
| langue = en
| nom1 = Laila Johanne Reigstad, Steffen Leth Jorgensen et Christa Schleper
| titre = Diversity and abundance of ''Korarchaeota'' in terrestrial hot springs of Iceland and Kamchatka
| périodique = The ISME Journal
| volume = 4
| numéro = 3
| jour =
| mois =
| année = 2010
| pages = 346-356
| url texte = http://www.nature.com/ismej/journal/v4/n3/full/ismej2009126a.html
| consulté le = 4 juillet 2013
}} {{DOI|10.1038/ismej.2009.126}} {{PMID|19956276}}</ref>.


[[Fichier:KamchatkaKorHotSprings.jpg|centre|upright=3|vignette|Des ''Korarchaea'' ont été trouvées dans chacune des six [[Source chaude|sources chaudes]] (dans le sens des aiguilles d'une montre en partant d'en haut à gauche : Uzon4, Uzon7, Uzon8, Uzon9, Mut11, Mut13) étudiées dans le [[Kamchatka]]<ref name="10.1007/s00792-010-0340-5"/>.]]
== Liste des genres ==
Selon {{Bioref|NCBI|3 janv. 2011}} :
* genre ''[[Candidatus Korarchaeum]]''


== Notes et références ==
== Notes et références ==
{{Références}}


== Liens externes ==
{{Autres projets
{{Autres projets
|wikispecies=Korarchaeota
|wikispecies=Korarchaeota
}}
}}

{{Références|colonnes=2}}

* {{Tolweb|Korarchaeota }}
* {{Tolweb|Korarchaeota }}
* {{NCBI|51967|''Korarchaeota'' }}
* {{NCBI|51967|''Korarchaeota'' }}

Version du 4 juillet 2013 à 17:56

Korarchaeota
Description de cette image, également commentée ci-après
Korarchaeota
Classification
Domaine Archaea

Embranchement

Korarchaeota
Barns et al. 1996[1]

Synonymes

  • Xenarchaeota
  • Xenarchaea

Classification phylogénétique

Classes de rang inférieur

Les Korarchaeota, ou Xenarcheota, sont un embranchement (phylum) d'archées thermophiles mis en évidence par l'analyse de séquences d'ARNr 16S[3] à partir d'échantillons environnementaux provenant de sources chaudes du parc national de Yellowstone).

Ce organismes se seraient différentiés assez tôt des Crenarchaeota et des Euryarchaeota, comme le suggèrent des études génétiques[4],[5]. Leur diversité phylogénétique semble avoir été sous-tendue par la dispersion géographique et les différences de températures et de salinité des milieux colonisés[6]. Ils ne sont jamais présents en abondance dans les milieux étudiés jusqu'à présent[6],[7].

Des Korarchaea ont été trouvées dans chacune des six sources chaudes (dans le sens des aiguilles d'une montre en partant d'en haut à gauche : Uzon4, Uzon7, Uzon8, Uzon9, Mut11, Mut13) étudiées dans le Kamchatka[6].

Notes et références

Sur les autres projets Wikimedia :

  1. Barns, Susan M., Fundyga, R.E., Jeffries, M.W., and Pace, N.R. "Remarkable archaeal diversity detected in a Yellowstone National Park hot spring environment." Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1994) 91:1609-1613.
  2. (en) Référence NCBI : Candidatus Korarchaeum (taxons inclus)
  3. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC38617/
  4. (en) S. M. Barns, C. F. Delwiche, J. D. Palmer et N. R. Pace, « Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 93, no 17,‎ , p. 9188-9193 (lire en ligne) DOI 10.1073/pnas.93.17.9188 PMID 8799176
  5. (en) James G. Elkins, Mircea Podar, David E. Graham, Kira S. Makarova, Yuri Wolf, Lennart Randau, Brian P. Hedlund, Céline Brochier-Armanet, Victor Kunin, Iain Anderson, Alla Lapidus, Eugene Goltsman, Kerrie Barry, Eugene V. Koonin, Phil Hugenholtz, Nikos Kyrpides, Gerhard Wanner, Paul Richardson, Martin Keller et Karl O. Stetter, « A korarchaeal genome reveals insights into the evolution of the Archaea », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 105, no 23,‎ , p. 8102-8107 (lire en ligne) DOI 10.1073/pnas.0801980105 PMID 18535141
  6. a b et c (en) Thomas A. Auchtung, Galina Shyndriayeva et Colleen M. Cavanaugh, « 16S rRNA phylogenetic analysis and quantification of Korarchaeota indigenous to the hot springs of Kamchatka, Russia », Extremophiles, vol. 15, no 1,‎ , p. 105-116 (lire en ligne) DOI 10.1007/s00792-010-0340-5 PMID 21153671
  7. (en) Laila Johanne Reigstad, Steffen Leth Jorgensen et Christa Schleper, « Diversity and abundance of Korarchaeota in terrestrial hot springs of Iceland and Kamchatka », The ISME Journal, vol. 4, no 3,‎ , p. 346-356 (lire en ligne) DOI 10.1038/ismej.2009.126 PMID 19956276