Séquence répétée

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Dans les séquences d'ADN, on distingue principalement deux types de séquences répétées :

• Séquences localisées répétées en tandem :
  • Séquences microsatellites : des séquences de 1 à 5 pb sont répétées un grand nombre de fois, répétitions longues de plusieurs Kb, il y a plus de 10 000 zones de répétition dans le génome
  • Séquences minisatellites : des séquences de 15 à 25 pb sont répétées un grand nombre de fois, répétions inférieures à 150 pb
  • Grands blocs d'ADN satellite (environ 10 % du génome humain) : blocs allant jusqu'à une dizaine de mégabases, localisés très majoritairement au niveau des centromères et télomères

Il y a des possibilités d'erreurs lors de l'ajout des séquences monotones.

• Séquences répétées dispersées (chez les vertébrés), séquences apparentées, réparties sur l'ensemble du génome :
  • Petits éléments nucléaires intercalés (SINE) : leur taille varie entre 130 et 500 pb, les plus abondantes chez l'homme sont les séquences ALU
  • Longs éléments nucléaires intercalés (LINE) : leur taille est de quelques kilobases ou plus précisément 6 000 à 7 000 pb.
  • Séquences terminales longues répétées (LTR) : généralement des éléments de relativement petite taille, présents en très grand nombre (~ 400 000 copies).
  • transposons d'ADN : ils représentent environ 300 000 copies et sont issus de la transposition de certains gènes d'une partie d'un chromosome, voire d'un chromosome complètement différent, vers une autre partie du génome.
  • rétrotransposons : crées par l'intégration de rétrovirus non codant pour la plupart dispersés physiologiquement dans la totalité du génome