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Toutes les espèces du genre ''Oryza'', sauf une, ''Oryza brachyantha'', ont été groupées en quatre [[Complexe d'espèces|complexes d'espèces]]. La section ''Oryza sativa'' se subdivise en deux complexes, le complexe ''Oryza sativa'', qui comprend sept espèces morphologiques partageant toutes le génome diploïde AA, et le complexe ''Oryza officinalis'', qui regroupe des espèces ayant quatre génomes différents, BB, CC, DD et EE, avec à la fois des espèces diploïdes et des espèces tétraploïdes<ref>{{ouvrage|langue=en|titre= Crop Ferality and Volunteerism |auteur= Jonathan Gressel |éditeur =CRC Press |année= 2005 |isbn= 9781420037999 |pages totales= 448 |passage=258-259 }}.</ref>.
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!Complexe d'espèces || Type de<br />génome || Nombre de <br />chromosomes (2n) || Espèces ||Distribution<ref>{{ouvrage|langue=en |titre=Rice Biology in the Genomics Era, ''volume 62 de'' Biotechnology in Agriculture and Forestry |auteurs= Hiro-Yuki Hirano, Atshushi Hirai, Yoshio Sano, Takuji Sasaki | éditeur = Springer Science & Business Media |année= 2008 |isbn= 9783540742500 |pages totales= 381 |passage= 239-240}}.</ref> || Caractères utiles<ref>{{chapitre |langue=en |url= http://www.springer.com/cda/content/document/cda_downloaddocument/9781461479024-c1.pdf?SGWID%3D0-0-45-1444425-p175172215 | titre= ''The Wild Relative of Rice: Genomes and Genomics'' |auteurs =Paul L. Sanchez, Rod A. Wing, et Darshan S. Brar |titre ouvrage= Genetics and Genomics of Rice, ''volume 5 de'' Plant Genetics and Genomics: Crops and Models |auteurs ouvrage= Qifa Zhang, Rod A. Wing |éditeur =Springer Science & Business Media |année= 2013 |isbn= 9781461479031 |pages totales= 402|passage= 9-24}}.</ref>
!Complexe d'espèces || Type de génome || Espèces
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| rowspan= 8| Complexe ''Oryza sativa'' ||AA || 24 || ''[[Oryza sativa]]''|| cosmopolite ||cultigène, rendement élevé
| ''Oryza sativa'' ||AA || ''[[Oryza sativa]]'', ''[[Oryza glaberrima]]'', ''[[Oryza barthii]]'', ''[[Oryza glumaepatula]]'', ''[[Oryza longistaminata]]'', ''[[Oryza meridionalis]]'', ''[[Oryza nivara]]'', ''[[Oryza rufipogon]]''
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| AA || 24 || ''[[Oryza glaberrima]]'' || Afrique occidentale || cultigène ; tolérance à la sécheresse, à l'acidité du sol, à la toxicité ferreuse, à la carence en phosphore ; résistance à la nielle bactérienne ([[Xanthomonas oryzae pv oryzae|''Xanthomonas oryzae'' pv ''oryzae'']]), à la [[pyriculariose]] (''Magnaporthe grisea''), au virus de la marbrure jaune du riz (RYMV), à la cécidomyie du riz (''[[Orseolia oryzivora]]''), aux nématodes ; compétitivité vis-à-vis des adventices
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| CC || ''[[Oryza officinalis]]'', ''[[Oryza rhizomatis]]''
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| AA || 24 || ''[[Oryza glumaepatula]]'' || Amérique centrale et Amérique du Sud || aptitude à l'élongation ; source de [[Stérilité mâle|stérilité mâle cytoplasmique]] (CMS) ; tolérance à la chaleur
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| AA || 24 || ''[[Oryza longistaminata]]'' || Afrique ||résistance à la nielle bactérienne, aux nématodes, aux foreurs des tiges ; évitement de la sécheresse
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| AA || 24 || ''[[Oryza rufipogon]]'' || Asie tropicale et subtropicale, Australie tropicale || résistance à la nielle bactérienne, à la pyriculariose, à la cicadelle brune, au virus du tungro ; tolérance modérée à la pourriture de la gaine (''[[Thanatephorus cucumeris]]'', anamorphe : ''Rhizoctonia solani'') ; tolérance à l'aluminium et à l'acidité du sol ; élongation accrue sous hautes eaux ; loci d'augmentation du rendement
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| BBCC || 48 || ''[[Oryza eichingeri]]'' || Afrique orientale, Sri Lanka || résistance à la cicadelle brune (''[[Nilaparvata lugens]]''), à la cicadelle à dos blanc (''[[Sogatella furcifera]]''), à la cicadelle verte
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| CCDD || 48 || ''[[Oryza alta]]'' || Amérique centrale et Amérique du Sud || résistance à la pyrale rayée du riz (''[[Chilo suppressalis]]'') ; production élevée de [[biomasse
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| CCDD || 48 || ''[[Oryza grandiglumis]]'' ||Amérique du Sud || production de biomasse élevée
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| rowspan= 3| Complexe ''Oryza ridleyi'' || HHJJ || 48 || ''[[Oryza longiglumis]]'' || Iran Jaya, Indonésie, Papouasie Nouvelle-Guinée || résistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne
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| HHKK || 48 ||''[[Oryza schlechteri]]'' || Papouasie Nouvelle-Guinée ||stolonifère
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| colspan="6" style="text-align: center;" | Section ''Granulata''
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| GG || 24 || ''[[Oryza meyeriana]]'' || Asie du Sud-Est || tolérance à l'ombre ; adaptation aux sols aérobies
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| colspan="6" style="text-align: center;" | Section ''Brachyantha''
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| || FF || 24 || ''[[Oryza brachyantha]]'' || Afrique || tolérance à l'ombre ; stolonifère
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Version du 26 avril 2017 à 21:32

