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Version du 20 janvier 2024 à 18:53
| Domaines | Génétique |
|---|---|
| Institutions | University of California, Santa Cruz |
| Directeur de thèse | Huntington Willard |
| Renommé pour | Telomere to Telomere Project (T2T) |
| Site | https://www.migalab.com/ |
Karen Elizabeth Hayden Miga est une généticienne américaine qui dirige le consortium Telomere-to-Telomore (T2T) ayant publié l'assemblage complet du génome humain en mars 2022[1]. Elle est professeur adjoint de génie biomoléculaire à l'Université de Californie à Santa Cruz et directrice associée de la pangénomique humaine au UC Santa Cruz Genomics Institute. Elle a été nommée « One to Watch » dans le Nature's 10 2020 et l'une des personnes les plus influentes du d'après le Time 100 de 2022[2].
Recherche et carrière
En 2012, Miga rejoint le laboratoire de David Haussler à l'Université de Californie à Santa Cruz [3]. À l'UCSC, elle a combiné des approches informatiques et expérimentales[4]. Là, elle dirige le consortium télomère à télomère (T2T)[4],[5], un effort communautaire qui cherche à séquencer et assembler entièrement le génome humain[5]. Ses efforts de recherche utilisent des stratégies de séquençage à lecture longue[5],[6]. Elle utilise le séquenceur MinION d'Oxford Nanopore Technologies, qui analyse un brin d'ADN en détectant les changements dans le flux de courant lorsque l'ADN traverse les nanopores d'une membrane[6].
Miga est la directrice de Human Pangenome Production Center un projet visant à contribuer à la prochaine carte de référence du pangénome humain grâce à la création de 350 génomes diploïdes T2T[5],[7]. Cette carte soutiendra le développement de thérapies personnalisées[5].
En 2022, Miga a participé à la séance plénière de clôture de la réunion de la Clinton Global Initiative[8], où elle a discuté de l'avenir de la recherche génomique équitable avec l'ancien président Bill Clinton, le chanteur de U2 Bono et le directeur général de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) Tedros Ghebreyesus . En 2023, Karen Miga a été nommée Searle Scholar 2023[9] pour étudier les régions hétérochromatiniennes inexplorées du génome humain.
Publications sélectionnées
- (en) Miga, Koren, Rhie et Vollger, « Telomere-to-telomere assembly of a complete human X chromosome », Nature, vol. 585, no 7823, , p. 79–84 (PMID 32663838, PMCID 7484160, DOI 10.1038/s41586-020-2547-7, Bibcode 2020Natur.585...79M)
- Chimpanzee Sequencing Analysis Consortium, « Initial sequence of the chimpanzee genome and comparison with the human genome », Nature, vol. 437, no 7055, , p. 69–87 (ISSN 0028-0836, PMID 16136131, DOI 10.1038/nature04072, Bibcode 2005Natur.437...69.)
- (en) Rosenbloom, Armstrong, Barber et Casper, « The UCSC Genome Browser database: 2015 update », Nucleic Acids Research, vol. 43, no D1, , D670–D681 (ISSN 0305-1048, PMID 25428374, PMCID 4383971, DOI 10.1093/nar/gku1177, lire en ligne)
- (en) Jain, Koren, Miga et Quick, « Nanopore sequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads », Nature Biotechnology, vol. 36, no 4, , p. 338–345 (ISSN 1546-1696, PMID 29431738, PMCID 5889714, DOI 10.1038/nbt.4060)
Références
- (en) « Researchers generate the first complete, gapless sequence of a human genome », Genome.gov (consulté le )
- Doudna, Jennifer (May 23, 2022). "The 100 Most Influential People of 2022: Michael Schatz, Karen Miga, Evan Eichler, and Adam Phillippy". Time. Retrieved 2023-10-18.
- « Speaker - Cell Symposia: 20 Years of the Human Genome: from Sequence to Substance », www.cell-symposia.com (consulté le )
- (en-US) Isenberg, « Are we there yet? Karen Miga on the Next Era of Genomics », Santa Cruz Tech Beat, (consulté le )
- « Karen Miga | VIB Conferences », www.vibconferences.be (consulté le ) Erreur de référence : Balise
<ref>incorrecte : le nom « :1 » est défini plusieurs fois avec des contenus différents. - (en) « Scientists achieve first complete assembly of human X chromosome », EurekAlert! (consulté le )
- (en) « Dawn of good, fast and cheap human genome assembly », ScienceDaily (consulté le )
- "Karen Miga discusses the future of equitable genomics research with Clinton, Bono" . news.ucsc.edu. Retrieved 2023-11-1
- SEARLE SCHOLARS PROGRAM NAMES 15 SCIENTISTS AS SEARLE SCHOLARS FOR 2023. searlescholars.org. Retrieved 2023-11-1.