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Utilisateur:Delphine Dauga/Brouillon

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Introduction[modifier | modifier le code]

L’Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM) est un institut de recherche qui explore le domaine de la Biologie du développement et des pathologies qui y sont associées.

Il est devenu l'un des centres de recherche français les plus reconnus internationalement[1]. C'est une unité mixte de recherche de l'université d’Aix Marseille (AMU) et du CNRS. L'IBDM est le laboratoire UMR 7288 du CNRS.

Présentation générale[modifier | modifier le code]

L’IBDM est une unité mixte de Recherche avec le CNRS située au sein du campus de Luminy[2] et créée de novo en 2006 suite à la fusion de quatre unités existantes. L'IBDM occupe une surface globale de 8250m2, qui se situe dans des locaux appartenant à l’Université, au CNRS et à l’INSERM. En 2014, plus de 220 personnes travaillent au sein de l’institut, dont 78 chercheurs, 140 ingénieurs et techniciens et 21 post-doctorants organisés en 18 équipes de recherche et 4 plateaux techniques.

L’impact de l’IBDM est mesurable par, entre autres, son niveau de publications : 128 publications au cours des trois dernières années dont 20% avec des IF >10 dans des journaux majeurs (Science, Nature, Neuron, etc..).

l'IBDM a été lauréat de plusieurs prix et appels à projets lancés dans le cadre des Investissements d'avenir (http://www.ibdm.univ-mrs.fr/fr/institut/prix-distinctions-et-bourses).

Le projet INFORM, lauréat de l’appel national « laboratoire d’excellence » (LABEX[3]),  met en place un consortium interdisciplinaire dans le campus de Luminy de l'Université Aix-Marseille, regroupant 12 éuipes de biologie, mathématiques et physique, dont l’IBDM.

Le plateau imagerie optique de l’IBDM fait parti de France BioImaging, infrastructure nationale des investissements d’avenir.

Champs de recherches[modifier | modifier le code]

Le domaine principal de recherche de l'IBDM est l'étude de la biologie du développement et des pathologies[4][5][6] qui y sont associées. La biologie du développement vise à comprendre les mécanismes génétiques et cellulaires qui sont à la base du développement embryonnaire, influençant les processus physiologiques des organismes multicellulaires tout au long de leur vie.

Il s’agit d’une discipline «intégrée», à la croisée de plusieurs disciplines abordées par les différentes équipes de l’IBDM :

Son étude nécessite diverses approches comme :

  • la biologie cellulaire[17]
  • la génétique[18]
  • la biologie moléculaire[19]
  • la génomique[20]
  • l’électrophysiologie[21]
  • la bioinformatique[22]
  • la biophysique

Plates-formes technologiques et services[modifier | modifier le code]

L’IBDM bénéficie de trois plates-formes technologiques :

  • Informatique / Bio-informatique
  • Imagerie (France Bio-Imaging)[23]
  • Animalerie

L'institut compte divers services communs généraux (administration, informatique, communication, logistique, services techniques...).

Directeurs[modifier | modifier le code]

Depuis 2012 : André Le Bivic

2006-2011 : Geneviève Rougon

Accès[modifier | modifier le code]

Le campus est desservi par la ligne 21 ou ligne 24 du bus urbain, arrêt Luminy.

Alumnis chef d’équipe [modifier | modifier le code]

- Patrick Lemaire (CRBM, Montpellier, France)

- Christophe Marcelle (Monash University, Clayton, Australia)

- Olivier pourquié (Harvard University, Cambridge, Massachusetts, USA)

- Geneviève Rougon (INT, Marseille, France)

- Samir Merabet (IGFL, Lyon, France)

- Nicolas Gompel (LMU, Munich, Allemagne)

- Jacques Pradel

- Michel Sémériva

- Denis Thieffry

- Bernard Jacques

Alumnis étudiants / chercheurs à l’IBDM ayant monté leur équipe de recherche[modifier | modifier le code]

- Xavier Morin (IBENS, Paris, France)

- Vincent Bertrand (IBDM, Marseille, France)

- Laurent Kodjabachian (IBDM, Marseille, France)

- Jérome Gros (Pasteur, Paris, France)

- Marie Manceau (CIRB, Paris, France)

- Daniel Sobral (Institut Gulbenkian, Lisbonne, Portugal)

- Sébastien Darras (BIOM, Banyuls-sur-mer, France)

- Yasuo Hitoyoshi (LBDV, Villefranche-sur-mer, France)

- Ute Rothbächer (University of Innsbruck, Innsbruck, Autriche)