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Oryza
Description de cette image, également commentée ci-après
Oryza sativa (riz cultivé)
Classification APG III (2009)
Règne Plantae
Clade Angiospermes
Clade Monocotylédones
Clade Commelinidées
Ordre Poales
Famille Poaceae

Genre

Oryza
L., 1753[1]

Classification phylogénétique

Ordre Poales
Famille Poaceae
Sous-famille Oryzoideae
Tribu Oryzeae
Sous-tribu Oryzinae
Genre Oryza

Oryza est un genre de plantes monocotylédones de la famille des Poaceae, sous-famille des Oryzoideae[2],[3]. Ce genre comprend une vingtaine d'espèces acceptées, dont les deux espèces de riz cultivé, Oryza sativa et Oryza glaberrima, qui figurent parmi les principales plantes alimentaires.

Les espèces du genre Oryza sont des graminées poussant dans les zones humides, qui peuvent atteindre 1 à 2 mètres de haut. Le genre comprend des espèces annuelles et vivaces[4].

Plusieurs espèces de riz sauvage (non cultivées), notamment Oryza perennis, Oryza nivara, Oryza rufipogon, Oryza latifolia, Oryza punctata, très proches biologiquement des riz cultivés, se comportent parfois dans les rizières comme des mauvaises herbes difficiles à extirper et sont considérées comme nuisibles[5].

Taxinomie

Synonymes

Selon GRIN (5 mars 2015)[6] :

  • Padia Moritzi ;
  • Porteresia Tateoka.

Liste d'espèces

Plus de 300 noms ont été proposés comme espèces, sous-espèces et autres taxons infraspécifiques au sein du genre Oryza. Le nombre d'espèces distinctes acceptées varie selon les auteurs. Selon Kew World Checklist, seules les 19 espèces listées ci-dessous doivent être retenues comme distinctes[7].

