Alice Barkan

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Alice Barkan
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Alice Barkan est une biologiste moléculaire américaine, professeure de biologie à l'université de l'Oregon. Elle est connue pour ses travaux sur la régulation des gènes du chloroplaste et la synthèse des protéines.

Enfance et formation[modifier | modifier le code]

Alice Barkan reçoit son B.S. du Massachusetts Institute of Technology.

En 1983, elle obtient son doctorat à l'université du Wisconsin sous la direction de Janet E. Mertz, avec la thèse Characterization of Simian Virus 40 Late Leader Region Mutants[1],[2],[3].

Carrière et récompenses[modifier | modifier le code]

Alice Barkan rejoint l'université de l'Oregon en 1991, où elle est actuellement professeure à l'Institut de biologie moléculaire[4].

Elle est nommée membre de l'Association américaine pour l'avancement des sciences en 2017[5] et de l'Académie nationale des sciences en 2020[6].

L'université de l'Oregon (UO) lui décerne un prix pour sa carrière exceptionnelle en 2020 afin de reconnaître non seulement ses réalisations scientifiques, mais aussi ses contributions à l'enseignement, au mentorat et au leadership à l'UO[7].

Recherche[modifier | modifier le code]

Les recherches d'Alice Barkan se concentrent sur la manière dont les protéines codées par le noyau affectent l'expression des gènes du chloroplaste[8],[9],[10]. Les expériences de son laboratoire utilisent des mutants, principalement chez le maïs (zea mays) mais aussi chez arabidopsis thaliana, pour étudier la traduction et la stabilité de l'ARNm du chloroplaste, ainsi que de nombreux aspects de la maturation de l'ARN, notamment l'épissage et l'édition[11],[12],[13]. Barkan et ses collègues ont découvert et étudié des dizaines de gènes nucléaires de plantes qui codent pour des protéines de liaison à l'ARN chloroplastique qui affectent directement de multiples aspects du métabolisme de l'ARN (traitement, épissage, traduction, stabilité)[14]. La majorité des protéines codées par le noyau que Barkan a caractérisées contiennent des répétitions pentatricopeptidiques (PPR)[8]. Barkan a également découvert et nommé le domaine CRM (épissage de l'ARN chloroplastique et maturation des ribosomes), qui se trouve dans les protéines codées par le noyau nécessaires à l'épissage de l'ARN chloroplastique[15],[16]. En 2019, Barkan et ses collègues ont réussi à construire des protéines PPR qui se lient à des séquences d'ARN spécifiques in vivo, établissant ainsi un système pour créer des interactions protéine-ARN ciblées[17],[18].

Vie personnelle[modifier | modifier le code]

Alice Barkan est un membre fondateur du groupe musical Byrdsong Renaissance Consort, avec lequel elle joue de la viole et de la flûte à bec[19].

Notes et références[modifier | modifier le code]

