Taq polymérase

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Taq polymérase

Description de cette image, également commentée ci-après

Structure d'une Taq polymérase liée à de l'ADN au niveau de son site actif[1]

N° EC EC 2.7.7.7
N° CAS 9012-90-2
Données
IntEnz Vue IntEnz
BRENDA Entrée BRENDA
IUBMB 2.7.7.7 à l'IUBMB
KEGG Entrée KEGG
MetaCyc Voie métabolique
PRIAM Profil
PDB Structures
GO AmiGO / EGO

La Taq polymérase (aussi appelée « Taq pol » ou simplement « Taq ») est une variété d'ADN polymérase thermostable nommée d'après Thermus aquaticus, une bactérie thermophile à partir de laquelle cette enzyme a été isolée pour la première fois en 1969[2],[3].

Sa demi-vie enzymatique à 95 °C est de 40 minutes.

Elle est dépourvue d'activité exonucléasique, ce qui rend donc impossible la correction d'erreur lors de la copie.

Certains mauvais résultats de la PCR (faux négatifs[4]) sur certains échantillons d'ADN (notamment provenant de l'urine ou de crachats), pourraient être dus à un inhibiteur de cette enzyme présent dans l'urine, mais non dans le sang.

Utilisations[modifier | modifier le code]

Cette enzyme est utilisée en biochimie pour faire des réactions de PCR.

Comme elle fait une erreur pour chaque million de paires de base, l'amplicon (le produit de la réaction) sera utilisé pour analyse.

Si l'on veut « cloner » le produit de réaction, alors on utilisera plutôt une ADN polymérase Pwo (en) ou une ADN polymérase Pfu, qui font moins d'erreurs.

Clonage A-T[modifier | modifier le code]

La taq-polymérase ajoute un « A» à la fin du fragment généré.

Ceci permet de réaliser un clonage par bouts cohésifs avec un vecteur possédant un « T» .

« Hot Start »[modifier | modifier le code]

« Hot Start » désigne une enzyme ayant un inhibiteur (protéine chaperonne ou molécule chimique).

Cet inhibiteur doit être enlevé par le biais d'un chauffage de l'enzyme à 95 °C pendant 10 ou 15 minutes. Cette opération est dite « activation de l'enzyme ».

Voir aussi[modifier | modifier le code]

Articles connexes[modifier | modifier le code]

Liens externes[modifier | modifier le code]

  • (fr)

Notes et références[modifier | modifier le code]

  1. (en) Soo Hyun Eom, Jimin Wang et Thomas A. Steitz, « Structure of Taq polymerase with DNA at the polymerase active site », Nature, vol. 382, no 6588,‎ , p. 278-281 (PMID 8717047, DOI 10.1038/382278a0, lire en ligne)
  2. (en) A. Chien, D. B. Edgar et J. M. Trela, « Deoxyribonucleic acid polymerase from the extreme thermophile Thermus aquaticus », Journal of Bacteriology, vol. 127, no 3,‎ , p. 1550-1557 (PMID 8432, PMCID 232952, lire en ligne)
  3. Dieter Perl, Uwe Mueller, Udo Heinemann et Franz X. Schmid, 2000, « Two exposed amino acid residues confer thermostability on a cold shock protein », Nature structural biology, volume 7, numéro 5, pages 380 à 383.
  4. Initiation à la biologie moléculaire ; Module : Amplification de gène, Fondation Mérieux