Aller au contenu

Cytochrome oxydase

Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre.

La cytochrome oxydase désigne un gène mitochondrial. L'enzyme est une allozyme, montrant une grande variabilité génétique.

Cytochrome oxydase de type I

[modifier | modifier le code]

Le cytochrome oxydase I (COI) est le gène utilisé en routine pour le barcoding et le métabarcoding des animaux[1].

Cytochrome oxydase de type II

[modifier | modifier le code]

Primers de PCR[2].

  • C2-J-3279 (5'-GGT CAA ACA ATT GAG TCT ATT TGA AC-3')
  • C2-N-3494 (5'-GGT AAA ACT ACT CGA TTA TCA AC-3')

Pour l'amplification d'un fragment de 214 bp du gène de la cytochrome oxydase II (COII).


Références

[modifier | modifier le code]
  1. (en) Eric Coissac, Tiayyba Riaz et Nicolas Puillandre, « Bioinformatic challenges for DNA metabarcoding of plants and animals », Molecular Ecology, vol. 21, no 8,‎ , p. 1834–1847 (ISSN 1365-294X, DOI 10.1111/j.1365-294X.2012.05550.x, lire en ligne, consulté le )
  2. Simon C. et al., 1994
  • Simon C, Fratti F, Beckenbach A, Crespi B, Liu H et Flook P, 1994. Evolution, weighting, and phylogenetic utility of mitochondrial gene sequences and a compilation of conserved polymerase chain reaction primers. Ann. Entomol. Soc. Am. 87:651–701.

Articles connexes

[modifier | modifier le code]