Selon World Checklist of Selected Plant Families (WCSP) (22 avril 2017)[8] :

Génome

On a déterminé chez les espèces du genre Oryza dix types de génomes, dont six génomes diploïdes (AA, BB, CC, EE, FF et GG) et quatre génomes allotétraploïdes (BBCC, CCDD, HHKK et HHJJ)[9]. La répartition des espèces entre ces différents types de génomes est présentée ci-après[10]. Toutes les espèces du genre Oryza, sauf une, Oryza brachyantha, ont été groupées en quatre complexes d'espèces. La section Oryza sativa se subdivise en deux complexes, le complexe Oryza sativa, qui comprend sept espèces morphologiques partageant toutes le génome diploïde AA, et le complexe Oryza officinalis, qui regroupe des espèces ayant quatre génomes différents, BB, CC, DD et EE, avec à la fois des espèces diploïdes et des espèces tétraploïdes[11].

Complexe d'espèces Type de
génome		 Nombre de
chromosomes (2n)		 Espèces Distribution[12] Caractères utiles[13]
Section Sativa
Complexe Oryza sativa AA  24 Oryza sativa cosmopolite cultigène, rendement élevé
AA  24 Oryza glaberrima Afrique occidentale cultigène ; tolérance à la sécheresse, à l'acidité du sol, à la toxicité ferreuse, à la carence en phosphore ; résistance à la nielle bactérienne (Xanthomonas oryzae pv oryzae), à la pyriculariose (Magnaporthe grisea), au virus de la marbrure jaune du riz (RYMV), à la cécidomyie du riz (Orseolia oryzivora), aux nématodes ; compétitivité vis-à-vis des adventices
AA  24 Oryza barthii (Oryza breviligulata) Afrique résistance à la cicadelle verte, à la nielle bactérienne ; évitement de la sécheresse ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
AA  24 Oryza glumaepatula Amérique centrale et Amérique du Sud aptitude à l'élongation ; source de stérilité mâle cytoplasmique (CMS) ; tolérance à la chaleur
AA  24 Oryza longistaminata Afrique résistance à la nielle bactérienne, aux nématodes, aux foreurs des tiges ; évitement de la sécheresse
AA  24 Oryza meridionalis Australie aptitude à l'élongation ; évitement de la sécheresse ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
AA  24 Oryza nivara Asie tropicale et subtropicale résistance au virus du rabougrissement herbacé du riz (RGSV), à la nielle bactérienne
AA  24 Oryza rufipogon Asie tropicale et subtropicale, Australie tropicale résistance à la nielle bactérienne, à la pyriculariose, à la cicadelle brune, au virus du tungro ; tolérance modérée à la pourriture de la gaine (Thanatephorus cucumeris, anamorphe : Rhizoctonia solani) ; tolérance à l'aluminium et à l'acidité du sol ; élongation accrue sous hautes eaux ; loci d'augmentation du rendement
Complexe Oryza officinalis BB, BBCC  24, 48 Oryza punctata Afrique résistance à la cicadelle brune à la nielle bactérienne, à la cicadelle zigzag (Recilia dorsalis) ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
CC  24 Oryza officinalis Asie tropicale et subtropicale, Australie tropicale résistance au thrips, à la cicadelle brune, à la cicadelle verte, à la pourriture des tiges (Magnaporthe salvinii) ; tolérance à la chaleur
CC  24 Oryza rhizomatis Sri Lanka évitement de la sécheresse; résistance à la pyriculariose ; tolérance à la chaleur
BBCC  48 Oryza minuta Philippines, Papouasie Nouvelle-Guinée résistance à la nielle bactérienne, à la pyriculariose, à la cicadelle brune, à la cicadelle verte
BBCC  48 Oryza eichingeri Afrique orientale, Sri Lanka résistance à la cicadelle brune (Nilaparvata lugens), à la cicadelle à dos blanc (Sogatella furcifera), à la cicadelle verte
CCDD  48 Oryza alta Amérique centrale et Amérique du Sud résistance à la pyrale rayée du riz (Chilo suppressalis) ; production élevée de [[biomasse
CCDD  48 Oryza grandiglumis Amérique du Sud production de biomasse élevée
CCDD  48 Oryza latifolia Amérique centrale et Amérique du Sud résistance à la cicadelle brune, à la nielle bactérienne ; production élevée de biomasse
EE  24 Oryza australiensis Australie tropicale résistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne, à la cicadelle brune ; évitement de la sécheresse ; tolérance à la chaleur et à la sécheresse
Section Ridleyanae
Complexe Oryza ridleyi HHJJ  48 Oryza longiglumis Iran Jaya, Indonésie, Papouasie Nouvelle-Guinée résistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne
HHJJ 48 Oryza ridleyi Asie du Sud, Papouasie Nouvelle-Guinée résistance à la pyriculariose, à la nielle bactérienne, au virus du tungro, aux foreurs des tiges et à la mineuse du riz (Hydrellia philippina)
HHKK  48 Oryza schlechteri Papouasie Nouvelle-Guinée stolonifère
Section Granulata
Complexe Oryza granulata GG  24 Oryza granulata Asie du Sud tolérance à l'ombre ; adaptation aux sols aérobies
GG  24 Oryza meyeriana Asie du Sud-Est tolérance à l'ombre ; adaptation aux sols aérobies
Section Brachyantha
FF  24 Oryza brachyantha Afrique tolérance à l'ombre ; stolonifère

