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Cytochrome oxydase

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La cytochrome oxydase est un gène mitochondrial. C'est un allozyme, montrant une grande variabilité génétique.

Cytochrome oxydase de type I

Le cytochrome oxydase I (COI) est le gène utilisé en routine pour le barcoding et le métabarcoding des animaux[1].

Cytochrome oxydase de type II

Primers de PCR[2].

  • C2-J-3279 (5'-GGT CAA ACA ATT GAG TCT ATT TGA AC-3')
  • C2-N-3494 (5'-GGT AAA ACT ACT CGA TTA TCA AC-3')

Pour l'amplification d'un fragment de 214 bp du gène de la cytochrome oxydase II (COII).


Références

  1. ↑ (en) Eric Coissac, Tiayyba Riaz et Nicolas Puillandre, « Bioinformatic challenges for DNA metabarcoding of plants and animals », Molecular Ecology, vol. 21, no 8,‎ , p. 1834–1847 (ISSN 1365-294X, DOI 10.1111/j.1365-294X.2012.05550.x, lire en ligne, consulté le )
  2. ↑ Simon C. et al., 1994
  • Simon C, Fratti F, Beckenbach A, Crespi B, Liu H et Flook P, 1994. Evolution, weighting, and phylogenetic utility of mitochondrial gene sequences and a compilation of conserved polymerase chain reaction primers. Ann. Entomol. Soc. Am. 87:651–701.

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