Transposase

Une transposase est une nucléotidyltransférase qui catalyse le déplacement d'un élément transposable (transposon) d'un endroit à un autre du génome. Cette enzyme se lie à une extrémité du transposon, clive la liaison entre celui-ci et le reste du génome, et réalise la suture de cet élément transposable à un autre endroit du génome.

Le terme transposase a été introduit en 1979 par la première équipe à avoir cloné l'enzyme nécessaire à la transposition du transposon Tn3 (en)^[2]. Les gènes codant ces endonucléases sont très répandus chez la plupart des êtres vivants et sont les gènes les plus abondants connus^[3].

Les mécanismes de transposition jouent un rôle très important dans l'évolution et la biodiversité, notamment dans l'adaptation des organismes à leur environnement^[4] ; ils ont été mis en évidence à travers la variation de la pigmentation des grains de maïs, mais sont également impliqués dans le développement d'une résistance aux antibiotiques par certaines bactéries, et seraient responsables de la migration de pas moins de 40 % du génome humain au cours de l'évolution d'Homo sapiens^[5].

Notes et références

↑ (en) Scott Lovell, Igor Y. Goryshin, William R. Reznikoff & Ivan Rayment, « Two-metal active site binding of a Tn5 transposase synaptic complex », Nature Structural Biology, vol. 9, n^o 4,‎ avril 2002, p. 278-281 (PMID 11896402, DOI 10.1038/nsb778, lire en ligne)
↑ (en) Fred Heffron, Brian J. McCarthy, Hisako Ohtsubo et Eiichi Ohtsubo, « DNA sequence analysis of the transposon Tn3: Three genes and three sites involved in transposition of Tn3 », Cell, vol. 18, n^o 4,‎ décembre 1979, p. 1153-1163 (PMID 391406, DOI 10.1016/0092-8674(79)90228-9, lire en ligne)
↑ (en) Ramy K. Aziz, Mya Breitbart et Robert A. Edwards, « Transposases are the most abundant, most ubiquitous genes in nature », Nucleic Acids Research, vol. 38, n^o 13,‎ juillet 2010, p. 4207-4217 (PMID 20215432, PMCID 2910039, DOI 10.1093/nar/gkq140)
↑ (en) William S. Reznikoff, « Tn5 as a model for understanding DNA transposition », Molecular Microbiology, vol. 47, n^o 5,‎ mars 2003, p. 1199-1206 (PMID 12603728, DOI 10.1046/j.1365-2958.2003.03382.x, lire en ligne)
↑ (en) « Transposase », sur PDB-101, décembre 2006 (consulté le 1^er mars 2015) DOI 10.2210/rcsb_pdb/mom_2006_12

Articles connexes

ATAC-Seq

[10.1038/nsb778-1] (en) Scott Lovell, Igor Y. Goryshin, William R. Reznikoff & Ivan Rayment, « Two-metal active site binding of a Tn5 transposase synaptic complex », Nature Structural Biology, vol. 9, n^o 4,‎ avril 2002, p. 278-281 (PMID 11896402, DOI 10.1038/nsb778, lire en ligne)

[10.1016/0092-8674(79)90228-9-2] (en) Fred Heffron, Brian J. McCarthy, Hisako Ohtsubo et Eiichi Ohtsubo, « DNA sequence analysis of the transposon Tn3: Three genes and three sites involved in transposition of Tn3 », Cell, vol. 18, n^o 4,‎ décembre 1979, p. 1153-1163 (PMID 391406, DOI 10.1016/0092-8674(79)90228-9, lire en ligne)

[10.1093/nar/gkq140-3] (en) Ramy K. Aziz, Mya Breitbart et Robert A. Edwards, « Transposases are the most abundant, most ubiquitous genes in nature », Nucleic Acids Research, vol. 38, n^o 13,‎ juillet 2010, p. 4207-4217 (PMID 20215432, PMCID 2910039, DOI 10.1093/nar/gkq140)

[10.1046/j.1365-2958.2003.03382.x-4] (en) William S. Reznikoff, « Tn5 as a model for understanding DNA transposition », Molecular Microbiology, vol. 47, n^o 5,‎ mars 2003, p. 1199-1206 (PMID 12603728, DOI 10.1046/j.1365-2958.2003.03382.x, lire en ligne)

[10.2210/rcsb_pdb/mom_2006_12-5] (en) « Transposase », sur PDB-101, décembre 2006 (consulté le 1^er mars 2015) DOI 10.2210/rcsb_pdb/mom_2006_12

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