Discussion:Protein Data Bank

Ebauche / Traduction terminées

Bonjour,

La traduction de l'article anglais est finie d'après moi. On peut éventuellement rajouter un paragraphe sur :

• le dépôt de structures
• le Data Uniformity Project

(le texte anglais est resté en commentaire dans la page)

Comme je l'ai deja expliquer dans la page de discussion du portail de la biochimie, on utilise jamais les termes de Banque de donnees des proteines ou de BDP pour designer la Protein Data Bank mais toujours le terme de PDB, ou Protein Data Bank bien entendu. Pour etre plus clair, PDB est un acronyme issu d'un nom propre. D'ailleurs, parle-t-on de Suisse-Proteines? Non, on utilise toujours le nom de Swiss-Prot. Je pense donc qu'il faudra renommer l'article. D'ailleurs, il va poser probleme lorsaue qq1 voudra creer un page sur les banques de donnees de proteines en general. -- Foobar 18 juillet 2006 à 22:16 (CEST)

J'ai légèrement retouchée l'intro. A mon avis, il n'apparaissait pas suffisamment clairement que les données déposées étaient issues de l'expérimentation et qu'il s'agissait très majoritairement de données sur des protéines (99,99%?); D'autre part, je pense que le nom exacte de la PDB doit être en fait the RCSB Protein Data Bank mais tout le monde l'appelle PDB. Je propose donc de renommer l'article, au choix :

• RCSB Protein Data Bank
• Protein Data Bank
• La Banque de données de protéines du RCSB

Personnellement, je pencherait naturellement vers "RCSB Protein Data Bank". Le problème, je pense, concerne les anglicismes sur wikipédia (à éviter au maximum). Donc "Banque de données de protéines du RCSB" (sans "La" pour raison de convention) me semble très bien, les 2 autres noms pouvant sans problème contenir une redirection de façon à ce qu'ils répondent aussi à une recherche de mot-clefs. Elapied 26 juillet 2006 à 10:07 (CEST)

Lien externe mort

Bonjour,

Pendant plusieurs vérifications automatiques, un lien était indisponible. Merci de vérifier si il est bien indisponible et de le remplacer par une version archivée par Internet Archive si c'est le cas. Vous pouvez avoir plus d'informations sur la manière de faire ceci ici. Merci également de vérifier que d'autres liens de l'article ne sont pas morts. Les erreurs rapportées sont :

• http://www.rcsb.org/pdb/BioIT.pdf
  • Dans Banque de données des protéines, le Fri Jan 20 21:25:26 2006, 404 /pdb/BioIT.pdf
  • Dans Banque de données des protéines, le Sat Jan 21 10:59:41 2006, 404 /pdb/BioIT.pdf

▪ Eskimbot ☼ 21 janvier 2006 à 12:14 (CET)

Lien externe mort

Bonjour,

Pendant plusieurs vérifications automatiques, un lien était indisponible. Merci de vérifier si il est bien indisponible et de le remplacer par une version archivée par Internet Archive si c'est le cas. Vous pouvez avoir plus d'informations sur la manière de faire ceci ici. Merci également de vérifier que d'autres liens de l'article ne sont pas morts. Les erreurs rapportées sont :

• http://www.rcsb.org/pdb/pdb_news2003.html#ec_query
  • Dans Banque de données des protéines, le Fri Jan 20 21:25:26 2006, 404 /pdb/pdb_news2003.html
  • Dans Banque de données des protéines, le Sat Jan 21 10:59:41 2006, 404 /pdb/pdb_news2003.html

▪ Eskimbot ☼ 21 janvier 2006 à 12:14 (CET)

Renommage de la page

Salut à tous ! Suite aux discussions en haut de page, le changement de nom a été effectué. Idem pour les redirections. N'hésitez pas si vous avez un commentaire... Elapied 29 juillet 2006 à 20:26 (CEST)

PS:le nom anglophone a été finalement choisi car, après consultation, nombreuses sont les pages techniques de ce type au titre anglophone sur wikipédia. Cette page ne rentre donc pas en contradiction avec l'ensemble des articles. Elapied 29 juillet 2006 à 20:29 (CEST)

C'est parfait! Je pense en effet préférable d'utiliser le nom de Protein Data Bank, quitte a faire ensuite des redicrection depuis RCSB PDB, etc. Merci pour le renommage d'article! -- Foobar 30 juillet 2006 à 02:09 (CEST)

Je suis d'accord. L'article originel avait le titre françisé, et je n'ai pas osé le changer. De toute façon, je n'aurai pas su le faire :) Pmuller_addal 09/11/06

A propos du contenu de la PDB

Dans l'intro de l'article, il est dit que la Protein Data Bank ou PDB est une collection mondiale de données sur la structure tridimensionnelle (ou structure 3D) de macromolécules biologiques : protéines , essentiellement, et acides nucléiques. Or, je n'ai pas souvenance que l'on puisse y deposé autre chose que des protéines. On peut déposé des acides nucléiques mais il faut qu'il y ait une protéine en interaction avec. Pour les structure des acides nucléiques, il y a la NDB. Sur le site de la PDB, il est juste dit que c'est une banque structurale de macromolécules biologiques... Quelqu'un a plus d'info à ce sujet? -- Foobar 15 août 2006 à 15:40 (CEST)

La PDB contient plus de 1000 structures avec seulement de l'ADN (ex: code pdb 1X2O, publié en août 2006).--Pmuller_addal 09/11/06

Liens externes modifiés

Bonjour aux contributeurs,

Je viens de modifier 1 lien(s) externe(s) sur Protein Data Bank. Prenez le temps de vérifier ma modification. Si vous avez des questions, ou que vous voulez que le bot ignore le lien ou la page complète, lisez cette FaQ pour de plus amples informations. J'ai fait les changements suivants :

• L'archive https://web.archive.org/web/20050414031051/http://nar.oupjournals.org/cgi/content/full/28/1/235 a été ajoutée à http://nar.oupjournals.org/cgi/content/full/28/1/235

SVP, lisez la FaQ pour connaître les erreurs corrigées par le bot.

Cordialement.—InternetArchiveBot (Rapportez une erreur) 14 avril 2018 à 13:11 (CEST)