- André Nouillon

Notes et références[modifier | modifier le code]

André Le Bivic, Directeur de l’IBDM, lauréat du Prix Jules Martin, née Louise Basset, de l’Académie des sciences, en 2017

Thomas Lecuit titulaire de la nouvelle chaire «Dynamiques du vivant» au Collège de France, en 2016

Thomas Lecuit récompensé par la Fondation Bettencourt-Schueller en 2015

Médaille de bronze CNRS 2014 pour Benjamin Prud'homme

Un chercheur de l'IBDM élu à l'académie des sciences en 2013

Lydia Kerkerian Le Goff reçoit le prix Aimée et Raymond Mande de l’Académie Nationale de Médecine en 2013

Benjamin Prud’homme, lauréat du Prix Claude-Paoletti 2011

  1. ↑ AERES 2016/2017 report on IBDM
  2. ↑ « Luminy | Faculté des Sciences », sur sciences.univ-amu.fr (consulté le )
  3. ↑ (en-US) « Home - LabEx INFORM », sur LabEx INFORM (consulté le )
  4. ↑ Barbara Vacca, Elsa Bazellières, Roqiya Nouar et Akihiro Harada, « Drebrin E depletion in human intestinal epithelial cells mimics Rab8a loss of function », Human Molecular Genetics, vol. 23, no 11,‎ , p. 2834–2846 (ISSN 1460-2083, PMID 24399445, DOI 10.1093/hmg/ddt670, lire en ligne, consulté le )
  5. ↑ Nathalie Caruso, Balàzs Herberth, Marc Bartoli et Francesca Puppo, « Deregulation of the protocadherin gene FAT1 alters muscle shapes: implications for the pathogenesis of facioscapulohumeral dystrophy », PLoS genetics, vol. 9, no 6,‎ , e1003550 (ISSN 1553-7404, PMID 23785297, PMCID PMC3681729, DOI 10.1371/journal.pgen.1003550, lire en ligne, consulté le )
  6. ↑ Xavier Caubit, Paolo Gubellini, Joris Andrieux et Pierre L. Roubertoux, « TSHZ3 deletion causes an autism syndrome and defects in cortical projection neurons », Nature Genetics, vol. 48, no 11,‎ , p. 1359–1369 (ISSN 1546-1718, PMID 27668656, PMCID PMC5083212, DOI 10.1038/ng.3681, lire en ligne, consulté le )
  7. ↑ Matteo Rauzi, Pascale Verant, Thomas Lecuit et Pierre-François Lenne, « Nature and anisotropy of cortical forces orienting Drosophila tissue morphogenesis », Nature Cell Biology, vol. 10, no 12,‎ , p. 1401–1410 (ISSN 1476-4679, PMID 18978783, DOI 10.1038/ncb1798, lire en ligne, consulté le )
  8. ↑ Akankshi Munjal, Jean-Marc Philippe, Edwin Munro et Thomas Lecuit, « A self-organized biomechanical network drives shape changes during tissue morphogenesis », Nature, vol. 524, no 7565,‎ , p. 351–355 (ISSN 1476-4687, PMID 26214737, DOI 10.1038/nature14603, lire en ligne, consulté le )
  9. ↑ Benoît Chevalier, Anna Adamiok, Olivier Mercey et Diego R. Revinski, « miR-34/449 control apical actin network formation during multiciliogenesis through small GTPase pathways », Nature Communications, vol. 6,‎ , p. 8386 (ISSN 2041-1723, PMID 26381333, PMCID PMC4595761, DOI 10.1038/ncomms9386, lire en ligne, consulté le )
  10. ↑ Alexandre Francou, Christopher De Bono et Robert G. Kelly, « Epithelial tension in the second heart field promotes mouse heart tube elongation », Nature Communications, vol. 8,‎ , p. 14770 (ISSN 2041-1723, PMID 28357999, PMCID PMC5379109, DOI 10.1038/ncomms14770, lire en ligne, consulté le )
  11. ↑ René Rezsohazy, Andrew J. Saurin, Corinne Maurel-Zaffran et Yacine Graba, « Cellular and molecular insights into Hox protein action », Development (Cambridge, England), vol. 142, no 7,‎ , p. 1212–1227 (ISSN 1477-9129, PMID 25804734, DOI 10.1242/dev.109785, lire en ligne, consulté le )
  12. ↑ (en) Laurent Fasano, Laurence Röder, Nathalie Coré et Edith Alexandre, « The gene teashirt is required for the development of Drosophila embryonic trunk segments and encodes a protein with widely spaced zinc finger motifs », Cell, vol. 64, no 1,‎ , p. 63–79 (ISSN 0092-8674 et 1097-4172, PMID 1846092, DOI 10.1016/0092-8674(91)90209-H, lire en ligne, consulté le )
