mothur

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mothur est un progiciel open source utilisé pour le traitement de données en bioinformatique[1]. Il est fréquemment utilisé dans l'analyse de l'ADN de microorganismes non cultivés. mothur est capable de traiter les données générées par plusieurs méthodes de séquençage d'ADN, notamment le pyroséquençage 454, l'Illumina HiSeq et MiSeq, la méthode de Sanger, le PacBio et l'IonTorrent[2]. La première publication de mothur a eu lieu en 2009[3] : elle a été annoncée dans un article de la revue Applied and Environmental Microbiology[4]. Au 6 novembre 2019, l'article présentant mothur avait été cité 11 730 fois.

Voir aussi[modifier | modifier le code]

Notes[modifier | modifier le code]

Références[modifier | modifier le code]

  1. Ricke, S.C.; Atungulu, G.G.; Rainwater, C.; Park, S.H. (2017). Food and Feed Safety Systems and Analysis. Elsevier Science. p. 359. ISBN 978-0-12-849888-0. Retrieved June 13, 2018.
  2. (en) Beth N. Orcutt, Jason B. Sylvan et Cara M. Santelli, « Editorial: Recent Advances in Geomicrobiology of the Ocean Crust », Frontiers in Microbiology, vol. 8,‎ (ISSN 1664-302X, DOI 10.3389/fmicb.2017.01368, lire en ligne, consulté le 6 novembre 2019)
  3. (en) D.O. Carter, J.K. Tomberlin, M.E. Benbow et J.L. Metcalf, Forensic Microbiology, , 424 p. (ISBN 978-1-119-06257-8, lire en ligne), p. 180
  4. Patrick D. Schloss, Sarah L. Westcott, Thomas Ryabin et Justine R. Hall, « Introducing mothur: Open-Source, Platform-Independent, Community-Supported Software for Describing and Comparing Microbial Communities », Applied and Environmental Microbiology, vol. 75, no 23,‎ , p. 7537–7541 (ISSN 0099-2240, PMID 19801464, PMCID 2786419, DOI 10.1128/AEM.01541-09, lire en ligne, consulté le 6 novembre 2019)

Articles connexes[modifier | modifier le code]

Liens externes[modifier | modifier le code]