Splicéosome
Le splicéosome, aussi appelé particule d'épissage (en anglais, splicing) ou épissosome, est un complexe dynamique de particules ribonucléoprotéiques (composées d'ARNr et de plus de 200 protéines) et localisé dans le noyau des cellules.
L'assemblage de la particule d'épissage à partir de ses sous-unités ribonucléoprotéiques nécessite de l'ATP.
Son rôle est d'assurer l'excision des introns, des régions non codantes de l'ARN prémessagers et la suture des exons, qui correspondent aux parties codantes[1],[2], mais également la détection des sites introniques d'épissage. C'est une étape essentielle du processus de maturation des ARN messagers, un mécanisme conservé chez tous les organismes eucaryotes. La catalyse de l'épissage par le splicéosome est essentiellement assurée par la partie ribonucléique (les ARNs).
La structure du splicéosome est remarquablement conservée chez les eucaryotes, de la levure à l'humain.
Rôle
Très souvent chez les eucaryotes, on trouve au milieu des chaines codantes d'ARN (les exons), des portions non codantes, les introns, qui ne contiennent aucune information permettant la traduction de la protéine. Ces introns doivent être enlevés de l'ARN prémessager et les exons doivent ensuite être suturés, un processus qu'on appelle l'épissage. L'ARN prémessager contient des signaux spécifiques dans sa séquence qui permettent de réaliser ce processus : à l'intérieur de l'intron doivent figurer un site d'épissage en 3', un site d'épissage en 5' et un point de branchement. Le site d'épissage 5' ou site donneur comprend très souvent une séquence GU à l'extrémité 5' de l'intron. Le site d'épissage en 3' ou site accepteur d'épissage se termine presque toujours avec une séquence AG. En amont de l'extrémité AG se trouve une région riche en pyrimidines (C et U), le tractus polypyrimidine. En amont du tractus polypyrimidine est situé le point de branchement, qui comprend une adénine.
La fonction précise du complexe macromoléculaire qu'est le splicéosome est de catalyser l'excision des introns des ARN prémessagers et la suture des exons, une étape appelée processus d'épissage. Son rôle est de s'associer à l'ARN prémessager et de procéder à l'épissage des introns, par deux réactions de trans-estérification, d'en assurer la maturation, avant son exportation dans le cytoplasme, pour être traduit en protéines. Les différentes particules du splicéosome sont aussi appelées snRNP, pour small nuclear RiboNucleoProteins.
Composition
Le splicéosome est en général composé de cinq particules ribonucléoprotéiques, appelées snRNP[3],elles s'assemblent sur l'intron suivant un mécanisme précis et catalysent les différentes étapes de la réaction d'épissage[4].
Il existe deux types de splicéosome : le splicéosome majeur, qui mature la majorité des ARNm et le spliceosome mineur.
Le splicéosome majeur
Les snARN (small nuclear RNA) de 5 types (U1,2,4,5,6) , des ARN de moins de 200 paires de bases, ont pour rôle la reconnaissance des séquences à épisser.
Ils s'associent chacun à 7 protéines SM, très abondantes dans le noyau cellulaire (SmB/B', D1, D2, E, F, G) dites "protéines de cœur", s'associant en anneau heptamèrique autour des snARN
Cette association donne des ribonucléoprotéines (snRNP) , dont il existe 5 types : snRNP U1, U2, la di-snRNP U4/U6 et la snRNP U5.
Les snRNP s'associent également à plus de 150 protéines (nombre qui varie selon les espèces)
Il existe également des protéines dites « spécifiques » retrouvées uniquement sur un type de snRNP (comme U1A, 70K et U1C, spécifiques de la snRNP U1).
Mécanisme
Le splicéosome s'assemble sur les séquences introniques des ARN prémessagers de manière séquentielle :
- Complexe E d'engagement: L'ARNsn U1 s'associe au site Guanosyl-Uridyl à l'extrémité 5' (5'GU) de l'intron ;
- Complexe A : L'ARNsn U2 se fixe sur le point de branchement situé à une distance de 20-40 nucléotides de la paire AG qui forme l'extrémité 3' de l'intron ;
- Complexe B1 : Les ARNsn U4 et U6 s'associent par un long appariement puis l'ARNsn U5 se lie aux deux précédents créant le complexeU4/U5/U6. De plus U6 se fixe sur U2 tandis que U5 va se fixer sur l'extrémité 3' de l'exon à proximité de U1 (le splicéosome est alors au complet), rapprochant les extrémités de l'intron à exciser ;
- Complexe B2 : U1 est libéré, U5 glisse sur l'intron et U6 se fixe à l'extrémité 5' du site de clivage ;
- Complexe C1 : U4 est libéré, U6 et U2 catalysent la réaction de transestérification et l'extrémité 5' de l'intron est coupée. Se f rme une structure en boucle appelée lasso ;
- Complexe C2 : l'extrémité 3' de l'intron est coupée, ce qui libère l'intron. Ensuite, les exons sont liés entre eux par la réaction de transestérification. Enfin, le complexe se dissocie.
- Le splicéosome mineur agit sur le même principe mais les introns qu'il peut exciser sont beaucoup plus rares et diffèrent également dans les sites d'épissage. Il diffère aussi dans les séquences reconnues, qui dans son cas sont respectivement AC en 5' et UA en 3'. En outre, seule la snRNP U5 est la même pour les deux réactions, les autres sont appelées analogues fonctionnels U11 (dont la fonction est analogique à U1), U12 (U2), U4atac (U4) et U6atac (U6).
Notes et références
- Benjamin Lewin, Gènes VI, Paris, De Boeck, (ISBN 2-7445-0024-0)
- Xavier Coumoul, Frédéric Dardel et Étienne Blanc, Mémo visuel de biochimie, Paris, Dunod, (ISBN 978-2-10-074226-4), p. 142-143
- Zoi Lygerou, Stefanie Kandels-Lewis et Betrand Séraphin, « Le rôle des snRNP dans l'épissage des ARN prémessagers », Médecine/Sciences, vol. 9, , p. 165-170 (ISSN 0767-0974, lire en ligne)
- (en) Cindy L. Will et Reinhard Lührmann, « Spliceosome Structure and Function », Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, vol. 3, , a003707 (ISSN 1943-0264, PMID 21441581, PMCID 3119917, DOI 10.1101/cshperspect.a003707, lire en ligne, consulté le )
