ARNsn U4atac
L’ARNsn U4atac est un petit ARN nucléaire (snRNA ou ARNpn) non codant entrant dans la composition des petites ribonucléoprotéines nucléaires U4atac.
Il est une composante essentielle du splicéosome mineur. Il est indispensable pour l'enlèvement de certains introns des eucaryotes (AT-AC, type-U12)[1].
On pense qu'U4atac s'apparie avec un autre composant du splicéosome mineur, l'ARNsn U6atac par deux régions de structure tige-boucle. On a montré que ces boucles interactives se révélaient être indispensables pour l'épissage in vivo[2]. U4atac contient également un site de liaison en 3' avec la protéine Sm dont a prouvé qu'il était essentiel pour l'activité d'épissage[2].
U4atac est l'analogue fonctionnel de l'ARNsn U4 du splicéosome majeur[2].
L'ARNsn U4atac de la drosophile a une structure tige-boucle supplémentaire en 3' pour une deuxième liaison Sm[3].
Notes et références
[modifier | modifier le code]- (en) Z. Lorkovic, R. Lehner, C. Forstner, A. Bart;, « Evolutionary conservation of minor U12-type spliceosome betweenplants and humans. », RNA, vol. 11, , p. 1095–1107 (PMID 15987817, DOI 10.1261/rna.2440305)
- (en) Shukla GC, Cole AJ, Dietrich RC, Padgett RA;, « Domains of human U4atac snRNA required for U12-dependent splicing invivo. », Nucleic Acids Res, vol. 30, , p. 4650–4657 (PMID 12409455, DOI 10.1093/nar/gkf609)
- (en) Padgett RA, Shukla GC;, « A revised model for U4atac/U6atac snRNA base pairing. », RNA, vol. 8, , p. 125–128 (PMID 11911359, DOI 10.1017/S1355838202017156)
- (en) G. Shukla, R. Padgett, « Conservation of functional features of U6atac and U12 snRNAs betweenvertebrates and higher plants. », RNA, vol. 5, , p. 525–538 (PMID 10199569, DOI 10.1017/S1355838299982213)
