Séquence répétée

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Dans les séquences d'ADN, on distingue principalement deux types de séquences répétées :

• des séquences localisées répétées en tandem :

• séquences microsatellites : des séquences de 2 à 10 pb sont répétées un grand nombre de fois
• séquences minisatellites : des séquences de 10 à 100 pb sont répétées un grand nombre de fois
• grands blocs d'ADN satellite (environ 10 % du génome humain) : blocs allant jusqu'à une dizaine de mégabases, localisés très majoritairement au niveau des centromères et télomères

• des séquences répétées dispersées (chez les vertébrés), séquences apparentées, réparties sur l'ensemble du génome :

• séquences SINE (Short INterspersed Elements) : leur taille varie entre 130 et 500 pb, les plus abondantes chez l'homme sont les séquences ALU
• séquences LINE (Long INterspersed Elements) : leur taille est de quelques kilobases ou plus précisément 6000 à 7000 pb.
• séquences LTR (Long Terminal Repeat) : généralement des éléments de relativement petite taille, présents en très grand nombre (~ 400 000 copies).
• transposons d'ADN : ils représentent environ 300 000 copies et sont issus de la transposition de certains gènes d'une partie d'un chromosome, voire d'un chromosome complètement différent, vers une autre partie du génome.