  13. ↑ André Le Bivic, « Evolution and cell physiology. 4. Why invent yet another protein complex to build junctions in epithelial cells? », American Journal of Physiology. Cell Physiology, vol. 305, no 12,‎ , C1193–1201 (ISSN 1522-1563, PMID 24025867, DOI 10.1152/ajpcell.00272.2013, lire en ligne, consulté le )
  14. ↑ Myriam Cayre, Sandrine Courtès, Fanny Martineau et Marilyn Giordano, « Netrin 1 contributes to vascular remodeling in the subventricular zone and promotes progenitor emigration after demyelination », Development (Cambridge, England), vol. 140, no 15,‎ , p. 3107–3117 (ISSN 1477-9129, PMID 23824572, DOI 10.1242/dev.092999, lire en ligne, consulté le )
  15. ↑ Katja Burk, Angelique Desoeuvre, Camille Boutin et Martin A. Smith, « Agrin-signaling is necessary for the integration of newly generated neurons in the adult olfactory bulb », The Journal of Neuroscience: The Official Journal of the Society for Neuroscience, vol. 32, no 11,‎ , p. 3759–3764 (ISSN 1529-2401, PMID 22423096, PMCID PMC3313839, DOI 10.1523/JNEUROSCI.4906-11.2012, lire en ligne, consulté le )
  16. ↑ Laurent Arnoult, Kathy F. Y. Su, Diogo Manoel et Caroline Minervino, « Emergence and diversification of fly pigmentation through evolution of a gene regulatory module », Science (New York, N.Y.), vol. 339, no 6126,‎ , p. 1423–1426 (ISSN 1095-9203, PMID 23520110, DOI 10.1126/science.1233749, lire en ligne, consulté le )
  17. ↑ Pierluigi Scerbo, Leslie Marchal et Laurent Kodjabachian, « Lineage commitment of embryonic cells involves MEK1-dependent clearance of pluripotency regulator Ventx2 », eLife, vol. 6,‎ (ISSN 2050-084X, PMID 28654420, PMCID PMC5487210, DOI 10.7554/eLife.21526, lire en ligne, consulté le )
  18. ↑ Nagraj Sambrani, Bruno Hudry, Corinne Maurel-Zaffran et Amel Zouaz, « Distinct molecular strategies for Hox-mediated limb suppression in Drosophila: from cooperativity to dispensability/antagonism in TALE partnership », PLoS genetics, vol. 9, no 3,‎ , e1003307 (ISSN 1553-7404, PMID 23505377, PMCID PMC3591290, DOI 10.1371/journal.pgen.1003307, lire en ligne, consulté le )
  19. ↑ Yannan Fan, Maria Arechederra, Sylvie Richelme et Fabrice Daian, « A Phosphokinome-Based Screen Uncovers New Drug Synergies for Cancer Driven by Liver-Specific Gain of Nononcogenic Receptor Tyrosine Kinases », Hepatology (Baltimore, Md.),‎ (ISSN 1527-3350, PMID 28586114, DOI 10.1002/hep.29304, lire en ligne, consulté le )
  20. ↑ Mihail Sarov, Christiane Barz, Helena Jambor et Marco Y. Hein, « A genome-wide resource for the analysis of protein localisation in Drosophila », eLife, vol. 5,‎ , e12068 (ISSN 2050-084X, PMID 26896675, PMCID PMC4805545, DOI 10.7554/eLife.12068, lire en ligne, consulté le )
  21. ↑ Nicolas Maurice, Martine Liberge, Florence Jaouen et Samira Ztaou, « Striatal Cholinergic Interneurons Control Motor Behavior and Basal Ganglia Function in Experimental Parkinsonism », Cell Reports, vol. 13, no 4,‎ , p. 657–666 (ISSN 2211-1247, PMID 26489458, DOI 10.1016/j.celrep.2015.09.034, lire en ligne, consulté le )
  22. ↑ Roman Prytuliak, Michael Volkmer, Markus Meier et Bianca H. Habermann, « HH-MOTiF: de novo detection of short linear motifs in proteins by Hidden Markov Model comparisons », Nucleic Acids Research,‎ (ISSN 1362-4962, PMID 28460141, PMCID PMC5570144, DOI 10.1093/nar/gkx341, lire en ligne, consulté le )
  23. ↑ « France BioImaging »

Lien externe[modifier | modifier le code]

Site web de l'institut

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