(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Alice Barkan » (voir la liste des auteurs).
  1. ↑ (en) « Alice Barkan », University of Oregon - Institute of Molecular Biology (consulté le )
  2. ↑ (en) Alice Barkan Dissertation, University of Wisconsin Libraries, (lire en ligne)
  3. ↑ (en) « Janet Mertz's curriculum vitae, 1984 », CSHL Archives Repository, (consulté le )
  4. ↑ (en) « Alice Barkan », sur molbio.uoregon.edu (consulté le )
  5. ↑ (en) « Six UO faculty members are named as fellows in the AAAS », University of Oregon, (consulté le )
  6. ↑ (en) « 2020 NAS Election », sur www.nasonline.org (consulté le )
  7. ↑ (en) « Five faculty members receive Outstanding Research Awards », sur Around the O, University of Oregon, (consulté le )
  8. ↑ a et b (en) Alice Barkan et Ian Small, « Pentatricopeptide Repeat Proteins in Plants », Annual Review of Plant Biology, vol. 65, no 1,‎ , p. 415–442 (ISSN 1543-5008, PMID 24471833, DOI 10.1146/annurev-arplant-050213-040159, lire en ligne)
  9. ↑ (en) Kenneth P. Watkins, Rosalind Williams‐Carrier, Prakitchai Chotewutmontri, Giulia Friso, Marlene Teubner, Susan Belcher, Hannes Ruwe, Christian Schmitz‐Linneweber, Klaas J. van Wijk et Alice Barkan, « Exploring the proteome associated with the mRNA encoding the D1 reaction center protein of Photosystem II in plant chloropnoms », The Plant Journal, vol. 102, no 2,‎ , p. 369–382 (ISSN 1365-313X, PMID 31793101, DOI 10.1111/tpj.14629 Accès libre)
  10. ↑ (en) Prakitchai Chotewutmontri (dir.) et Alice Barkan, « Dynamics of Chloropnom Translation during Chloropnom Differentiation in Maize », PLOS Genetics, vol. 12, no 7,‎ , e1006106 (ISSN 1553-7404, PMID 27414025, PMCID 4945096, DOI 10.1371/journal.pgen.1006106)
  11. ↑ (en) A. Barkan, « Proteins encoded by a complex chloropnom transcription unit are each translated from both monocistronic and polycistronic mRNAs. », The EMBO Journal, vol. 7, no 9,‎ , p. 2637–2644 (ISSN 0261-4189, PMID 2460341, PMCID 457051, DOI 10.1002/j.1460-2075.1988.tb03116.x)
  12. ↑ (en) A. Barkan, « Nuclear Mutants of Maize with Defects in Chloropnom Polysome Assembly Have Altered Chloropnom RNA Metabolism. », The Plant Cell, vol. 5, no 4,‎ , p. 389–402 (ISSN 1040-4651, PMID 12271069, PMCID 160279, DOI 10.1105/tpc.5.4.389, lire en ligne)
  13. ↑ (en) B. D. Jenkins, D. J. Kulhanek et A. Barkan, « Nuclear mutations that block group II RNA splicing in maize chloropnoms reveal several intron classes with distinct requirements for splicing factors. », The Plant Cell, vol. 9, no 3,‎ , p. 283–296 (ISSN 1040-4651, PMID 9090875, PMCID 156918, DOI 10.1105/tpc.9.3.283, lire en ligne)
  14. ↑ (en) Alice Barkan et Michel Goldschmidt-Clermont, « Participation of nuclear genes in chloropnom gene expression », Biochimie, vol. 82, no 6,‎ , p. 559–572 (ISSN 0300-9084, PMID 10946107, DOI 10.1016/S0300-9084(00)00602-7, lire en ligne)
  15. ↑ (en) G. J. Ostheimer, « Group II intron splicing factors derived by diversification of an ancient RNA-binding domain », The EMBO Journal, vol. 22, no 15,‎ , p. 3919–3929 (ISSN 1460-2075, PMID 12881426, PMCID 169045, DOI 10.1093/emboj/cdg372)
  16. ↑ (en) Andéol Falcon de Longevialle, Ian D. Small et Claire Lurin, « Nuclearly Encoded Splicing Factors Implicated in RNA Splicing in Higher Plant Organelles », Molecular Plant, vol. 3, no 4,‎ , p. 691–705 (PMID 20603383, DOI 10.1093/mp/ssq025 Accès libre, lire en ligne)
  17. ↑ (en) James J. McDermott, Kenneth P. Watkins, Rosalind Williams-Carrier et Alice Barkan, « Ribonucleoprotein Capture by in Vivo Expression of a Designer Pentatricopeptide Repeat Protein in Arabidopsis », The Plant Cell, vol. 31, no 8,‎ , p. 1723–1733 (ISSN 1040-4651, PMID 31123048, PMCID 6713294, DOI 10.1105/tpc.19.00177, lire en ligne)
  18. ↑ (en) Margarita Rojas, Qiguo Yu, Rosalind Williams-Carrier, Pal Maliga et Alice Barkan, « Engineered PPR proteins as inducible switches to activate the expression of chloropnom transgenes », Nature Plants, vol. 5, no 5,‎ , p. 505–511 (ISSN 2055-0278, PMID 31036912, DOI 10.1038/s41477-019-0412-1, S2CID 139103684, lire en ligne)
  19. ↑ (en) « Byrdsong Renaissance Consort », sur byrdsongconsort.com (consulté le )

Liens externes[modifier | modifier le code]

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