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Modèle:Infobox scientistMichael Spencer Waterman (né le 28 juin 1942) est un Professeur de Biologie, Mathématiques et Informatique à l' Université de Californie du Sud (USC),[1][2] où il est titulaire d'un Doté d'Associés de la Chaire en Sciences Biologiques, Mathématiques et Sciences Informatiques. Auparavant, il a[Quand ?] occupé des postes au Laboratoire National de Los Alamos et de l'Idaho State University.
Biographie
Il a grandi près de Bandon, Oregon et a obtenu un baccalauréat en Mathématiques de l'Université de l'Oregon, suivie d'un Doctorat en statistique et probabilité de la Michigan State University en 1969.[3]
La recherche et la carrière
Waterman est l'un des fondateurs et des dirigeants actuels dans le domaine de la biologie computationnelle. Il se concentre sur l'application des mathématiques, des statistiques et de l'informatique techniques à différents problèmes de la biologie moléculaire. Son travail a contribué à certains des moyens les plus largement utilisés dans le domaine. En particulier, le Smith-Waterman algorithme (développé avec Temple F. Smith) est la base de nombreux séquence d'alignement des programmes.[4] En 1988, Waterman et Eric Lander publié un document de référence décrivant un modèle mathématique pour les empreintes digitales de la cartographie.[5] Ce travail a constitué l'un des fondements théoriques pour beaucoup de la plus tard de l'ADN de la cartographie et le séquençage des projets, notamment le Projet du Génome Humain. De 1995 de papier par Idury et Waterman a introduit Eulérien-De Bruijn séquence de l'assemblée, qui est largement utilisé dans la prochaine génération de projets de séquençage. [6]
Avec Pavel A. Pevzner, (un ancien chercheur postdoctoral dans le laboratoire), il a commencé la conférence internationale de Recherche en informatique de Biologie Moléculaire (RECOMB),[7] et il est fondateur et rédacteur en chef du Journal de la Biologie Computationnelle. Waterman est également l'auteur d'un des premiers manuels scolaires dans le domaine: Introduction à la Biologie Computationnelle.[8]
Les distinctions et les honneurs
Avec Cyrus Chothia et David Haussler, Waterman a été décerné à l'2015 Prix Dan David pour sa contribution dans le domaine de la bioinformatique. Il a reçu un Doctorat Honorifique de l'Université de Tel Aviv en 2011,[réf. nécessaire] et d'un Doctorat Honorifique de l' Université du Danemark du Sud en 2013.[réf. nécessaire]
Il a été membre de l'US Académie Américaine des Arts et des Sciences depuis 1995,[réf. nécessaire] un membre de l'US National Academy of Engineering depuis 2012,[réf. nécessaire] membre de l' Académie Chinoise des Sciences, depuis 2013,[réf. nécessaire] et un membre de l'US National Academy of Sciences depuis 2001.[réf. nécessaire] Il a été un académicien de l' Académie des Sciences depuis 2005.[réf. nécessaire]
Il a été élu un ISCB Collègues en 2009 par la Société Internationale pour la Biologie Computationnelle et a reçu leur ISCB Senior Scientist Award en 2009.
Vie personnelle
Waterman a écrit ces mémoire, Obtenir à l'Extérieur,[9] sur son enfance passée dans un ranch d'élevage isolé, sur la côte sud de l'Oregon dans le milieu du xxe siècle.
Références
- Anon, « Michael S. Waterman: Professor of Biological Sciences, Mathematics, Computer Science, University of Southern California », sur dornsife.usc.edu/labs/msw,
- M. Maisel, « ISCB Honors Michael S. Waterman and Mathieu Blanchette », PLOS Computational Biology, vol. 2, no 8, , e105 (PMCID 1526462, DOI 10.1371/journal.pcbi.0020105, Bibcode 2006PLSCB...2..105M)
- Michael Smith Waterman, Some Ergodic Properties of Multi-Dimensional F-Expansions (thèse), Michigan State University, (OCLC 25799203, lire en ligne) (inscription nécessaire)
- T. Smith et M. S. Waterman, « Identification of common molecular subsequences », Journal of Molecular Biology, vol. 147, no 1, , p. 195–197 (PMID 7265238, DOI 10.1016/0022-2836(81)90087-5)
- E. S. Lander et M. S. Waterman, « Genomic mapping by fingerprinting random clones: A mathematical analysis », Genomics, vol. 2, no 3, , p. 231–239 (PMID 3294162, DOI 10.1016/0888-7543(88)90007-9)
- Ramana M. Idury et Michael S. Waterman, « A New Algorithm for DNA Sequence Assembly », Journal of Computational Biology, vol. 2, no 2, , p. 291–306 (ISSN 1066-5277, PMID 7497130, DOI 10.1089/cmb.1995.2.291, lire en ligne)
- Anon, « The RECOMB conference series », sur recomb.org,
- Waterman, Michael R. et Waterman, M. S., Introduction to computational biology: maps, sequences and genomes, London, Chapman & Hall, (ISBN 0-412-99391-0)
- Michael Waterman, Getting Outside: A Far-Western Childhood, CreateSpace Independent Publishing Platform, (ISBN 978-1530929344)
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