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La saison 1999-2000 du Championnat de Hong Kong de football est la cinquante-cinquième édition de la première division à Hong Kong, la First Division League. Elle regroupe, sous forme d'une poule unique, les huit meilleures équipes du pays qui se rencontrent deux fois, à domicile et à l'extérieur. Le vainqueur de cette première phase obtient sa qualification pour la finale nationale. Une deuxième phase voit les quatre premiers s'affronter à nouveau pour déterminer le deuxième club qualifié pour la finale tandis que les quatre derniers se rencontrent pour éviter la relégation.
C'est le club de South China AA qui remporte le championnat cette saison après avoir terminé en tête de la deuxième phase puis battu le tenant du titre, Happy Valley AA lors de la finale nationale. C'est le vingt-septième titre de champion de Hong Kong de l'histoire du club.