Notes et références

  1. ↑ Tropicos.org. Missouri Botanical Garden., consulté le 5 mars 2015
  2. ↑ (en) Robert J. Soreng, Paul M. Peterson, Konstantin Romaschenko, Gerrit Davidse, Fernando O. Zuloaga, Emmet J. Judziewicz, Tarciso S. Filgueiras, Jerrold I. Davis et Osvaldo Morrone, « A worldwide phylogenetic classification of the Poaceae (Gramineae) », Journal of Systematics and Evolution (JSE), vol. 53, no 2,‎ , p. 117–202 (lire en ligne).
  3. ↑ (en) « Oryza L. », Tropicos (consulté le ).
  4. ↑ (en) « 稻属 dao shu Oryza Linnaeus, Sp. Pl. 1: 333. 1753. », sur Flora of China (consulté le ).
  5. ↑ A. Ferrero, « Le riz nuisible, caractères biologiques et contrôle », dans R. Labrada, Gestion des mauvaises herbes pour les pays en développement: Addendum 1, Rome, FAO, (lire en ligne), p. 92-114.
  6. ↑ USDA, Agricultural Research Service, National Plant Germplasm System. Germplasm Resources Information Network (GRIN-Taxonomy). National Germplasm Resources Laboratory, Beltsville, Maryland., consulté le 5 mars 2015
  7. ↑ (en) « Oryza L., Sp. Pl.: 333 (1753). », sur World Checklist of Selected Plant Families (WCSP), Royal Botanic Gardens, Kew (consulté le ).
  8. ↑ WCSP. World Checklist of Selected Plant Families. Facilitated by the Royal Botanic Gardens, Kew. Published on the Internet ; http://wcsp.science.kew.org/, consulté le 22 avril 2017
  9. ↑ (en) Fei Lu et al., « Comparative sequence analysis of MONOCULM1-orthologous regions in 14 Oryza genomes », National Academy of Sciences of the USA, (consulté le ).
  10. ↑ (en) Song Ge, Tao Sang, Bao-Rong Lu et De-Yuan Hong, « Evolution Phylogeny of rice genomes with emphasis on origins of allotetraploid species », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 96, no 25,‎ , p. 14400–14405 (lire en ligne).
  11. ↑ (en) Jonathan Gressel, Crop Ferality and Volunteerism, CRC Press, , 448 p. (ISBN 9781420037999), p. 258-259.
  12. ↑ (en) Hiro-Yuki Hirano, Atshushi Hirai, Yoshio Sano, Takuji Sasaki, Rice Biology in the Genomics Era, volume 62 de Biotechnology in Agriculture and Forestry, Springer Science & Business Media, , 381 p. (ISBN 9783540742500), p. 239-240.
  13. ↑ (en) Paul L. Sanchez, Rod A. Wing, et Darshan S. Brar, « The Wild Relative of Rice: Genomes and Genomics », dans Qifa Zhang, Rod A. Wing, Genetics and Genomics of Rice, volume 5 de Plant Genetics and Genomics: Crops and Models, Springer Science & Business Media, , 402 p. (ISBN 9781461479031, lire en ligne), p. 9-24.

Liens externes

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