« Épidémiologie évolutive » : différence entre les versions
| Ligne 11 : | Ligne 11 : | ||
=== Évolution de la résistance === |
=== Évolution de la résistance === |
||
L'une des raisons de l'importance de l'évolution des pathogènes est la résistance aux traitements anti-infectieux<ref>{{Ouvrage|langue=français|auteur1=Samuel Alizon|titre=C'est grave docteur Darwin ? : L'évolution, les microbes et nous|lieu=Paris|éditeur=Le Seuil|année=2016|pages totales=|isbn=2021102920|lire en ligne=|passage=}}</ref>. L'évolution de la résistance peut se faire ''de novo'' (lorsqu'une infection causée par une souche sensible au traitement devient résistante) ou par la transmission de souches déjà résistantes. Dans les deux cas, l'épidémiologie joue un rôle central. En retour, le fait d'être résistant modifie la capacité des souches à se propager. |
|||
{{...}} |
|||
Les études combinant épidémiologie et évolution de la résistance ont permis de mettre en évidence le rôle de la structure spatiale<ref>{{Article|prénom1=Florence|prénom2=Thomas|prénom3=Sylvain|nom1=Débarre|nom2=Lenormand|nom3=Gandon|titre=Evolutionary Epidemiology of Drug-Resistance in Space|périodique=PLOS Comput Biol|volume=5|date=2009-04-03|issn=1553-7358|pmid=19343211|pmcid=2658742|doi=10.1371/journal.pcbi.1000337|lire en ligne=http://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1000337|consulté le=2016-05-07|pages=e1000337}}</ref>. Ceci a des implications pour les systèmes de santé car, à nombre de patients équivalents, des grands hôpitaux sont plus susceptibles de faire face à de l'évolution de résistances que des petits hôpitaux<ref>{{Article|prénom1=Roger D.|prénom2=Pia Abel zur|prénom3=Sebastian|nom1=Kouyos|nom2=Wiesch|nom3=Bonhoeffer|titre=On Being the Right Size: The Impact of Population Size and Stochastic Effects on the Evolution of Drug Resistance in Hospitals and the Community|périodique=PLOS Pathog|volume=7|date=2011-04-14|issn=1553-7374|pmid=21533212|pmcid=3077359|doi=10.1371/journal.ppat.1001334|lire en ligne=http://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1001334|consulté le=2016-05-07|pages=e1001334}}</ref>. |
|||
=== Évolution de la virulence === |
=== Évolution de la virulence === |
||
{{...}} |
{{...}} |
||
Version du 7 mai 2016 à 13:06
La mise en forme de cet article est à améliorer ().
La mise en forme du texte ne suit pas les recommandations de Wikipédia : il faut le « wikifier ».
L'épidémiologie évolutive, selon un terme introduit par Paul Ewald[1], consiste à analyser de concert l'évolution et la propagation des agents infectieux[2].
Elle est motivée par les vitesses d'évolution rapide de nombreux parasites (virus et bactéries notamment) qui font que les échelles des temps épidémiologiques et évolutifs se superposent. Cette approche est liée à celle de l'écologie évolutive.
L'épidémiologie détermine les pressions de sélection agissant sur les pathogènes (par exemple l'utilisation d'antibiotiques va sélectionner l'évolution de résistances). En retour, l'évolution des pathogènes affecte la manière dont ils se propagent (une souche résistante se propage mieux dans un environnement riche en antibiotiques).
Évolution adaptative
L'évolution des pathogènes peut modifier leur propagation si elle est adaptative ou délétère, c'est-à-dire si elle modifie des traits d'histoire de vie d'une infection pour augmenter ou diminuer la valeur sélective des pathogènes.
Évolution de la résistance
L'une des raisons de l'importance de l'évolution des pathogènes est la résistance aux traitements anti-infectieux[3]. L'évolution de la résistance peut se faire de novo (lorsqu'une infection causée par une souche sensible au traitement devient résistante) ou par la transmission de souches déjà résistantes. Dans les deux cas, l'épidémiologie joue un rôle central. En retour, le fait d'être résistant modifie la capacité des souches à se propager.
Les études combinant épidémiologie et évolution de la résistance ont permis de mettre en évidence le rôle de la structure spatiale[4]. Ceci a des implications pour les systèmes de santé car, à nombre de patients équivalents, des grands hôpitaux sont plus susceptibles de faire face à de l'évolution de résistances que des petits hôpitaux[5].
Évolution de la virulence
Évasion immunitaire
Phylodynamique
Émergence évolutive
Notes et références
- (en) Ewald, P.W. (Dep. Biol., Amherst College, Amherst, MA 01002 (USA)), « Cultural vectors, virulence, and the emergence of evolutionary epidemiology », Oxford Surveys in Evolutionary Biology (UK), (lire en ligne, consulté le )
- Olivier Restif, « Evolutionary epidemiology 20 years on: Challenges and prospects », Infection, Genetics and Evolution, vol. 9, , p. 108–123 (DOI 10.1016/j.meegid.2008.09.007, lire en ligne, consulté le )
- Samuel Alizon, C'est grave docteur Darwin ? : L'évolution, les microbes et nous, Paris, Le Seuil, (ISBN 2021102920)
- Florence Débarre, Thomas Lenormand et Sylvain Gandon, « Evolutionary Epidemiology of Drug-Resistance in Space », PLOS Comput Biol, vol. 5, , e1000337 (ISSN 1553-7358, PMID 19343211, PMCID 2658742, DOI 10.1371/journal.pcbi.1000337, lire en ligne, consulté le )
- Roger D. Kouyos, Pia Abel zur Wiesch et Sebastian Bonhoeffer, « On Being the Right Size: The Impact of Population Size and Stochastic Effects on the Evolution of Drug Resistance in Hospitals and the Community », PLOS Pathog, vol. 7, , e1001334 (ISSN 1553-7374, PMID 21533212, PMCID 3077359, DOI 10.1371/journal.ppat.1001334, lire en ligne, consulté le )
