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Il infecte l'amibe ''[[Vermamoeba vermiformis]]''<ref name="Reteno">{{article|vauthors=Reteno DG, Benamar S, Khalil JB, Andreani J, Armstrong N, Klose T, Rossmann M, Colson P, Raoult D, La Scola B |journal=J Virol |date=July 2015 |volume=89 |numéro=13 |pages=6585–94 |pmid=25878099 |pmc=4468488 |doi=10.1128/JVI.00115-15 |titre=Faustovirus, an asfarvirus-related new lineage of giant viruses infecting amoebae }}</ref> associées aux humains. |
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Le virus a été isolé pour la première fois en [[2015 en science|2015]]<ref name="Reteno" /> et s'est avéré avoir un diamètre d'environ {{nobr|0,2 micromètre}} avec un génome d'ADN double brin de {{nobr|466 kilobases}} censé coder {{nobr|451 protéines}}. Bien que classés comme un virus nucléocytoplasmique à grand ADN (NCLDV), les ''Faustovirus'' partagent moins d'un quart de leurs gènes avec d'autres NCLDV ; cependant, environ 46 % sont homologues à des gènes bactériens et le reste sont des gènes orphelins (ORFans)<ref>{{cite journal |vauthors=Chatterjee A, Sicheritz-Pontén T, Yadav R, Kondabagil K |journal=Scientific Reports |date=March 2019 |volume=9 |issue=1 |pages=3690 |doi=10.1038/s41598-019-40171-y |pmid=30842490 |pmc=6403294 |title=Genomic and metagenomic signatures of giant viruses are ubiquitous in water samples from sewage, inland lake, waste water treatment plant, and municipal water supply in Mumbai, India |bibcode=2019NatSR...9.3690C }}</ref>. Plus précisément, le gène codant la protéine de capside majeure (MCP) des ''Faustovirus'' est différent de celui de son virus géant le plus étroitement apparenté, l'''[[Asfivirus]]'', ainsi que d'autres NCLDV. Dans l'''Asfivirus'', le gène codant la MCP est un fragment génomique unique d'environ {{nb|2000 paires}} de bases (pb)<ref name="RossmannPNAS">{{article|vauthors=Klose T, Reteno DG, Benamar S, Hollerbach A, Colson P, La Scola B, Rossmann MG |journal=Proc Natl Acad Sci U S A |date=31 May 2016 |volume=113 |numéro=22 |pages=6206–11 |doi=10.1073/pnas.1523999113 |titre=Structure of faustovirus, a large dsDNA virus |pmid=27185929 |pmc=4896704 |accès doi=libre }}</ref>, cependant, dans le faustovirus, la MCP est codée par 13 exons séparés par 12 grands introns<ref name="Cherif">{{cite journal |vauthors= Cherif Louazani A, Baptiste E, Levasseur A, Colson P, La Scola B |journal=Frontiers in Microbiology |date=23 October 2018 |volume=9 |pages=2534 |doi=10.3389/fmicb.2018.02534 |pmid=30487777 |pmc=6247863 |title=Faustovirus E12 Transcriptome Analysis Reveals Complex Splicing in Capsid Gene |doi-access=free }}</ref>. Les exons ont une longueur moyenne de {{nobr|149 bp}} et les introns ont une longueur moyenne de {{nb|1273 bp}}<ref name="Cherif" />. La présence d'introns dans les gènes de ''Faustovirus'' est atypique pour un virus<ref name="RossmannPNAS">{{article|vauthors=Klose T, Reteno DG, Benamar S, Hollerbach A, Colson P, La Scola B, Rossmann MG |journal=Proc Natl Acad Sci U S A |date=31 May 2016 |volume=113 |numéro=22 |pages=6206–11 |doi=10.1073/pnas.1523999113 |titre=Structure of faustovirus, a large dsDNA virus |pmid=27185929 |pmc=4896704 |accès doi=libre }}</ref>. |
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== Notes et références == |
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== Références biologiques == |
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Version du 31 décembre 2022 à 00:26
Faustovirus
Restitution d'un Faustovirus par cryomicroscopie électronique.
| Domaine | Varidnaviria |
|---|---|
| Règne | Bamfordvirae |
| Embranchement | Nucleocytoviricota |
| Famille | incertae sedis |
Faustovirus (FSTV) est un genre de virus géant à ADN bicaténaire présentant quelques similarités avec les Asfarviridae ou les Mimiviridae[1]. En 2022, ce virus n'est pas classé par l'ICTV.
Il infecte l'amibe Vermamoeba vermiformis[2] associées aux humains.
Le virus a été isolé pour la première fois en 2015[2] et s'est avéré avoir un diamètre d'environ 0,2 micromètre avec un génome d'ADN double brin de 466 kilobases censé coder 451 protéines. Bien que classés comme un virus nucléocytoplasmique à grand ADN (NCLDV), les Faustovirus partagent moins d'un quart de leurs gènes avec d'autres NCLDV ; cependant, environ 46 % sont homologues à des gènes bactériens et le reste sont des gènes orphelins (ORFans)[3]. Plus précisément, le gène codant la protéine de capside majeure (MCP) des Faustovirus est différent de celui de son virus géant le plus étroitement apparenté, lAsfivirus, ainsi que d'autres NCLDV. Dans lAsfivirus, le gène codant la MCP est un fragment génomique unique d'environ 2 000 paires de bases (pb)[4], cependant, dans le faustovirus, la MCP est codée par 13 exons séparés par 12 grands introns[5]. Les exons ont une longueur moyenne de 149 bp et les introns ont une longueur moyenne de 1 273 bp[5]. La présence d'introns dans les gènes de Faustovirus est atypique pour un virus[4].
Notes et références
- (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Faustovirus » (voir la liste des auteurs).
- https://ictv.global/report/chapter/unclassified/unclassified-viruses
- « Faustovirus, an asfarvirus-related new lineage of giant viruses infecting amoebae », J Virol, vol. 89, no 13, , p. 6585–94 (PMID 25878099, PMCID 4468488, DOI 10.1128/JVI.00115-15)
- « Genomic and metagenomic signatures of giant viruses are ubiquitous in water samples from sewage, inland lake, waste water treatment plant, and municipal water supply in Mumbai, India », Scientific Reports, vol. 9, no 1, , p. 3690 (PMID 30842490, PMCID 6403294, DOI 10.1038/s41598-019-40171-y, Bibcode 2019NatSR...9.3690C)
- « Structure of faustovirus, a large dsDNA virus », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 113, no 22, , p. 6206–11 (PMID 27185929, PMCID 4896704, DOI 10.1073/pnas.1523999113
)
- « Faustovirus E12 Transcriptome Analysis Reveals Complex Splicing in Capsid Gene », Frontiers in Microbiology, vol. 9, , p. 2534 (PMID 30487777, PMCID 6247863, DOI 10.3389/fmicb.2018.02534)
