En alchimie, un homoncule est une réplique d'un être humain créé par l'alchimie.
Dans la religion catholique, un homoncule est un petit homme ailé qui vient du Ciel porteur de l'Esprit de Jésus pour aller l'implanter dans le ventre de Marie. Cette conception est considérée comme hérétique depuis le concile de Trente.
Dans Les Grandes Blondes, roman de Jean Echenoz (1995), un homoncule, nommé Béliard, se perche par intermittence sur l'épaule de Gloria Stella, l'héroïne du récit.
Dans le récit les compte de Spipou et Barné[réf. nécessaire], homoncule désigne un homme qui fraternise par derrière avec un nain déguisé en chèvre qui tient une poule