Utilisateur:Jnjoffin/Brouillon Galerie Api 20E
La galerie API20E est la première galerie miniaturisée d'identification biochimique de bactéries. Elle est apparue dans les années 1970 avec la guerre du Vietnam car les soldats blessés étaient souvent atteints par des Entérobactéries habituellement non pathogènes et qu'il fallait donc identifier.
Elle remplace les galeries traditionnelles en tubes, apportant un nombre plus important de caractères et donc une meilleure identification, une standardisation, une approche différente de la méthode d’identification avec une approche probabiliste.
Composition de la galerie
[modifier | modifier le code]Nom du Micro
Nom du Microtube
Nom du Micro |
caractère
recherché |
substrat(s) présent(s) dans le microtube
Nom du Micro |
révélateurs présents
Nom du Micro |
réactif(s) à rajouter éventuellementNom
du Micro |
aspect caractère +Nom
du Micro |
aspect caractère -Nom
du Micro |
ONPG | β-galactosidase | ONPG, β-thiogalactosidase | ||||
ADH
LDC ODC |
Arginine dihydrolase
Lysine décarboxylase Ornithine décarboxylase |
peptone de levure
Pyridoxal phosphate acide aminé correspondant Rouge de phénol |
Rouge de phénol | - | rouge (orange pour LDC en 24 h) | jaune à orangé (sauf LDC 24 h) |
CIT | Utilisation du citrate comme seule source de carbone | Citrate de sodium
Bleu de Bromothymol (BBT) |
Bleu de Bromothymol (BBT) | - | bleu en surface | vert-jaune |
H2S | Production d'H2S à partir de thiosulfate | peptone
thiosulfate de sodium fer III |
fer III | - | précipité noir | pas de précipité noir |
URÉ | Uréase | Urée
Rouge de phénol |
Rouge de phénol | - | rouge | jaune |
TDA | Tryptophane désaminase | Tryptophane | chlorure de fer III | marron | jaune | |
IND | Production d'indole | Tryptophane | James ou Kovacs | rouge | jaune | |
VP | Production de butan-dione, 3-hydroxybutanone ou 2,3-dihydroxybutane | peptone
pyruvate |
napht-1-ol
KOH |
napht-1-ol
KOH |
rose | incolore |
GÉL | Gélatinase | gélatine agglomérée avec du carbone | carbone | noir | pas de diffusion du carbone noir | |
GLUGLU
MANGLU INOGLU SORGLU RHAGLU SACGLU MÉL AMY ARA |
Utilisation des glucides ou dérivés correspondants
(glucose, mannitol, inositol, sorbitol, rhamnose, saccharose, méibiose, amygdaline, arabinose) |
peptone
glucide correspondant Bleu de Bromothymol (BBT) Dans le tube Glucose sont ajoutés des nitrates) |
Bleu de Bromothymol (BBT) | - | jaune | bleu |
NO2
N2 |
Réduction des nitrates dans la cupule GLU | utilisation du tube Glu | - | α-naphtylamine et
|
rouge
incolore après addition de Zinc |
jaune
rouge après addition de Zinc |
tests complémentaires | |
OX | test oxydase |
Mob | mobilité |
McC | culture sur Mac Conkey |
OF.O | oxydation aérobie du glucose |
OF.F | fermentation anaérobie du glucose |
Utilisation de la galerie
[modifier | modifier le code]Ensemencement de la galerie
[modifier | modifier le code]L'aspect de la galerie après ensemencement est le suivant :
Remarquer les couleurs liées aux indicateurs de pH.
Lecture après incubation
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Problèmes et explications de lecture
[modifier | modifier le code]Décarboxylases et Dihydrolase
[modifier | modifier le code]La photographie montre clairement que si le tube est entièrement rempli il est rouge (alcalin). Il en est de même en absence de vaseline.
En effet, l'acidité initiale (contrairement au milieu classique) disparait par le départ du dioxyde de carbone volatil et qui n'est donc plus confiné dans le tube par la vaseline. |
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Gaz et glucides ou dérivés
[modifier | modifier le code]Les tubes de glucides ou dérivés peuvent présenter des bulles de gaz. Il faut veiller à ce qu'elles ne soient pas présentes avant l'ensemencement.
Ces gaz ne sont pas présents si le glucide ou dérivé n'est pas fermenté. Ils ne sont pas présents dans le tube GLU car les nitrates inhibent l'hydrogène lyase, enzyme qui produit dihydrogène et dioxyde de carbone. |
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Nitrates
[modifier | modifier le code]Citrate
[modifier | modifier le code]Le tube Citrate contient du "Citrate de Simmons", le citrate étant la seule source de carbone, sous forme liquide.
L’utilisation du citrate en aérobiose provoque une alcalinisation qui ne peut être visible en anaérobiose (dans le tube) car le dioxyde de carbone produit est piégé et l'indicateur de pH ne vire pas. Il faut donc conclure positivement si la cupule est bleue, même si le tube est vert. |
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Articles connexes
[modifier | modifier le code]Voir aussi
[modifier | modifier le code]Liens externes
[modifier | modifier le code]- Site de la société Biomérieux [archive]
- Identification d'entérobactéries avec une galerie API [archive] lien mort
- Histoire d'API, article de l'Opéron 82 [archive]
- Pour identifier un taxon utiliser l'outil UPBM [archive]
- [1] Dictionnaire de biologie technique
- LEYRAL Guy et JOFFIN Jean-Noël, Microbiologie technique - Dictionnaire des techniques, Bordeaux, CANOPE CRDP Aquitaine, , 368 p. (ISBN 9782866175153)